Coryphantha gracilis es una especie de cactus que aunque suele crecer de forma solitaria, a veces, de forma ocasional se ramifica desde la base y forma pequeños grupos. Los tallos son aplanados y su forma va de esférica a cilíndrica. Tienen la epidermis de color verde grisáceo claro a verde hierba, alcanzando alturas de 3,5 a 10,5 cm y diámetros de 2,5 a 5 cm.

Los tallos están cubiertos de tubérculos cónicos de hasta 0,9 cm de largo y son ligeramente curvados. Están provistos de un surco y no tienen glándulas de néctar. Sus axilas, aunque inicialmente son lanudas, con el tiempo se vuelve desnudas.

En la punta de los tubérculos se asientan areolas de forma oval a elíptica. No suelen presentan espinas centrales, aunque a veces aparece 1 de color cuerno a blanquecino en las areolas jóvenes de plantas viejas. También tienen de 12 a 18 espinas radiales aciculares de color blanquecino a marrón amarillento, de 0,5 a 1,1 cm de largo.

Las flores aparecen apicalmente, son de color amarillo muy claro y brillantes, miden de 2,2 a 3 cm de largo y alcanzan un diámetro de 3,5 a 5 cm. Los frutos tienen forma esférica, son de color verde claro con el ápice rojizo o púrpura, no son muy jugosos y miden de 1 a 1,5 cm de largo. Las semillas van de globosas a ovoide truncadas, son de color pardo y tienen la testa reticulada.^[2]​

El área de distribución nativa de esta especie es el noreste de México (concretamente en el estado mexicano de Chihuahua) y crece principalmente en biomas desérticos o de matorral seco, cerca de los 1800 metros sobre el nivel del mar.^[3]​^[4]​

Se desarrolla en pastizales secos, sobre suelos calcáreos de colinas, asociándose a otras cactáceas como Echinocereus pectinatus, Stenocactus multicostatus o Thelocactus bicolor, entre otras.^[5]​

Coryphantha gracilis fue descrita por los botánicos Lewis Bremer y Alfred Bernhard Lau y publicada por primera vez en la revista científica Cactus and Succulent Journal 49: 72 en el año 1977.^[6]​

Etimología

• Coryphantha: nombre genérico que deriva del griego coryphe (que significa 'cima' o 'cabeza'), y anthos (que significa 'flor'), haciendo referencia a que las flores aparecen en el ápice de los tallos.
• gracilis: epíteto específico latino que significa 'delgada' o 'delicada', haciendo referencia a su apariencia.^[7]​^[8]​

En la Lista Roja de Especies Amenazadas de la UICN, la especie está clasificada como de “Preocupación Menor (LC)” y no se le conocen amenazas importantes.^[9]​

Se cultiva principalmente como planta ornamental y su propagación se realiza a través de semillas o esquejes.