Durante la historia japonesa se han descrito diversas clases de buques pertenecientes al servicio de marina nacional. Los primeros navíos gubernamentales fueron hechos en el siglo XVI con el advenimiento de la era Sengoku, una era de guerras y la posterior era Azuchi-Momoyama, que fue un período de crecimiento comercial; no obstante, durante la era Tokugawa se impone el sakoku o "aislamiento del resto del mundo" y se desmantelan las naves grandes que recorrían los mares.
Posteriormente, con el período bakumatsu, el sakoku es eliminado y Japón moderniza sus navíos, y la Armada Imperial Japonesa es conformada de manera oficial en 1869, posteriormente estas naves tendrían una participación destacada en las guerras contra Rusia y China y posteriormente en la Primera Guerra Mundial y la Segunda Guerra Mundial. La derrota de Japón en esta última conlleva a la disolución de la Armada Imperial Japonesa en 1947.
Este es un listado de los buques de la Armada Imperial Japonesa, desde sus orígenes hasta su disolución tras la Segunda Guerra Mundial.
Submarinos de Primera clase
Submarinos de Segunda clase
Submarinos de Tercera clase
Otros