Pedro Augusto era hijo de Federico Luis de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Beck (1653-1728) y su esposa y prima Luisa Carlota de Augustenburgo (1658-1740), hija de Ernesto Gunter de Augustenburgo y Augusta de Glucksburg.

Este príncipe llegó a ser gobernador de Estonia y gobernador-general de Tallin (Reval) pero nunca llegó a heredar los dominios de Beck, que pasaron de su tío el duque Augusto (1652-1689) a su hijo Federico Guillermo I (m.1719) cuya viuda lo vendió en 1732 a Federico Guillermo II (1687-1749), hermano mayor de Pedro Augusto, quien lo revendió en 1745 a la baronesa Magdalena von Ledebur-Königsbrück. De esta manera, cuando Pedro Augusto se convirtió en cabeza de su familia —la rama Beck— era "Duque de Schleswig-Holstein-Sonderburg-Beck" sólo de nombre.

El 5 de septiembre de 1723 contrajo matrimonio con la princesa Sofía de Hesse-Philippsthal (1695-1728), hija del landgrave Felipe de Hesse-Philippsthal y de la princesa Catalina de Solms-Laubach. Su esposa murió con sólo 33 años y le dejó tres hijos:

• Carlos (1724-1726), murió niño.
• Ulrica Amelia Guillermina (1726), murió poco después de nacer.
• Carlos Antonio (1727-1759), su sucesor.

Viudo, se casó por segunda vez el 15 de marzo de 1742 con la condesa Natália Nikolaievna Golovine, hija del conde Nicolás Fedorovich Golovin y Sofía Nikitovna Pushkin, la pareja tuvo tres hijos:

• Pedro (1743-1751).
• Alejandro (1744), vivió unas pocas horas.
• Catalina (1750-1811), casada en 1767 con el príncipe Iván Bariatinsky († 1811); abuela del mariscal de campo ruso y príncipe Aleksandr Bariátinski.

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