Planta epífita, de tamaño medio, cespitosa, erecta a suberecta, de hasta 11,5 cm de altura. Raíces delgadas, flexibles, filiformes, de aproximadamente 1 mm de diámetro. Ramicules esbeltos, erectos a suberectos, robustos, de hasta 8 cm de longitud, encerradas por 2 a 6 vainas lepantiformes, surcadas, ciliadas microscópicamente a lo largo de los márgenes, con una ostia dilatada, acuminadas. Hojas erguidas, coriáceas, elípticas, agudas, el ápice emarginado con un apículo abaxial en el medio, 1,5 a 3,5 × 1,0 a 1,5 cm, la base cuneada se contrae en un peciolo de 4 a 6 mm de largo. Inflorescencia 2 a 3 racimos congestionados, sucesivamente de pocas flores de hasta 7 cm de longitud, incluido el pedúnculo, suelto, disforme, flexuso, situado debajo de la hoja por un pedúnculo filiforme de hasta 2,5 cm de longitud; bráctea floral deltoide, aguda, de 1,5 a 3,6 mm de longitud; pedicelo terete, persistente, de 3 a 4 mm de longitud. Ovario con 3 alas con flecos, costado, de 1,0 a 1,3 mm de longitud.

Flores con sépalos de color amarillo claro, el lateral medialmente impregnado de color burgundy, pétalos amarillos con los lóbulos superiores impregnados de borgoña hacia la base y de naranja a lo largo de los márgenes, labelo color azafrán impregnado marginalmente de naranja, la base de las hojas de color carmesí, columna blanca, tapa de antera rosa. Sépalos similares en forma y tamaño, ovalados, atenuados, carinados a lo largo de las venas. Sépalo dorsal con tres venas, ligeramente cóncavo, 1,0 - 1,3 × 0,3 cm, conificado en los sépalos laterales durante 2 mm. Sépalos laterales con dos venas, fuertemente revolutos en posición natural, 1,0 × 0,4 cm, connados alrededor de 6 mm. Pétalos microscópicamente pubescentes, transversalmente bilobulados, con un pequeño ángulo marginal entre los lóbulos, 1,0 × 4,5- 5,0 mm, el lóbulo superior apenas triangular, agudo, recurvado, 3,0-3,5 mm de largo, el lóbulo inferior ovalado a triangular, ligeramente encorvado, agudo, con un margen interno de retusa, 1,0-1,5 mm de largo. El labio bilaminado, las hojas ovaladas-lanceoladas con extremos redondeados, microscópicamente pubescente, de 2 × 1 mm de largo, los conectivos cuneados, el cuerpo, connate a la base de la columna, el seno amplio con un apéndice bipartito compuesto de dos procesos lineales, clavados. La columna terete, de 1,5 mm de longitud, la antera dorsal y el estigma apical. Capuchón de la antera orbicular a cordada, cuculada, 0,25 mm de ancho. Polinias amarillas, dos, piriforme, 0,3 mm de largo.^[1]​

Se encuentra en Colombia como una orquídea epífita cespitosa de pequeño tamaño, que prefiere el clima frío, habita el bosque húmedo de montaña, en los troncos y ramas de los árboles en alturas de 2000 a 2800 metros.^[1]​

Lepanthes kokonuko fue descrita por J.S. Moreno y Pizzo-Florez, publicado en Lankesteriana 229-239. 2020.^[1]​

Etimología

Ver: Lepanthes

kokonuko: epíteto significa “gente de montaña” tal como lo son las comunidades de este pueblo que veneran como sitio ancestral la cadena volcánica “Kokonukos”, la cual comprende 15 centros eruptivos.