Esta enzima (EC 2.3.1.87) cataliza la conversión de serotonina en N-acetilserotonina, utilizando el cofactor acetil-CoA como donador de grupos acetilo.

CH₃CO-S-CoA +   → HS-CoA +  

La proteína codificada por este gen pertenece estructuralmente a la familia GCN5 de N-acetiltransferasas (GNATs). La serotonina N-acetiltransferasa es la enzima penúltima de la ruta de síntesis de melatonina y se considera la principal enzima limitadora de flujo de la ruta y que determina el ritmo diario de producción de melatonina en la glándula pineal de mamíferos. En otros vertebrados esta enzima aparece en otros lugares además de la glándula pineal contribuyendo a la síntesis extrapineal de melatonina. La melatonina es esencial para múltiples funciones diarias y estacionales como la reproducción, la función del reloj circadiano localizado en el núcleo supraquiasmático^[4]​ y participa en el ciclo vigilia/sueño. Esta enzima se inactiva rápidamente cuando los animales son expuestos a la luz durante la noche. La secuencia de la proteína en la especie humana es idéntica en un 80% a la AANAT de la rata y la oveja. Mutaciones en la secuencia pueden estar asociadas a enfermedades como alteraciones en el comportamiento y en el ciclo vigia/sueño.^[2]​

La familia GCN5 comparte cuatro motivos conservados dentro de su secuencia denominados A-D. El Motivo B contribuye a la unión de la serotonina. La estructura de la serotonin N-acetiltransferasa se ha determinado por difracción de rayos X (XRD) a una resolución de 1,80 angstroms.^[1]​ El peso molecular es 24121,55 dalton. La cadena polipeptídca tiene una longitud de 207 residuos. La estructura secundaria consiste en α-hélices (28%: 10 hélices; 60 residuos y β-hojas (23%: 9 hebras; 48 residuos).l

• Acetiltransferasa

• MeSH: Serotonin+N-Acetyltransferase (en inglés)
• Jassal/D'Eustachio/reactome.org: N-acetylation of serotonin (enlace roto disponible en Internet Archive; véase el historial, la primera versión y la última).