Pedro Aguado Cuesta nació en Bilbao (1957). Ingresó a la orden religiosa de los Escolapios.^[2]​ Tras estudiar Magisterio en la Escuela de Formación del Profesorado Nuestra Señora de Begoña de Bilbao (1978) completó su formación académica con una licenciatura en Ciencias Eclesiásticas en el Centro Superior de Teología, dependiente de la Universidad de Navarra (1982) y otra en Filosofía y Ciencias de la Educación por la Universidad de Deusto (1988).^[3]​

En su comunidad religiosa fue asistente provincial de pastoral y posteriormente superior provincial de la provincia religiosa del País Vasco. Desde 2009 fue superior general de los escolapios; En 2021 fue reelegido para este cargo para un tercer mandato. Desde 2022 también fue Presidente de la Comisión de Educación de la Asociación de Superiores Religiosos y Superiores Generales, así como Consultor del Dicasterio para la Cultura y la Educación.^[2]​^[4]​

El 29 de marzo de 2025, el Papa Francisco lo nombró obispo de las diócesis de Huesca y Jaca, unidas in persona episcopi.^[2]​

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