Su aparición se hizo pública antes del Golpe de Estado de 1973, con el objetivo de investigar y reprimir a suboficiales, funcionarios y marinos que eran leales al Gobierno de Salvador Allende.^[1]​

Tras el Golpe, funcionó en puertos como Talcahuano (Fuerte Borgoño, Base Naval y la Isla Quiriquina), Punta Arenas y principalmente en la ciudad de Valparaíso,^[3]​ donde operó en la sede de la Academia de Guerra Naval en conjunto con la Servicio de Inteligencia de la Comandancia de Área Jurisdiccional de Seguridad Interior (SICAJSI)^[4]​ donde fue uno de los principales organismos represivos en aquella ciudad.

El SIN estuvo a cargo de llevar a cabo torturas e interrogatorios a simpatizantes y militantes de partidos políticos de izquierda afines al Gobierno de la Unidad Popular. Dentro de los vejámenes consignados en el Informe Valech, estaban las torturas físicas, psicológicas y agresiones sexuales.^[4]​ Asimismo, colaboró con la Dirección de Inteligencia Nacional en la persecución de militantes del Movimiento de Izquierda Revolucionaria.^[5]​

Posteriormente en 1986, adquiere el nombre actual de Dirección de Inteligencia de la Armada (DIRINTA).^[6]​

1. ↑ ^{a b} «SIN». www.memoriaviva.com. Consultado el 28 de septiembre de 2023. 
2. ↑ Rumbero, Alejandro Muñoz (2015). «La dirección de Inteligencia Nacional: una breve aproximación a la policía político-social de la dictadura chilena (1973-1977)». Revista Historia Autónoma (6). ISSN 2254-8726. Consultado el 28 de septiembre de 2023. 
3. ↑ Morales, Francisco Javier (2 de agosto de 2016). «Organismos de inteligencia y seguridad en el marco de las dictaduras militares de Brasil, Argentina y Chile. Perspectivas de análisis y puntos de comparación». Papeles de Trabajo 10 (17). ISSN 1851-2577. Consultado el 28 de septiembre de 2023. 
4. ↑ ^{a b} Salazar Pérez, Dannae (2020). Cerro, tortura, mar: aproximaciones a la represión política en los primeros años de la dictadura cívico-militar en la ‘Colina del Terror’ de Valparaíso. El Cuartel Silva Palma 1973-1976. Consultado el 28 de septiembre de 2023. 
5. ↑ Maravall Yáguez, Javier. TORTURA SEXUAL EN CHILE: LAS PRESAS POLÍTICAS BAJO LA DICTADURA MILITAR (1973-1990). 
6. ↑ Maldonado Prieto, Carlos. «Profesionalismo del Personal de Inteligencia:El Caso de Chile». Profesionalismo de Inteligencia en las Américas. Consultado el 28 de septiembre de 2023.