El ritual con el cuy varía en función de la tradición y/o linaje del curandero o curandera. Se utiliza un cuy macho si el paciente es hombre y un cuy hembra si es mujer. Por lo general, se prefiere un cuy de color negro, y mayor de un mes y con menos de 3 meses de nacido.^[7]​^[8]​

El curandero, luego de unas invocaciones y en ocasiones una limpia con agua florida o plantas medicinales (ej. ruda, ortiga o marco), coge el cuy y lo empieza a frotar por el cuerpo del paciente desde la cabeza hasta los pies,^[9]​^[10]​ o al revés, desde los pies hasta la cabeza.^[8]​

Luego, el curandero lo desuella, retirándole el pellejo con las uñas. En la sierra de Áncash, la sangre que brota es recolectada en un recipiente y mezclada con agua. La observación de las características de la mezcla resultante es usada para interpretar el estado de salud del paciente.^[8]​

Posteriormente, el curandero le hace un corte en el abdomen para observar las vísceras. De acuerdo al estado de la cabeza, la piel, las membranas, los órganos internos y los huesos se indican tratamientos para restaurar la salud del paciente.^[2]​

El psiquiatra huaracino Federico Sal y Rosas describió otra forma de diagnosticar enfermedades en el contexto geográfico del Callejón de Huaylas en Áncash: la qatipa, en donde se adivina a través del chacchado de hojas de coca (Erythroxylum coca) y el uso complementario del tabaco (Nicotiana tabacum).^[11]​^[12]​

Es común que se pueda dar la «limpia» durante el diagnóstico. La «limpia» se entiende desde el curanderismo andino como la 'succión' a través del ritual de la entidad patógena que habita en el cuerpo del paciente en el plano suprasensible y desplazarlo a otro soporte, en este caso al cuy.^[13]​^[14]​

Es posible utilizar otros elementos en el ritual de «limpia» como plantas medicinales, un huevo o una gallina en lugar de un cuy.^[15]​

Es una práctica del curanderismo en las regiones de la costa y Andes de Perú, especialmente en las regiones de Áncash, Cajamarca, Junín, La Libertad y Lambayeque.^[16]​^[17]​^[18]​ También está presente en las provincias andinas de Ecuador.^[19]​^[20]​^[21]​

Forma parte importante de los rituales de la mesa norteña en Perú y Ecuador.^[22]​^[23]​

En el siglo XVI el mercedario español Martín de Murúa en su Historia General del Perú. Origen y descendencia de los incas, donde se trata, así de las guerras civiles incas, como de la entrada de los españoles menciona el uso de los cuyes en las curaciones que describe como un «abominable modo de curar, fundado en superstición y hechicería»:

Estos, pues, se van por los pueblos diciendo que tienen licencia de los obispos y visitadores y de los padres, y curan enfermos sobándoles las partes que les duelen y, a vueltas desto, de secreto sacrifican y con coca, sebo y cuyes, les untan el cuerpo y las piernas y chupan la parte dolorosa del enfermo, y dícenles que sacan gusanos, pedrezuelas y sangre, y se las muestran al enfermo, diciendo que se las sacaron y que ya ha salido el mal con aquello.

Murúa (1611-1613): folio 278r.
Cap. XXVI, Historia General del Perú. Origen y descendencia de los incas^[24]​

• Shoqma con cuy,^[25]​ jaca shoqpi, jaca cupé (del quechuua ancashino, haka cupay), limpia con cuy, soba con cuy, jubeo con cuy, cuypichay,^[9]​ caipada,^[5]​ huywa (en Junín)^[26]​
• En aimara: wank'u yati ('lo que sabe el cuy')^[26]​

El extirpador de idolatrías Pablo José de Arriaga recoge en el siglo XVI el nombre quechua de hacaricuc o cuyricuc, para el especialista andino de la limpia con cuy.^[27]​

El 13 de septiembre de 2017, PETA —una organización por los derechos de los animales y en contra de su uso como vestido, alimento y experimentos— declaró estar en contra de la práctica tradicional describiendo el ritual como una forma «violentar a un paciente y de torturar a un conejillo de indias».^[28]​^[29]​

• Medicina tradicional andina
• Mesa norteña
• Lectura de hojas de coca
• Adivinación

• Rimachi, Edith (2003). «Evento y discurso: La práctica andina del jubeo o “limpia con cuy”. ». En Espino Relucé, Gonzalo, ed. Tradición oral, culturas peruanas. Una invitación al debate (Universidad Nacional Mayor de San Marcos): 277-284. Consultado el 17 de diciembre de 2019. 
• Polia Meconi, Mario (1996). Despierta, remedio, cuenta... : adivinos y médicos del Ande (1 edición). Lima: Pontificia Universidad Católica del Perú, Fondo Editorial. pp. 590-601. ISBN 9972420507. 
• Morales, Edmundo (1995). The guinea pig: healing, food, and ritual in the Andes (en inglés). University of Arizona Press. Consultado el 17 de diciembre de 2019. 
• Melchor Arroyo, Salomón; Reyna Pinedo, Víctor (1994). Soba del cuy y diagnóstico en la medicina tradicional peruana. Lima. p. 101. 
• Sal y Rosas, Federico (1970). «Observaciones en el folklore psiquiátrico del Perú». Actas y Memorias del XXXIX Congreso Intern. de America (Lima: Instituto de Estudios Peruanos) 6: 249-262. 
• Sal y Rosas, Federico (1958). «Mito de Jani o susto de la medicina indígena del Perú». Revista Psiquiátrica Peruana (Lima) (1, 2): 103-132.