Presidente de la República: Álvaro Uribe en funciones desde las elecciones presidenciales de 2002.

• 1 de enero: Entra en vigencia el acuerdo de libre comercio entre la Comunidad Andina de Naciones (CAN) y el Mercado Común del Sur.^[1]​

• 4 de enero: La captura de Rodrigo Granda en Venezuela causa una crisis diplomática sin precedentes. Las FARC-EP afirman que funcionarios venezolanos y estadounidenses están involucrados.^[2]​

• 6 de enero: El ministro de Defensa de Colombia, Jorge Alberto Uribe, asegura que la captura de Granda "fue realizada en exclusiva por nuestros efectivos y en territorio colombiano", mientras que la diputada venezolana Iris Varela dice que Granda fue secuestrado en Caracas, en complicidad con funcionarios y exfuncionarios de autoridades policiales venezolanas.^[2]​

• 12 de enero: El gobierno colombiano reconoce haber pagado una recompensa por informaciones que permitieron la captura de Granda en territorio colombiano. El diputado venezolano Luis Tascón, cree que Colombia entregó US$1,5 millones a quienes raptaron a Granda. El senador colombiano Jimmy Chamorro, pidió explicaciones al gobierno de Venezuela de qué hacía Granda en dicho país.^[2]​

• 13 de enero:
  • el gobierno de Hugo Chávez llama a consultas a su embajador en Colombia, Carlos Santiago Ramírez. Mientras que el vicepresidente venezolano, José Vicente Rangel, califica de "grave" y de "secuestro" el Caso Rodrigo Granda.^[2]​
  • 13 de enero- 6 de febrero: Campeonato Sudamericano de Fútbol Sub-20 de 2005, ganado por Colombia.^[3]​

• 14 de enero: El presidente venezolano Hugo Chávez, anuncia la suspensión de los vínculos comerciales con Colombia hasta que se ofrezca una disculpa formal por lo que denomina una violación de la soberanía de su país. Suspende el Gasoducto Transcaribeño. El presidente colombiano Álvaro Uribe en respuesta mencionó que "El pueblo colombiano tiene derecho de librarse de la pesadilla del terrorismo" y que "la Organización de Naciones Unidas prohíbe a los países miembros albergar a terroristas de manera activa o pasiva".^[4]​

• 15 de enero: Uribe, invita a Hugo Chávez a realizar una cumbre de mandatarios para tratar la crisis por el caso Granda, y discutir asuntos de seguridad y de la lucha contra el terrorismo.^[2]​

• 16 de enero: Chávez rechaza la propuesta de Uribe, y afirma que no está dispuesto a conversar hasta tanto no haya una disculpa pública por parte del presidente colombiano. El gobierno de Colombia acusa a Venezuela de haber protegido a Rodrigo Granda. El gobierno colombiano dice que entregará a Venezuela las pruebas sobre la protección que empleados oficiales le otorgaban a Rodrigo Granda y que dará el nombre de siete guerrilleros de las FARC-EP y la localización de varios campamentos en Venezuela.^[2]​

• 17 de enero: Jesse Chacón, ministro del Interior de Venezuela, dice que Colombia no dio una recompensa por información que llevó a la captura de Granda, sino que pagó un secuestro sobornando a guardias venezolanos.^[2]​

• 18 de enero: Uribe, señala en una entrevista que "el problema de Colombia y de mi gobierno no es con Venezuela, sino con las FARC-EP ".^[2]​

• 20 de enero: Colombia envía a Venezuela la lista con los nombres de siete rebeldes de las FARC-EP que supuestamente se esconden en Venezuela. El gobierno de Luiz Inácio Lula da Silva se ofrece como "facilitador" para solucionar el altercado diplomático entre Colombia y Venezuela.^[2]​

• 22 de enero: Perú envía un representante a Colombia para la crisis, el gobierno de Estados Unidos emitió un comunicado: "profundamente preocupado" por la crisis entre Colombia y Venezuela.^[2]​

• 23 de enero: Venezuela reitera que las relaciones de su país con Colombia no mejorarían mientras el gobierno del presidente Uribe no diera disculpas por la detención de Granda.^[2]​

• 26 de enero: Las FARC-EP atacaron la cárcel de Picaleña en Ibagué, Tolima y ayudan a escapar a guerrilleros presos.

• 29 de enero: Colombia dice en un comunicado disposición para revisar los hechos para que si han resultado inconvenientes ante Venezuela, no vuelvan a ocurrir y anunciaba una visita del presidente Uribe al presidente Chávez. Después de estas declaraciones, el gobierno venezolano dio a entender que consideraba superada la crisis diplomática.^[2]​

• 1 de febrero: Las FARC-EP asesinan a 17 Infantes de Marina de la Armada de Colombia, en el municipio de Iscuandé (Nariño).^[5]​

• 3 de febrero: El encuentro entre los presidentes Uribe y Chávez fue suspendido después que Uribe fuera ingresado al Hospital Naval de Cartagena por problemas gastrointestinales y laberintitis.^[6]​

• 9 de febrero Las FARC-EP atacan y asesinan a 19 policías en inmediaciones de Mutatá, en la región del Urabá (Antioquia).^[5]​

• 15 de febrero: Se reúnen en Caracas, Venezuela, los presidentes Uribe y Chávez con el fin de poder reconciliarse ante la crisis diplomática por el Caso Rodrigo Granda.^[7]​

• 16 de febrero:Combates en Vista Hermosa (Meta): Mueren 30 guerrilleros de las FARC-EP y 5 militares.

• 18 de febrero: Fue capturado Luis Alberto Toro, alias El Guajiro, jefe de una banda de atracadores y quien disparó contra Luis Fernando Montoya, exentrenador del equipo de fútbol Once Caldas, campeón de la Copa Libertadores de América 2004, cuando pretendía salir rumbo a Ecuador.

• 21 de febrero: Paramilitares de las Autodefensas Unidas de Colombia (AUC) (y supuestamente miembros del Ejército) perpetran la masacre de San José de Apartadó, en la vereda Mulatos Medios, corregimiento de San José de Apartadó (Antioquia) y en la vereda La Resbalosa, municipio de Tierralta (Córdoba). Fueron asesinados 3 niños y 5 adultos entre hombres y mujeres.^[8]​

• 10 de marzo: Omaira Rojas Cabrera o "Sonia", comandante de las FARC-EP , es extraditada a Estados Unidos por narcotráfico.^[9]​

• 22 de mayo: El DANE inició el censo de población en todo el territorio nacional.
• 25 de mayo: La Columna Móvil Teófilo Forero de las FARC-EP, atacó el Concejo Municipal de Puerto Rico (Caquetá) y asesina a 5 funcionarios del estado.

• Clara López Obregón, dirigente del Polo Democrático Alternativo (PDA) denunció la presunta vinculación de congresistas con las Autodefensas Unidas de Colombia (AUC), tras la afirmación de Salvatore Mancuso en la que afirmó que un 35 por ciento del Congreso de la República de Colombia eran amigos de su organización.^[10]​

• 25 de junio: El Frente 48 de las FARC-EP combate contra tropas del Batallón Plan Energético y Vial No.1 en la Base militar de Teteyé:19 militares muertos, 11 fueron heridos, un secuestrado.^[11]​

• Ataque del Frente 33 de las FARC-EP en la zona rural de Bucarasica (Norte de Santander):6 militares muertos, 3 heridos.

• 20 de julio: día de la independencia de los 195 años de fundación de Colombia

• 1 de agosto: Ataque con explosivos de las FARC-EP en el norte de Valledupar deja 14 policías muertos.

• 16 de agosto: Un avión colombiano operado por West Caribbean Airways, volando de Panamá con destino a la isla de Martinique, se estrella en una región remota de Venezuela. 160 pasajeros murieron.^[12]​

• 24 de agosto: Muerte del cantautor vallenato Kaleth Morales en Cartagena de Indias.^[13]​

• 12 de octubre: La Selección de fútbol de Colombia queda eliminado por segunda vez consecutiva de la clasificación para la Copa Mundial de Futbol de 2006 tras ganarle a Paraguay por 1 a 0.

• 19 de octubre: la Corte Constitucional Aprobó la reelección presidencial que permitió al presidente Álvaro Uribe aspirar a un segundo mandato.^[14]​

• 3 de diciembre: Las FARC-EP asesina al exsenador Jaime Lozada mientras su esposa, Gloria Polanco permanece secuestrada.

• 7 de diciembre: 19 personas murieron y otras 25 resultaron heridas al caer a un abismo un bus de servicio intermunicipal, que viajaba entre Bogotá y Pensilvania (Caldas). El accidente se registró entre Petaqueros y Pensilvania. El bus trató de esquivar a otro vehículo que venía en contravía.

• 9 de diciembre: El cantante Juanes hace su presentación en el Sorteo de la Copa Mundial de Fútbol de 2006 celebrado en la ciudad de Leipzig con su tema La camisa negra.

• 15 de diciembre: El presidente Uribe acepta un ofrecimiento de la "Comisión Internacional" integrada por España, Francia y Suiza, para negociar el intercambio humanitario en los municipios de Pradera y Florida (Valle del Cauca). La explosión de una bomba en la Universidad Militar en Bogotá hace cambiar de parecer al gobierno.^[15]​^[16]​

• 17 de diciembre: En el caserío de San Marino, (Chocó), las FARC-EP asesinaron a ocho policías y secuestran a 30. Son liberados tres días más tarde.^[5]​

• 17 de diciembre: El presidente venezolano Hugo Chávez y el colombiano Álvaro Uribe se reúnen en Santa Marta, Colombia por la conmemoración de los 175 años de la muerte del Libertador Simón Bolívar y planes energéticos conjuntos.^[7]​

• 27 de diciembre: Las FARC-EP intentan organizar una reunión para enero de 2006 con delegados de Francia, Suiza y España, para conocer la propuesta de negociación presentada por esos países para negociar el intercambio humanitario. El Gobierno aceptó la iniciativa.^[5]​

• 28 de diciembre: En el corregimiento de Playa Rica, municipio de Vistahermosa,(Meta), las FARC-EP atacó un grupo de soldado que patrullaba la erradicación de cultivos ilícitos. 24 soldados y cinco guerrilleros murieron.^[5]​

• Anexo:Cronología de Colombia