Javier llegó a la cantera del Athletic Club en edad alevín, con apenas diez años. En la temporada 2005-06 promocionó a su segundo filial, el CD Basconia. Un año más tarde ascendió al Bilbao Athletic, donde jugó nueve encuentros. En la temporada 2007-08 fue cedido a la UE Lleida, conjunto con el que no llegó a debutar, ya que el Bilbao Athletic decidió apostar por Iago Herrerín y Raúl Fernández. En enero de 2008, después de no llegar a debutar en el club catalán, regresó para al CD Basconia llegando a jugar tres encuentros. En la campaña 2008-09 se incorporó al Bilbao Athletic, jugando ocho encuentros.^[1]​

En 2009, después de no renovar su contrato, firmó por el filial de la Real Sociedad.^[2]​ Permaneció tres temporadas en el filial donostiarra, sin llegar a debutar con el primer equipo aunque sí entró en alguna convocatoria durante la temporada 2009-10. Su siguiente destino fue la SD Logroñés, al que llegó en 2013 tras seis meses sin equipo.^[3]​ En enero de 2015, nuevamente después de seis meses sin equipo, se enroló en la Gimnástica de Torrelavega de Tercera División.^[4]​ En verano de 2015 fichó por la UD Somozas, donde jugó habitualmente durante año y medio.^[5]​^[6]​ Finalizó la campaña 2016-17 en las filas del Mérida AD.^[7]​ Inició la temporada 2017-18 en las filas del FC Jumilla y, posteriormente, en la SD Ponferradina.^[8]​

A finales de enero de 2019 firmó un contrato de seis meses con el JD Somorrostro de Tercera División.^[9]​^[10]​ Tras una campaña inactivo, se unió al Urduliz FT.^[11]​ En julio de 2021 firmó por la SD Leioa, que jugaría en Tercera RFEF.

Mandaluniz fue internacional sub-17 y sub-18 con la Selección española.^[12]​ Fue convocado por Juan Santisteban para participar en el Mundial sub-17 de 2003, donde fue titular en los cuatro últimos encuentros,^[13]​^[14]​ y en la Eurocopa sub-17 de 2004. En ambos torneos coincidió con Antonio Adán.^[1]​

1. ↑ ^{a b} «Mandaluniz: «Soy más conocido fuera de Bizkaia que aquí»». El Correo. 22 de enero de 2019. Consultado el 23 de enero de 2019. 
2. ↑ «Javier Mandaluniz, del Athletic, viene al Sanse». El Diario Vasco. 6 de julio de 2009. Consultado el 23 de enero de 2019. 
3. ↑ ««Fue muy duro ver que se cerraba el mercado y que yo no tenía equipo para jugar» - GARA». gara.naiz.eus. Consultado el 23 de enero de 2019. 
4. ↑ RSGT_1907 (6 de mayo de 2015). «Charlamos con Mandaluniz». Real Sociedad Gimnástica de Torrelavega | Web Oficial. Consultado el 23 de enero de 2019. 
5. ↑ Labarga, Nacho (24 de marzo de 2016). «Mandaluniz, el cerrojo 'renacido' que aúpa al Somozas». Marca.com. Consultado el 23 de enero de 2019. 
6. ↑ «El cerrojo del Somozas es de Bilbao». La Voz de Galicia. 21 de marzo de 2016. Consultado el 23 de enero de 2019. 
7. ↑ VAVEL.com (26 de enero de 2017). «Javi Mandaluniz llega a la portería del Mérida». VAVEL. Consultado el 23 de enero de 2019. 
8. ↑ León, Diario de. «Javier Mandaluniz, primer refuerzo». Diario de León. Consultado el 23 de enero de 2019. 
9. ↑ «Maka encuentra el hueco perfecto. Deia, Noticias de Bizkaia». Deia. Archivado desde el original el 1 de febrero de 2019. Consultado el 31 de enero de 2019. 
10. ↑ «Mandaluniz regresa a la acción en el Somorrostro». Mundo Deportivo. 1 de febrero de 2019. Consultado el 4 de febrero de 2019. 
11. ↑ «Javier Mandaluniz, portero del Urduliz, echa el cerrojo». www.deia.eus. Consultado el 10 de marzo de 2021. 
12. ↑ «FOTO INTERACTIVA: De la Sub-18 en Turquía a estrellas de la Selección». foto-interactiva-sub-18-turquia-estrellas-seleccion. 11 de agosto de 2015. Consultado el 23 de enero de 2019. 
13. ↑ «Un gol de oro mete a los sub'17 en la final del Mundial -». www.elmundo.es. Consultado el 23 de enero de 2019. 
14. ↑ «Brasil acaba con el sueño español en el Mundial sub'17 -». www.elmundo.es. Consultado el 23 de enero de 2019. 

• Ficha oficial de Javier Mandaluniz en Athletic Club