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TRIM28 
Summary
Motivo tripartito 28 (TRIM28), también conocida como factor intermediario transcripcional 1β (TIF1β), es una proteína codificada en humanos por el gen TRIM28.[1] [2]
| Motivo tripartito 28, TRIM28 o TIF1B | |||||||||
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| Estructuras disponibles | |||||||||
| PDB |
Buscar ortólogos: PDBe, RCSB Lista de códigos PDB 1FP0 , 2RO1 , 2YVR
Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
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| Identificadores | |||||||||
| Nomenclatura |
Otros nombres Transcription intermediary factor 1-beta, (TIF1B),
E3 SUMO-protein ligase TRIM28 | ||||||||
| Símbolos | TRIM28 (HGNC: 16384) KAP1, FLJ29029, RNF96, TF1B, TIF1B | ||||||||
| Identificadores externos | |||||||||
| Número EC | 2.3.2.27 | ||||||||
| Locus | Cr. 19 q13.43 | ||||||||
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| Ortólogos | |||||||||
| Especies |
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| Entrez |
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| Ensembl |
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| UniProt |
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| RefSeq (ARNm) |
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| RefSeq (proteína) NCBI |
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| Ubicación (UCSC) |
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| PubMed (Búsqueda) |
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Gen
editarEl gen TRIM28 se ubica en el cromosoma 19 (humano) brazo largo q, banda 13.43, utilizando la notación internacional del locus, de manera resumida: 19q13.43.
Función
editarTRIM28 está implicado en el control transcripcional por interacción con el dominio de represión asociado a la caja Krüppel presente en multitud de factores de transcripción.
La proteína se localiza en el núcleo celular y parece encontrarse asociada con regiones específicas de la cromatina.
La proteína TRIM28 pertenece a la familia de motivos tripartitos. Este motivo tripartito incluye tres dominios de unión a zinc, un dominio de dedos RING, una B-box tipo 1, una B-box tipo 2 y una región de hélice superenrollada.[3]
Interacciones
editarLa proteína TRIM28 ha demostrado ser capaz de interaccionar con:
Véase también
editarReferencias
editar- ↑ Reymond A.; Meroni G.; Fantozzi A.; Merla G.; Cairo S.; Luzi L.; Riganelli D.; Zanaria E.; Messali S.; Cainarca S.; Guffanti A.; Minucci S.; Pelicci PG.; Ballabio A. (mayo de 2001). «The tripartite motif family identifies cell compartments». Embo J. 20 (9): 2140-2151. PMC 125245. PMID 11331580. doi:10.1093/emboj/20.9.2140.
- ↑ Capili AD.; Schultz DC.; RauscherIII FJ.; Borden KL. (enero de 2001). «Solution structure of the PHD domain from the KAP-1 corepressor: structural determinants for PHD, RING and LIM zinc-binding domains». Embo J. 20 (1-2): 165-77. PMC 140198. PMID 11226167. doi:10.1093/emboj/20.1.165.
- ↑ «Entrez Gene: TRIM28 tripartite motif-containing 28».
- ↑ Nielsen, Anders Lade; Sanchez, Cecilia; Ichinose, Hiroshi; Cerviño, Margarita; Lerouge, Thierry; Chambon, Pierre; Losson, Régine (Nov. de 2002). «Selective interaction between the chromatin-remodeling factor BRG1 and the heterochromatin-associated protein HP1alpha». EMBO J. (England) 21 (21): 5797-5806. ISSN 0261-4189. PMID 12411497.
- ↑ Cammas, Florence; Oulad-Abdelghani, Mustapha; Vonesch, Jean-Luc; Huss-Garcia, Yolande; Chambon, Pierre; Losson, Régine (Sep. de 2002). «Cell differentiation induces TIF1beta association with centromeric heterochromatin via an HP1 interaction». J. Cell. Sci. (en inglés) 115 (Pt 17): 3439-3448. ISSN 0021-9533. PMID 12154074.
- ↑ Nielsen, A.L.; Oulad-Abdelghani M.; Ortiz J.A.; Remboutsika E.; Chambon P.; Losson R. (Apr. de 2001). «Heterochromatin formation in mammalian cells: interaction between histones and HP1 proteins». Mol. Cell (en inglés) 7 (4): 729-739. ISSN 1097-2765. PMID 11336697.
- ↑ Begg G E, Speicher D W, Rauscher F J (Sep. de 2000). «Molecular determinants for targeting heterochromatin protein 1-mediated gene silencing: direct chromoshadow domain-KAP-1 corepressor interaction is essential». Mol. Cell. Biol. (en inglés) 20 (17): 6449-6465. ISSN 0270-7306. PMID 10938122.
- ↑ Moosmann P.; Georgiev O.; Le Douarin B.; Bourquin J.P.; Schaffner W. (Dec. de 1996). «Transcriptional repression by RING finger protein TIF1 beta that interacts with the KRAB repressor domain of KOX1». Nucleic Acids Res. (en inglés) 24 (24): 4859-4867. ISSN 0305-1048. PMID 9016654.
- ↑ Peng H.; Begg G E, Harper S L, Friedman J R, Speicher D W, Rauscher F J (Jun. de 2000). «Biochemical analysis of the Kruppel-associated box (KRAB) transcriptional repression domain». J. Biol. Chem. (en inglés) 275 (24): 18000-18010. ISSN 0021-9258. PMID 10748030. doi:10.1074/jbc.M001499200.
- ↑ Rooney, J W; Calame K L (Nov. de 2001). «TIF1beta functions as a coactivator for C/EBPbeta and is required for induced differentiation in the myelomonocytic cell line U937». Genes Dev. (en inglés) 15 (22): 3023-3038. ISSN 0890-9369. PMID 12269264. doi:10.1101/gad.937201.
- ↑ a b Chang, C J; Chen Y L, Lee S C (Oct. de 1998). «Coactivator TIF1beta interacts with transcription factor C/EBPbeta and glucocorticoid receptor to induce alpha1-acid glycoprotein gene expression». Mol. Cell. Biol. (en inglés) 18 (10): 5880-5887. ISSN 0270-7306. PMID 9742105.
- ↑ Schultz, David C.; Ayyanathan, Kasirajan; Negorev, Dmitri; Maul, Gerd G.; Rauscher, Frank J. (Apr. de 2002). «SETDB1: a novel KAP-1-associated histone H3, lysine 9-specific methyltransferase that contributes to HP1-mediated silencing of euchromatic genes by KRAB zinc-finger proteins». Genes Dev. (en inglés) 16 (8): 919-932. ISSN 0890-9369. PMID 11959841. doi:10.1101/gad.973302.
Enlaces externos
editar- MeSH: TRIM28 protein, human (en inglés)
Datos: Q18035077
