Kopp, protestante, nació en Hildesheim, Baja Sajonia hijo de un alguacil de la corte. Asistió a una escuela privada en Stolzenau y se graduó del Realgymnasium en Harburg en 1914. Se presentó voluntario para el servicio militar con el Ejército Imperial Alemán en octubre de 1914 y luchó en la Primera Guerra Mundial con el 9.º Batallón de Pioneros. En diciembre de 1916, fue ascendido a Teniente de reserva. Fue herido en acción en septiembre de 1917, pero continuó sirviendo hasta el Armisticio del 11 de noviembre de 1918 , ganando la Cruz de Hierro , de primera y segunda clase, y la Insignia de Herido. Dado de baja del ejército el mes siguiente, Koppe siguió una carrera como comerciante mayorista. En 1930 se unió al Partido Nazi ; en 1931, a las SA y, un año después, a las SS . Kopp ascendió rápidamente en las SS: en 1934 ya era Brigadeführer (un rango intermedio entre teniente coronel y teniente coronel), y dos años más tarde ascendió a Gruppenführer, teniente coronel. En 1933 fue elegido delegado del Reichstag. Kopp fue nombrado comandante regional de las SS y la SDA en Münster, y posteriormente ocupó el mismo cargo en Danzig, Leipzig y Dresde. Se casó en 1925 y tuvo dos hijos. Su hija, Ursula, se casó con el aristócrata Arnold Freiherr von Rotberg, un Oberstleutnant de la Bundeswehr alemana y descendiente del ministro de guerra bávaro Eduard Anton Freiherr von Rotberg .

La Segunda Guerra Mundial comenzó el 1 de septiembre de 1939 con la invasión alemana de Polonia, Alemania ocupó la mayor parte de Polonia y, tras completar la ocupación y su división con la Unión Soviética, dividió el territorio que quedó bajo su control en dos partes principales: la parte central, que incluía los distritos de Varsovia, Lublin, Radom y Cracovia, se definió como una unidad administrativa independiente: Generalgoverning (Administración General); por otro lado, las regiones occidentales de Polonia fueron anexadas a Alemania. Una de las grandes áreas anexadas fue denominada por los alemanes Warthegau. Esta área incluía parte de la región de Łódź y la región de Poznań. Koppe se unió al Partido Nazi el 1 de septiembre de 1930 (número de miembro 305.584) y en diciembre se convirtió en asesor de prensa del Ortsgroup (grupo local) Harburg-Wilhelmsburg . Como miembro temprano del Partido, más tarde sería galardonado con la Insignia Dorada del Partido. También sirvió como juez asociado en el tribunal local del partido. En junio de 1931, se unió a la unidad paramilitar nazi, la Sturmabteilung (SA), pero fue transferido a la Schutzstaffel (SS) el 2 de enero de 1932 (número SS 25.955). Asignado al 17.º SS- Standarte, fue ascendido rápidamente y, para el 1 de septiembre de 1932, estaba al mando de dicha unidad. Ascendió a Führer del SS- Abschnitt (distrito) XVII en Münster el 16 de noviembre de 1933 y fue ascendido a SS- Oberführer el 20 de abril de 1934. Poco después, el 23 de agosto, recibió otro ascenso a SS- Brigadeführer y fue transferido a un puesto de Estado Mayor en el SS- Oberabschnitt (distrito principal) "Südwest" en Stuttgart. Para el 19 de octubre, comandaba el SS-Abschnitt XXVI en la Ciudad Libre de Danzig , donde permaneció hasta que asumió el puesto de Jefe de Estado Mayor del SS- Oberabschnitt "Ost" en Berlín el 1 de noviembre de 1935. Kopp fue nombrado "Comandante Supremo de todas las fuerzas policiales y de las SS en Warthegau" (Höhere SS und Polizei Führer in Reichsgau Wartheland).

En 1939, Koppe - quien a sus espaldas, era apodado "el pequeño Himmler", en honor a Heinrich Himmler , el segundo hombre más poderoso de la Alemania nazi -se convirtió en el líder de las SS y la policía en la Polonia ocupada por los nazis. Él y su familia se mudaron a la ciudad de Poznan. En los años siguientes, Koppe supervisó innumerables asesinatos en la Polonia ocupada por los nazis.

En este cargo, Kopp participó directamente en la implementación de las Leyes de Núremberg. En noviembre, Kopp declaró que haría de Poznań, la capital regional, una ciudad "limpia de judíos" (judenrein). Esto desencadenó una ola de ejecuciones y deportaciones de polacos y judíos de la ciudad. También participó en la implementación del programa de eutanasia T4 como comandante en jefe de una unidad especial llamada "Sonderkommando Lange", llamada así por su comandante directo, Herbert Lange. Entre mayo y junio de 1940, la unidad de Lange asesinó a 1558 enfermos mentales que se encontraban hospitalizados en un hospital psiquiátrico del campo de concentración de Soldau, en Prusia Oriental.

El 30 de enero de 1942, Koppe fue ascendido al rango de Ober-Gruppenführer (general). En octubre de 1943, reemplazó a Friedrich Wilhelm Krieger como comandante supremo de todas las fuerzas policiales y de las SS en el Generalgouvernement . Fue responsable de la liquidación de los guetos en las ciudades de la región de Wartgau, del establecimiento del campo de exterminio de Chelmno, donde fueron asesinados unos 300.000 judíos. Se ocupó de la supresión de la resistencia polaca y ordenó la ejecución de todos los familiares varones de los miembros de la resistencia y la deportación de sus familias restantes a campos de concentración. Koppe ordenó el asesinato de unos 30.000 polacos que sufrían de tuberculosis . La resistencia polaca ordenó su asesinato, pero un intento de atentar contra él en Cracovia en julio de 1944 fracasó. En respuesta a las actividades de la resistencia clandestina polaca, Koppe propuso fusilar a 50 polacos en represalia cada día y sin juicio. También organizó numerosas ejecuciones públicas, como la que ordenó el ahorcamiento de 15 polacos en el pueblo de Tuchorza el 9 de junio de 1942, en represalia por el asesinato de un policía alemán. Unos 200 aldeanos fueron obligados a presenciar la ejecución.

Decidido a contraatacar, el Estado Secreto Polaco ordenó la muerte de Koppe. Poco después de que Koppe fuera nombrado general de las Waffen-SS el 1 de julio de 1944, un intento de asesinato resultó en su herida el 11 de julio de 1944 en Cracovia por una unidad de Kedyw —el Batallón Parasol— en la "Operación Koppe", parte de la "Operación Cabezas".  Más tarde ese mismo año, con el Ejército Rojo acercándose a Polonia, Koppe ordenó la ejecución de todos los prisioneros para evitar que los soviéticos los liberaran. Tras la invasión rusa de Cracovia en enero de 1945, Koppe fue transferido a un puesto de Estado Mayor en el Grupo de Ejércitos Vístula , bajo el mando directo de Himmler. El 4 de abril, Koppe asumió el puesto de la HSSPF «Süd» en Múnich , donde permaneció hasta la rendición de Alemania el 8 de mayo.  Durante la guerra, Koppe fue condecorado con la Cruz de Hierro de segunda clase y la Cruz al Mérito de Guerra de primera y segunda clase con espadas.

Tras la guerra, Koppe ocultó su identidad y vivió bajo el seudónimo de Lohmann (el apellido de soltera de su esposa). Wilhelm y Käthe Koppe, ahora con identidades falsas, vivieron cerca de la ciudad de Hannover, aunque a 15 kilómetros de distancia, fingiendo no tener relación. Wilhelm Koppe, ahora haciéndose pasar por Wilhelm Lohmann, retomó su carrera empresarial. Era gerente de una fábrica de chocolate Sarotti en Bonn que funciona hasta la actualidad (año 2025). A principios de la década de 1960, la identidad de Wilhelm Koppe quedó al descubierto. Pasó más de dos años en prisión preventiva, pero finalmente fue puesto en libertad bajo fianza. Su hijo, Manfred, ya abogado, comenzó a trabajar en la estrategia de defensa de su padre y a reunir pruebas para demostrar su inocencia. Se iniciaron procedimientos penales en el Bonn Landgericht (tribunal regional) y su juicio se abrió en octubre de 1964. Fue acusado de ser cómplice del asesinato en masa de 145.000 personas en los exterminios de Chelmno.  Sin embargo, el juicio se detuvo cuando los médicos de Koppe atestiguaron que sufría de una enfermedad circulatoria, presión arterial alta y esclerosis vascular, lo que lo hacía postrado en cama la mayor parte del tiempo. En agosto de 1966, el fiscal público de Bonn dio por terminado el proceso.  El gobierno alemán rechazó una solicitud de extradición del gobierno de Polonia.  Koppe murió en 1975, a la edad de 79 años, en Bonn. En su tumba, en el cementerio de Rüngsdorf, se han colocado carteles con la leyenda "¡Nunca condenado!

• Wilhelm Koppa en el sitio web de Yad Vashem
• «Tumba de Wilhelm Koppe» (en inglés). Find a Grave. 
• https://www.dw.com/en/how-high-ranking-nazi-figure-wilhelm-koppe-escaped-justice/a-56171606
• Base de datos de parlamentarios alemanes: https://www.reichstag-abgeordnetendatenbank.de/select.html?pnd=120475782
• Catherine Epstein (2010). Arthur Greiser and the Occupation of Western Poland. Oxford University Press. ISBN 978-0-191-61384-5. Retrieved 26 June 2012.
• Chocolates Sarotti: https://www.sarotti.de/