El Registro Mundial de Especies Marinas^[1]​ y FishBase^[2]​ reconocen las siguientes especies en el género:

• Neoglyphidodon bonang (Bleeker, 1852)
• Neoglyphidodon carlsoni (Allen, 1975)
• Neoglyphidodon crossi Allen, 1991
• Neoglyphidodon melas (Cuvier, 1830)
• Neoglyphidodon mitratus Allen & Erdmann, 2012
• Neoglyphidodon nigroris (Cuvier, 1830)
• Neoglyphidodon oxyodon (Bleeker, 1858)
• Neoglyphidodon polyacanthus (Ogilby, 1889)
• Neoglyphidodon thoracotaeniatus (Fowler & Bean, 1928)

• Allen, G.R., N.J. Cross y C.J. Allen 2006: Zoological Catalogue of Australia. Volum 35. Fishes.
• Eschmeyer, William N., ed. 1998. Catalog of Fishes. Special Publication of the Center for Biodiversity Research and Information, núm. 1, vol 1-3. California Academy of Sciences. San Francisco, California, Estados Unidos. 2905. ISBN 0-940228-47-5.
• Helfman, G., B. Collette y D. Facey: The diversity of fishes. Blackwell Science, Malden, Massachusetts, Estados Unidos, 1997.
• Moyle, P. y J. Cech.: Fishes: An Introduction to Ichthyology, 4a. edición, Upper Saddle River, Nueva Jersey, Estados Unidos: Prentice-Hall. Año 2000.
• Nelson, J.: Fishes of the World, 3a. edición. Nueva York, Estados Unidos: John Wiley and Sons. Año 1994.
• Swainson W. 1839. The natural history and classification of fishes, amphibians, & reptiles, or monocardian animals. Londres. Nat. Hist. & Class. v. 2. i-vi + 1-448.
• Wheeler, A.: The World Encyclopedia of Fishes, 2a. edición, Londres: Macdonald. Año 1985.

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