Haplogrupo_S_(ADN-Y) Knowpia

En genética humana, el haplogrupo S es un haplogrupo del ADN del cromosoma Y, característico de Oceanía, por lo que es común tanto en los nativos de Australia como en los de Melanesia y demás islas del Pacífico. Deriva del haplogrupo MS, y como tal está definido por el marcador P405^[1] y B254. Hasta hace poco S se definió por el marcador M230, pero este queda ahora como un subclado.

S (P405) también es llamado K-P405^[2] o K2b1a,^[3] y se habría originado probablemente en Insulindia hace unos 44 mil años.^[2]

Subclados

Zona de distribución del haplogrupo S-M230 del ADN-Y.

Las frecuencias más importantes son las siguientes:

Rama S-M230

S1 (M230) es el clado de S más frecuente en Melanesia y el más estudiado. Tiene un origen probable en Nueva Guinea hace 28.000 a 41.000 años.^[4]

Según Kayser et al.2003,^[5] S (M230) es característico de la región Melanesia y es predominante en la zona montañosa de Papúa Nueva Guinea, con frecuencias del 52%; en las costas de este país encuentra 16%, en las islas Molucas 21%, en los tolái de Nueva Bretaña 12,5% y en islas menores de la Sonda 10%.

Es importante en parte de las islas menores de la Sonda (Indonesia oriental), presentando en Lembata 34%, Sumba 16%, Pantar 15%, Timor 8%, Flores 8% y Alor 7%.^[6]

Frecuencias menores se encuentran en Malaita (Islas Salomón) con 8%^[7] y poco en Nueva Guinea Occidental, salvo en la zona de lagos Paniai donde se encontró 74%.^[8] En Vanuatu se encontró 9%, en Célebes 5%, en Nueva Bretaña 4% y en Filipinas 4%.^[6]

S-P60

Previamente se reportó como K* y con una frecuencia de 42% en aborígenes australianos.^[9] Según otros datos, en Australia se encontró 30% en Tierra de Arnhem y 17% en Gran Desierto Arenoso.^[10]

Distribución por subclados

Según la filogenia más reciente (2014),^[11] los subclados del haplogrupo S son los siguientes:

Haplogrupo S o K2b1a (P405/F3744, B254):

S* o K-P405* o K2b1a*: En Micronesia un 6%. En Selangor (Malasia).^[12]
S1 (B255)
- S1*: Encontrado en restos en Australia.^[12]
- S1a (Z41335, Y26122)
  - S1a*: Encontrado en restos en Australia.^[12]
  - S1a1 (Z42413)
    - S1a1*: Encontrado en restos en Australia.^[12]
    - S1a1a (Z41513): En Australia.
      - S1a1a1 o K2b1a1 (P60, P308, P304): Antes K1, K2 o K4. Es el haplogrupo más importante entre los aborígenes australianos después de C1.^[13]
    - S1a1b (M230, P202, P204): Es típico de la región de Melanesia, en especial en Papúa Nueva Guinea, en donde coincide con la zona de mayor diversidad en las lenguas papúes. Previamente fue denominado K5, renombrado S por Karafet et al (2008)^[14] y S1 por van Oven et al (2014).
      - S1a1b1 (M254) Común en Melanesia y Este de Indonesia, encontrándose 10.5% en las Islas menores de la Sonda.^[8]
        S-M226: Poco en las islas del Almirantazgo y costas de Papúa Nueva Guinea.
  - S1a2 (Z41767)
    - S1a2a o K2b1a2 (P79, P307, P299): Antes K2, K3 o K6. Propio de Melanesia, con 14%^[15] Polinesia^[16] y Micronesia. En Papúa Nueva Guinea incluye a Nueva Bretaña con un 23%^[4] y en disperso en las demás islas de PNG como las islas del Almirantazgo.
  - S1a3 (FGC36892) Aborígenes de Australia
- S1b (B275): En Filipinas
- S1c
- S1d (SK1806): En Papua New Guinea, Indonesia y Vanuatu.
- K-P315 o K2b1a3: Típico de Melanesia.^[13]
S2 (P378) En Filipinas (pueblo aeta)^[17] con una frecuencia del 60%.^[6]
S3 (P336) Poco en Indonesia, particularmente en Alor 26% y Borneo 5.8%.^[6]
S4 (BY22870) En Filipinas.

Haplogrupos del cromosoma Y humano

Adán cromosómico

A

BT

B

CT

DE

CF

D

E

C

F

C1

C2

G

H

IJK

IJ

K

I

J

LT

K2

L

T

MS

P

NO

M

S

Q

R

N

O

R1

R2

R1a

R1b

Referencias

↑ van Oven M et al 2014.Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. (versión 10-Jun-2014)
↑ ^a ^b YFull Experimental YTree v2.21 1000 Genomes Project © HGDP Project.
↑ Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics , (4 June 2014) | doi:10.1038/ejhg.2014.106
↑ ^a ^b Laura Scheinfeldt, Françoise Friedlaender, Jonathan Friedlaender, Krista Latham, George Koki, Tatyana Karafet, Michael Hammer and Joseph Lorenz, "Unexpected NRY Chromosome Variation in Northern Island Melanesia," Molecular Biology and Evolution 2006 23(8):1628-1641
↑ Kayser M, Brauer S, Weiss G, Schiefenho¨vel W, Underhill P, Shen P, Oefner P, Tommaseo-Ponzetta M, Stoneking (2003) Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea Am J Hum Genet 72:281–302
↑ ^a ^b ^c ^d Karafet, T., Mendez, F., Sudoyo, H. et al. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. Eur J Hum Genet 23, 369–373 (2015). https://doi.org/10.1038/ejhg.2014.106
↑ Murray P. Cox y Marta Mirazón Lahr (2006) Y-Chromosome Diversity Is Inversely Associated With Language Affiliation in Paired Austronesian- and Papuan-Speaking Communities from Solomon Islands. American Journal of Human Biology 18:35–50 2006
↑ ^a ^b Stefano Mona et al 2007, Patterns of Y-Chromosome Diversity Intersect with the Trans-New Guinea Hypothesis
↑ Hammer M et al. 2006 Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes.
↑ Kayser M et al. 2006, Melanesian and Asian Origins of Polynesians: mtDNA and Y Chromosome Gradients Across the Pacific. Molecular Biology and Evolution 23(11):2234–2244. (2006) doi:10.1093/molbev/msl093
↑ van Oven M et al 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191. doi:10.1002/humu.22468. phylotree
↑ ^a ^b ^c ^d S Haplogroup YTree 2012-2020 YFull
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↑ Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008
↑ Y-DNA Haplogroup K and its Subclades. ISOGG, rev. 2014
↑ Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)
↑ Y-DNA Haplogroup S and its Subclades - 2019-2020 ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree

Enlaces externos

en:Y-DNA haplogroups in Oceanian populations

Datos: Q428836
Multimedia: Haplogroup S of Y-DNA / Q428836

[1] van Oven M et al 2014.Minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. (versión 10-Jun-2014)

[YFull-2] YFull Experimental YTree v2.21 1000 Genomes Project © HGDP Project.

[3] Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics , (4 June 2014) | doi:10.1038/ejhg.2014.106

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[5] Kayser M, Brauer S, Weiss G, Schiefenho¨vel W, Underhill P, Shen P, Oefner P, Tommaseo-Ponzetta M, Stoneking (2003) Reduced Y-Chromosome, but Not Mitochondrial DNA, Diversity in Human Populations from West New Guinea Am J Hum Genet 72:281–302

[Karafet15-6] Karafet, T., Mendez, F., Sudoyo, H. et al. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. Eur J Hum Genet 23, 369–373 (2015). https://doi.org/10.1038/ejhg.2014.106

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[Mona-8] Stefano Mona et al 2007, Patterns of Y-Chromosome Diversity Intersect with the Trans-New Guinea Hypothesis

[9] Hammer M et al. 2006 Dual origins of the Japanese: common ground for hunter-gatherer and farmer Y chromosomes.

[10] Kayser M et al. 2006, Melanesian and Asian Origins of Polynesians: mtDNA and Y Chromosome Gradients Across the Pacific. Molecular Biology and Evolution 23(11):2234–2244. (2006) doi:10.1093/molbev/msl093

[11] van Oven M et al 2014. Seeing the wood for the trees: a minimal reference phylogeny for the human Y chromosome. Hum Mutat 35(2):187-191. doi:10.1002/humu.22468. phylotree

[yfull20-12] S Haplogroup YTree 2012-2020 YFull

[Karafet14-13] Tatiana M Karafet et al 2014. Improved phylogenetic resolution and rapid diversification of Y-chromosome haplogroup K-M526 in Southeast Asia. European Journal of Human Genetics. ISSN 1018-4813 EISSN 1476-5438

[Karafet-14] Karafet et al. (2008), Abstract New Binary Polymorphisms Reshape and Increase Resolution of the Human Y-Chromosomal Haplogroup Tree, Genome Research, DOI: 10.1101/gr.7172008

[ISOGG-15] Y-DNA Haplogroup K and its Subclades. ISOGG, rev. 2014

[Kayser2008-16] Manfred Kayser, Ying Choi, Mannis van Oven et al., "The impact of the Austronesian expansion: evidence from mtDNA and Y-chromosome diversity in the Admiralty Islands of Melanesia," Molecular Biology and Evolution (2008)

[17] Y-DNA Haplogroup S and its Subclades - 2019-2020 ISOGG Y-DNA Haplogroup Tree

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