Esta especie fue descrita originalmente en el año 2005 por los ictiólogos Gastón Aguilera y Juan Marcos Mirande.^[2]​

Localidad tipo

• «Argentina, Provincia de Tucumán, departamento Trancas, río Vipos (26°28′S 65°20′W), 5 km desde la Ruta Nacional 9». El holotipo es: CI-FML 3828. Los paratipos son: CI-FML 3829 (4), AI 163 (6), ANSP 180781 (6), CI-FML 3840.

Como otras especies de Jenynsia presenta un gonopodio tubular formado principalmente por las 3ª, 6ª, y 7ª aleta anal y por tener en los adultos dientes de oclusión tricúspide en la mandíbula externa. El color del cuerpo es gris-verdoso claro; en los lados muestra seis a ocho líneas oscuras y finas o rayas longitudinales punteadas. Las aletas son incoloras. Ambos sexos presentan la misma coloración. La hembra no fertilizada tiene un punto anaranjado situado a la derecha o la izquierda de la aleta anal. El macho mide 30 mm, siendo bastante más delgado y pequeño que la hembra.

Jenynsia tucumana es endémica del noroeste de la Argentina, en la cuenca del alto río Salí.

Tucumán

• departamento Burruyacú: río Medina, El Sunchal, río Calera-Ayo, río Los Chorrillos, río Las Salas
• departamento Tafí Viejo: El Siambón, río Grande
• departamento Trancas: río Tapia

Salta

• departamento Candelaria: río La Candelaria.

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