Botaka, durante su carrera juvenil pasó por el RKVV Westlandia, ADO Den Haag, de Países Bajos, Anderlecht, Beveren, Lokeren y Brujas, todos de Bélgica.

Se incorporó al Brujas desde Lokeren el 23 de enero de 2012, firmando por un contrato de 2 años y medio. Para ayudar a ganar experiencia para el primer equipo, Botaka se unió al club portugueses Belenenses a préstamo en 2013. El club también estipulaba una opción para comprar a Botaka por un acuerdo permanente. Sin embargo, debido a un error administrativo, Botaka no pudo jugar partidos oficiales para el club.

Luego de su paso por Portugal, vuelve al Brujas para rescindir su contrato y firmar un contrato como agente libre en junio de 2013 al Excelsior de Países Bajos de la Eerste Divisie (Segunda división). En su primera temporada, disputó 36 partidos y marcó 10 goles que ayudaron al equipo a terminar en la tercera posición y así, conseguir la promoción mediante los playoffs a la Eredivisie. En su segunda temporada y ya en la máxima categoría neerlandesa, jugaría 33 encuentros y marcaría solo un gol, con sus presencias en el campo de juego, ayudó a que el equipo permanezca en primera.

En el día de fecha límite de transferencia, el 1 de septiembre de 2015, Botaka firmó para el club inglés Leeds United en un acuerdo de dos años por 1 millón de libras, con una opción del club por otros dos años.^[2]​^[3]​

Después de representar a la selección de fútbol sub-19 de los Países Bajos en 2012, fue citado a la selección de fútbol de la República Democrática del Congo haciendo su debut el 28 de marzo de 2015 frente a Irán.

El 9 de junio de 2015, marcó su primer gol en el empate 1-1 frente a Camerún.

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