Presidente de la República: Álvaro Uribe en funciones desde las elecciones presidenciales de 2002. Reelegido en las elecciones presidenciales de 2006

• 17 de febrero: Abatido Giovanny Santamaría "Rubén" de las FARC-EP por el Ejército Nacional envuelto en el secuestro y muerte de Guillermo Gaviria y Gilberto Echeverri.^[1]​

• 24 de febrero: el empresario y político conservador antioqueño Pedro Juan Moreno y tres personas más pierden la vida al estrellarse el helicóptero en que viajaban. El siniestro ocurrió en inmediaciones del municipio de Mutatá, en la región de Urabá.

• 27 de febrero: Sabotaje de la Columna Móvil Teófilo Forero de las FARC-EP a las Elecciones presidenciales de Colombia de 2006, nueve concejales fueron masacrados en Rivera mientras sesionaban en un hostal ubicado en el casco urbano del municipio de Rivera . Capturado al concejal del municipio Gil Trujillo Quintero, acusado de ser miembro de la Columna Móvil Teófilo Forero y de colaborar con información necesaria para realizar el ataque.^[2]​

• 27 de abril: la Columna Móvil Teófilo Forero de las FARC-EP secuestró y asesinó a Liliana Gaviria Trujillo, hermana del expresidente César Gaviria, en Dosquebradas, Risaralda.^[3]​

• 10 de mayo: Después de un largo proceso la corte constitucional despenalizó el aborto en condiciones excepcionales: cuando el feto tiene mal formaciones o la mujer es violada.

• 22 de mayo: El Batallón de Alta Montaña del Ejército Nacional, comandado por el coronel Byron Carvajal comete la Masacre de Jamundí (Valle del Cauca).

• 28 de mayo: se llevan a cabo las elecciones presidenciales de Colombia de 2006, Álvaro Uribe es reelecto como presidente, junto a su vicepresidente Francisco Santos con 7.397.835 votos.

• 25 de junio: El Deportivo Pasto se corona campeón por primera vez en su historia tras derrotar al Deportivo Cali por un marcador global de 2 goles por 1

• 8 de julio: El presidente venezolano Hugo Chávez y el presidente panameño Martín Torrijos realizan una ceremonia que da comienzo a las obras del Gasoducto Transcaribeño desde la Base militar El Tigre, en Venezuela y que atravesará Colombia hasta llegar a Panamá. Chávez reafirma que "ni apoya ni apoyará movimientos armados en Colombia" ^[4]​

• 9 de julio: La cantante Shakira interpreta al lado del rapero haitiano Wyclef Jean el éxito Hips don't lie (versión Bamboo) en la ceremonia de clausura de la Final de la Copa Mundial de Fútbol de 2006 en el Estadio Olímpico de Berlín Alemania.

• 20 de julio: El presidente Álvaro Uribe instala el nuevo Congreso para el periodo 2006-2010.

• 7 de agosto: Toma posesión para un segundo período como presidente, Álvaro Uribe Vélez.^[5]​

• 16 de agosto: Estreno nacional de la novela televisiva Sin tetas no hay paraíso (serie de televisión)

• 20 de diciembre: El Cúcuta Deportivo campeón del fútbol profesional Colombiano tras derrotar en Ibagué al Deportes Tolima con un marcador global de 2 goles por 1.
• 31 de diciembre: El exministro Fernando Araújo Perdomo escapa del secuestro de las FARC-EP .^[5]​

• Anexo:Cronología de Colombia