KEGG

Summary

KEGG (Enciclopedia de Genes y Genomas de Kioto) es una colección de bases de datos en línea de genomas, rutas enzimáticas, enfermedades, fármacos y sustancias químicas . La base de datos KEGG se utiliza para la investigación y la educación en bioinformática, incluido el análisis de datos en genómica, metagenómica, metabolómica y otros estudios ómicos, modelado y simulación en biología de sistemas e investigación traslacional en el desarrollo de fármacos. A partir de julio de 2011, KEGG ha cambiado a un modelo de suscripción y el acceso a través de FTP ya no es gratis.

KEGG
Información general
Dominio www.kegg.jp
Tipo KEGG (Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes) es una base de datos integrada y un recurso bioinformático en línea que proporciona información exhaustiva sobre genomas, rutas metabólicas, genes, proteínas, compuestos químicos y redes funcionales en
Idiomas disponibles Inglés
Japonés
En español No
Licencia licencia privativa
Estado actual Activo
Gestión
Lanzamiento 1995

Introducción

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El KEGG, el Kyoto Encyclopedia of Genes and Genomes, fue iniciado por el programa del genoma humano japonés en 1995.[1]​ Los desarrolladores consideran a KEGG de ser una "representación informática" del sistema biológico.[2]​ La base de datos KEGG puede ser utilizada para la modelización y la simulación, la navegación y extracción de datos. Es parte del enfoque biología de sistemas.

Bases de datos en KEGG

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KEGG mantiene cinco bases de datos principales:[3]

  • KEGG Atlas
  • KEGG PATHWAY: registra las redes de interacciones moleculares dentro de las células, y variantes de ellas específicas a organismos particulares.
  • KEGG Genes
  • KEGG Ligand
  • KEGG BRITE

Referencias

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  1. Kanehisa M (1997). «A database for post-genome analysis.». Trends Genet 13 (9): 375-6. PMID 9287494. 
  2. Kanehisa M, Goto S, Hattori M, Aoki-Kinoshita KF, Itoh M, Kawashima S et al. (2006). «From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.». Nucleic Acids Res 34 (Database issue): D354-7. PMC 1347464. PMID 16381885. doi:10.1093/nar/gkj102. 
  3. Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004). «The KEGG resource for deciphering the genome.». Nucleic Acids Res 32 (Database issue): D277-80. PMC 308797. PMID 14681412. doi:10.1093/nar/gkh063. 
  •   Datos: Q909442