En la Fase 1 de la Copa Libertadores 2025 participaron seis equipos, los cuales son clasificados en los últimos cupos asignados a Bolivia, Ecuador, Paraguay, Perú, Uruguay y Venezuela. Estos fueron distribuidos en tres parejas de acuerdo al sorteo previo. Cada pareja de equipos se enfrentó en una serie de dos partidos, a ida y vuelta. En caso de empatar en el total de goles, se recurrió a una tanda de penales, sin prórroga previa, no se consideró la regla del gol de visitante como criterio de desempate. Los ganadores clasificaron a la Fase 2.^[1]​^[2]​

El sorteo de esta fase se realizó el 19 de diciembre de 2024 a las 12:00 (UTC-3) en la sede de Conmebol, en Luque, Paraguay.^[3]​^[4]​