El origen del espacio se encuentra en la construcción de un cuerpo de dos pisos adosado al lado este de la Torre Reina, ampliándola en sus pisos bajos y principal. El piso debió de realizarse entre 1606-1608, coincidiendo con la vuelta de la corte desde Valladolid.

En 1634 se comenzó un oratorio de mayores proporciones al este del oratorio de ordinario. La finalidad de este nuevo oratorio sería ofrecer un espacio de mayores proporciones para las ceremonias religiosas que se realizaban en el cuarto de la Reina (confirmación de príncipes, rogativas por embarazos y partos, etc.).^[2]​

El oratorio se situaba en la planta principal del Alcázar, en concreto en el lado este de la Torre de la Reina. El espacio era rectangular, con un balcón hacia la fachada principal del Alcázar, y dos balcones hacia el este del edificio (que era continuado por la Casa del Tesoro).^[3]​

La decoración interior del oratorio es conocida solo por una breve referencia por Vicente Carducho en su obra Dialogos de la pintura:^[4]​

Reparè en el Oratorio dela Reina N.S. adóde esta dos quadros al olio de mano de Bartolome Carduchi mi Maestro: el vno deyna Cena, y el otro quádo crucifică à Chrifto: cosa superior en el arte, y estudio

El óleo de la Santa Cena de Bartolomé Carducho se conserva hoy en el Museo del Prado.^[5]​

1. ↑ Carlos Varona, María Cruz de (2006). «Entre el riesgo y la necesidad: embarazo, alumbramiento y culto a la Virgen en los espacios femeninos del Alcázar de Madrid (siglo XVII)». Arenal: Revista de historia de las mujeres 13 (2): 263-290. ISSN 1134-6396. Consultado el 25 de agosto de 2022. 
2. ↑ Martínez Leiva, Gloria (6 de febrero de 2018). «El Oratorio de la reina en el Alcázar de Madrid. Una propuesta de reconstrucción». Investigart. Consultado el 25 de agosto de 2022. 
3. ↑ Lapuerta Montoya, Magdalena de (2009). «Los programas inconográficos que decoran las estancias de la reina Margarita de Austria. Retrato alegórico-moral de la Reina, espejo de virtudes». Las relaciones discretas entre las Monarquías Hispana y Portuguesa: Las Casas de las Reinas (siglos XV-XIX), Vol. 2, 2009, ISBN 978-84-96813-18-2, págs. 1121-1148 (Polifemo): 1121-1148. ISBN 978-84-96813-16-8. Consultado el 16 de marzo de 2025. 
4. ↑ Carducho, Vicente (1633). Francisco Martínez, ed. Dialogos de la pintura: su defensa, origen, ess[n]cia, definicion, modos y diferencias .... Madrid. pp. 156-157. Consultado el 16 de marzo de 2025. 
5. ↑ Bustamante García, Agustín (1969). «Documentos para el estudio del arte en Castilla, los Carduchos». Boletín del Seminario de Estudios de Arte y Arqueología: BSAA (34): 239-246. ISSN 0210-9573. Consultado el 16 de marzo de 2025. 

• Barbeito, José Manuel (1992). Alcázar de Madrid. Comisión de Cultura, Colegio Oficial de Arquitectos de Madrid. ISBN 978-84-7740-066-0. Wikidata Q110543470. Consultado el 25 de agosto de 2022. 
• Martínez Leiva, Gloria; Rodríguez Rebollo, Angel (2015). El inventario del Alcázar de Madrid de 1666: Felipe IV y su colección artística. Consejo Superior de Investigaciones Científicas, CSIC. ISBN 978-84-16335-15-2. Wikidata Q110408223. Consultado el 3 de septiembre de 2024.