Como en temporadas anteriores, el modo de disputa es el mismo bajo el sistema de todos contra todos con partidos de ida y vuelta, unos como local y otros como visitante en dos rondas de once jornadas cada una. Es campeón el equipo que acumula la mayor cantidad de puntos al término de las 22 fechas.

En caso de igualdad de puntos entre dos contendientes se define el título tomando los siguientes parámetros:

1. Puntos en partidos directos.
2. Diferencia de goles en partidos directos.
3. Diferencia de goles.
4. Mayor cantidad de goles a favor.
5. Partido extra en campo neutral.

De existir más de dos en disputa se toman en cuenta los mismos parámetros excepto el último punto, siendo como última opción sorteo.

Para determinar el descenso, los dos últimos equipos en la tabla de promedios descenderán a la División Intermedia.

• Olimpia juega en el Defensores del Chaco, porque el estadio Osvaldo Dominguez Dibb se encuentra en remodelación.^[2]​^[3]​^[4]​
• Guaraní juega en el Gunther Vogel, porque el estadio Rogelio Livieres se encuentra en remodelación.^[5]​^[6]​
• Luqueño juega en el Luis Salinas, porque el estadio Feliciano Cáceres se encuentra en remodelación.^[7]​^[8]​^[9]​
• Tembetary juega en el Luis Alfonso Giagni, porque el estadio Complejo Tembetary no está habilitado por su reducida capacidad.^[10]​^[11]​
• Recoleta juega en el Ricardo Gregor, porque el estadio Roque Battilana no está habilitado por su reducida capacidad.^[12]​

La mayoría de los clubes (7) se concentra en la capital del país. En tanto que tres se encuentran a corta distancia en ciudades del Departamento Central. Por último, uno pertenece al departamento de Amambay y uno al de Alto Paraná. Se incluye al estadio Defensores del Chaco, propiedad de la Asociación Paraguaya de Fútbol, debido a su uso frecuente por equipos que optan oficiar ahí como locales.^[13]​

• Los horarios son correspondientes a PYT (UTC-3).

El puntaje acumulado es el que obtiene cada equipo al sumar los torneos Apertura y Clausura de 2025. Al cierre de temporada se definirá a los representantes de la APF en los torneos de Conmebol en 2026.

• Para la Copa Libertadores 2026 clasifican 4: los campeones del Apertura y Clausura, ordenados según sus posiciones finales en la tabla;^[14]​ y los mejores colocados, sin contar a los mencionados anteriormente.^[14]​ Si el mismo club repitiera el título logra automáticamente el primer cupo, otorgando los restantes a los finalizados en segundo, tercer y cuarto lugar.^[14]​ Los dos mejores acceden a la fase de grupos, el tercero ingresa desde la fase preclasificatoria 2 y el campeón de la Copa Paraguay 2025 lo hace a partir de la fase preclasificatoria 1.^[14]​^[15]​

• Para la Copa Sudamericana 2026 clasifican 4: los cuatro primeros colocados, excluyendo a los clasificados para la Copa Libertadores.

Para ambos torneos, en caso de paridad de puntos entre dos o más equipos, se toma en cuenta la diferencia de goles. Los campeones del Apertura y Clausura aseguran su participación en la Libertadores como Paraguay 1 o 2, sin depender de la posición que ocuparon en esta tabla.

El promedio de puntos de un club es el cociente que se obtiene de la división de su puntaje acumulado en las últimas tres temporadas en la división, por la cantidad de partidos que haya jugado durante dicho período. Este determina, al final de cada temporada, a los equipos que descenderán a la División Intermedia.

     Descendidos a la División Intermedia.

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