La Medalla Leeuwenhoek fue establecida en 1877 por la Real Academia de Artes y Ciencias de los Países Bajos (Koninklijke Nederlandse Akademie van Wetenschappen, KNAW) en honor al microscopista neerlandés Anton van Leeuwenhoek. Se concede cada diez o doce años al científico al que se haya considerado que ha realizado la contribución más significativa a la microbiología durante la década precedente.

Hasta la edición de 2003 el premio era concedido por la KNAW, pero a partir de la edición de 2015 el premio está organizado por la Real Sociedad Neerlandesa de Microbiología (Koninklijke Nederlandse Vereniging voor Microbiologie, KNVM).^[1]​ En 2023 se otorgó la medalla a la profesora estadounidense Jillian Banfield, primera mujer en recibir este galardón.^[2]​

Esta medalla se ha otorgado a las siguientes personas:

• 1877 Christian Gottfried Ehrenberg, Alemania
• 1885 Ferdinand Cohn, Polonia
• 1895 Louis Pasteur, Francia
• 1905 Martinus Beijerinck, Países Bajos
• 1915 David Bruce, Reino Unido
• 1925 Félix d'Herelle, (por entonces) Egipto
• 1935 Serguéi Vinogradski, Rusia
• 1950 Selman Waksman, Estados Unidos
• 1960 André Lwoff, Francia
• 1970 Cornelius van Niel, Estados Unidos
• 1981 Roger Stanier, Canadá
• 1992 Carl Woese, Estados Unidos
• 2003 Karl Stetter, Alemania
• 2015 Craig Venter, Estados Unidos
• 2023 Jillian Banfield, Estados Unidos