Cinco años antes del principio de la serie, una explosión masiva que se conoce como "El Evento Nanite" (que se pronuncia como "Nánaits") liberó los nanites en la atmósfera, infectando a todo ser vivo sobre la Tierra. Estos nanites que al azar se activan dentro del sujeto, lo transforman en un monstruo con o sin forma humana, conocido como "E.V.O." (En inglés como Exponentially Variegated Organism, En español como Ente Variable Orgánico u Organismo Exponencial Variante), el cual posee gran fuerza y a menudo poderes sobrenaturales, pero que por lo general no tiene control sobre sí mismo. Para combatir la amenaza E.V.O., la organización conocida como Providencia fue creada para capturarlos y buscar una cura.

Rex, uno de los muchos E.V.O.s afectados por los nanites un agente de Providencia, quien a diferencia de los otros E.V.O.s, es capaz de dominar sus nanobots, pudiendo convertir todo su cuerpo en distintas máquinas de combate y de curar a otros E.V.O.s., lo que lo hace único en su especie.Trabajando junto a varios compañeros como el Agente 6, Bobo y Holliday, detendrá la amenaza de los E.V.O.s y se enfrentará a poderosos enemigos como el malvado E.V.O. Van Kleiss.

La principal amenaza contra Providencia es Van Kleiss, un E.V.O. con conexiones no sólo al "Evento", sino con Rex también.

• Rex Salazar: El protagonista principal de la serie. Es un adolescente amnésico que no sólo es capaz de manipular los nanaits que han infectado su cuerpo y le han convertido en un E.V.O. sino que incluso puede curar a otros infectados. Puede crear máquinas gracias a su estado de E.V.O. Además de haber perdido todo recuerdo de antes de Providencia, crea sus BFS, Smack Hands. Como se muestra en los episodios 'La Plaga' y 'El Vándalo', sus poderes también pueden fallar cuando está cansado o exhausto. La serie inicialmente ocultó su pasado, pero lentamente se va revelando; una construcción fragmentada que puede ser ensamblada de varios episodios.

• Circe:. Es una adolescente de pelo negro con las puntas de rojo (aunque en la segunda temporada se lo ve de color azul) y vestimenta gótica. Rex la conoce en el capítulo 3 y, al igual que él, Circe es una E.V.O con la habilidad de desplegar una especie de trompa a su voluntad, capaz de atraer como derribar E.V.Os. Ella se une a Van Kleiss creyendo realmente en sus ideales. Actualmente Circe se encuentra, gracias a una sugerencia de Rex, en Hong Kong con la vieja pandilla del mismo. Está enamorada de Rex.

• Cesar Salazar: Hermano mayor de Rex, aparece en la segunda temporada de la serie, eventualmente ayuda a Rex con sus recuerdos. Llevándolo a visitar viejos lugares como México, en los cuales estuvieron; ellos y sus padres, los cuales tienen raíces de México y Buenos Aires. Hace su aparición cuando Rex tiene unas extrañas visiones sobre una máquina, que construye después, estando en un modo inconsciente.

• Agente Seis: Agente de Providencia enviado para controlar y proteger a Rex. Es un hombre recto que sigue las normas al pie de la letra. Siempre lleva gafas de sol y un traje verde; en conjunto, su aspecto recuerda poderosamente al Agente Smith de la serie de películas Matrix. Usa dos espadas katanas ocultas, las cuales también puede unirlas en un gran imán y usar los metales atraídos para arrojarlos contra los enemigos que se encuentren. Según lo que dice Rex, tiene un gusto por la menta. Se reveló después que él y Blanco fueron compañeros y fue quien encontró a Rex. A medida que avanza la serie se demuestra que Seis es el sexto hombre más peligroso del mundo.

• Dra. Rebecca Holiday: Científica de Providencia y doctora de Rex. Es una mujer que se preocupa de todo en especial de Rex, que lo trata como a un hijo y lo defiende de Providencia.

• Bobo Haha: Chimpancé E.V.O. con la capacidad de hablar y compañero de las aventuras de Rex.

• Noah Nixon: Amigo del protagonista. Un Adolescente catire contratado por Providencia, fue ordenado por Blanco a vigilar a Rex, pero acabó convirtiéndose en su mejor amigo.

• Van Kleiss: principal villano de la serie. Al igual que Rex, es capaz de manipular a voluntad sus nanomáquinas para controlar seres vivos a diferencia de Rex quien puede crear y controlar máquinas el controla la naturaleza. Además de ser el líder de "La Banda".

• Caballero Blanco (White Knight): El antiguo jefe de Providencia y excompañero de Seis.

• Caballero Negro (Black Knight): Se vuelve jefe de Providencia, cuando Blanco es despedido, y por consiguiente Rex sale de Providencia para formar un grupo con Holiday, Seis, Bobo Hanna y con el exjefe de Providencia: Blanco.

• Ben Tennyson /Ben 10: Es un adolescente de 16 años de otro universo, qué tiene un artefacto antiguo y poderoso, el Ultimatrix adherido que le permite transformarse en más de un millón de alienígenas. Solo aparece en el crossover especial Ben 10-Generador Rex: Héroes Unidos.

• Daryl Sabara es Rex Salazar.

• Wally Kurth es Agente Seis y Capitán Calan.

• Grey DeLisle es Doctora Holiday, Diane Farah.

• John DiMaggio es Bobo Haha, Skalamandra.

• Fred Savage es Noah Nixon.

• Freddy Rodríguez es César Salazar.

• J.K. Simmons es Blanco.

• Jennifer Hale es Negro.

• Troy Baker es Van Kleiss y Bio- Lobo.

• Tara Sands es Circe.

• Hynden Walch es Brecha.

Es un crossover entre esta serie y Ben 10: Supremacía Alienígena. Ben es enviado a la dimensión de Rex y lo confunde con un E.V.O, lo que llevó a pelear con él. Luego se unirán contra una nueva amenaza gigantesca. Además, Ben tendrá un nuevo alien, desbloqueado por Rex Y Ben le dará una nueva arma a Rex.^[7]​^[8]​

Fue anunciado el 11 de julio de 2011, en el San Diego Comic-Con durante un panel de Cartoon Network.^[9]​ Durante la conferencia, revelaron que el cruce sería un episodio especial extendido de Generador Rex, que se emitió el 25 de noviembre de 2011.

Un videojuego titulado Generator Rex: Agent of Providence ha sido desarrollado para Wii, PlayStation 3, Nintendo DS, Nintendo 3DS y Xbox 360. El juego fue lanzado el 1 de noviembre de 2011 en los Estados Unidos, y fue publicado por Activision.^[10]​^[11]​ La trama involucra Van Kleiss intentar encontrar planos para construir un Omega-One nanite.

• Página oficial de Generator Rex
• Página oficial, viviendo con nanites Archivado el 17 de mayo de 2014 en Wayback Machine.
• Página oficial de Providencia
• Página oficial de Man of Action