Thompson viajó al Argentina en 1911 para trabajar en el Banco Británico de la América del Sud. Empezó a jugar al fútbol argentino en octubre de 1911 con Estudiantes de La Plata como delantero, donde jugó 15 partidos y convirtió 8 goles. En julio de 1913 pasó a jugar en River Plate. Su primer partido fue el 24 de agosto de 1913 contra Boca Juniors, donde River ganó 2-1 haciéndolo el primer Superclásico del fútbol argentino oficial. En 1914, Thompson jugó tres partidos más con River Plate, como defensor.^[2]​

Thompson se anotó como voluntario en la Primera Guerra Mundial en la King's Own Yorkshire Light Infantry, donde fue capitán del décimo batallón. El moriría en la Batalla del Somme en el 25 de septiembre de 1916, el mismo día de la muerte de su hermano menor Sidney en 1915 (21 años). Su tumba esta en el Memorial de Thiepval.^[2]​^[1]​^[4]​^[5]​