Integrado en la comarca de Comunidad de Calatayud, se sitúa a 122 km de Zaragoza. El término municipal está atravesado por la carretera nacional N-234, entre los pK 299 y 304, además de por la carretera autonómica A-1502, que permite la comunicación con Berdejo.

El relieve del municipio está definido por un terreno llano pero con numerosos cerros y barrancos, propio del Sistema Ibérico, estando vertebrado por el río Manubles, que cruza el territorio de norte a sur. La altitud oscila entre los 1295 m al norte (pico Vigornia), en la sierra de la Vigornia, y los 980 m a orillas del río Manubles. El pueblo se alza a 988 m sobre el nivel del mar.

Existen argumentos que avalan la teoría de que Torrelapaja es el lugar de nacimiento de San Millán^[3]​ basándose en la vida escrita por San Braulio^[4]​ y teniendo en cuenta que en la época visigótica Torrelapaja era un barrio de Berdejo.^[5]​

Hacia mediados del siglo XIX, el lugar contaba con una población de 188 habitantes.^[6]​ La localidad aparece descrita en el decimoquinto volumen del Diccionario geográfico-estadístico-histórico de España y sus posesiones de Ultramar de Pascual Madoz de la siguiente manera:

TORRELAPAJA: l. con ayunt. de la prov. y aud. terr. de Zaragoza (18 leg.), c. g. de Aragon, part. jud. de Ateca (6), dióc. de Tarazona (10). sit. en terreno llano circundado de grandes cerros; le baten con mas frecuencia los vientos del N. y O.: su clima es frío y saludable. Tiene 35 casas, las del ayunt., cárcel y hospital de San Millan; escuela de niños á la que asisten 12, dotada con 700 rs.; igl. parr. (San Millan) servida por un cura de provision del vicario general de Calatayud, á propuesta del capitulo, y en su defecto el ayunt.; una ermita dedicada á Sta. Juliana sit. al S. sobre un pequeño cerro á 1/2 cuarto de hora de la pobl., y un cementerio estramuros. Los vec. se surten de varias fuentes que hay en el térm. de buenas aguas. Confina el térm. por N. con Ciria; E. Malanquilla; S. Verdejo, y O. Reznos: su estension de N. á S. es de 1/2 leg. y 3/4 de E. á O.: le baña el r. Manubles que corre de N. á S., y comprende los montes denominados la Sierra, Ombria y Vallehermosa con encinas y robles altos, varias canteras de cal y una deh. de pasto á 1/4 leg. del pueblo. El terreno es secano de regular calidad. Los caminos son locales y el que conduce de Soria á Calatayud en regular estado. El correo se recibe de este último punto por balijero dos veces á la semana. prod.: trigo morcacho, cebada, centeno y avena; mantiene ganado lanar y hay caza de liebres y perdices. ind.: la agrícola. pobl.: 40 vec., 188 alm. cap. prod.: 840,000 rs. imp.: 33,200. contr.: 7,087.

(Madoz, 1849, p. 87)

El municipio llegó a contar con una estación de ferrocarril perteneciente a la línea Santander-Mediterráneo, que estuvo operativa entre 1929 y 1985. En la actualidad la línea ha sido desmantelada y reconvertida en vía verde.

Cuenta con una población de 29 habitantes (INE 2024).

Gráfica de evolución demográfica de Torrelapaja[7]​ entre 1842 y 2021

Población de derecho según los censos de población del INE.     Población de hecho según los censos de población del INE.

• Casa de San Millán
• Iglesia de Nuestra Señora de Malanca. Se conserva un arcón con reliquias de San Millán.

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  Casa de San Millán.
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  Detalle de la casa de San Millán.
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  Torre de la iglesia de Nuestra Señora de Malanca.
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  Torre, muro y entrada a la iglesia.
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  Torre y ábside de la iglesia.

• Anexo: Municipios de la provincia de Zaragoza

• Madoz, Pascual (1849). «Torrelapaja». Diccionario geográfico-estadístico-histórico de España y sus posesiones de Ultramar XV. Madrid. Wikidata Q115624375. 

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• Sitio web del Ayuntamiento de Torrelapaja
• San Millán, Torrelapaja y Berdejo
• Vida y milagros de San Millán
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