Koenigsberger nació en Berlín, hijo del arquitecto Georg Koenigsberger (d. 1932), y Käthe, hermana del físico Max Born.^[3]​^[4]​^[5]​ Su hermano mayor fue el arquitecto Otto Königsberger.^[1]​ Aunque su familia eran cristianos luteranos, fueron clasificados como judíos mischlinge por la Alemania nazi, ya que sus abuelos habían sido judíos ateos.^[5]​ Su familia inmediata huyó de Alemania antes de 1939 por consejo de Otto.^[1]​ Recibieron ayuda de su tío Max y de los cuáqueros, ya que las organizaciones judías se negaron a ayudarles por no ser judíos practicantes.^[5]​

Koenigsberger fue elegido Miembro de la Academia Británica en 1989. Fue hecho también Comendador de la Orden de Isabel la Católica por el rey Juan Carlos I de España en 1997.^[4]​ El mismo año se le hizo Miembro Honorífico por el King's College de Londres.^[4]​

• The Government of Sicily under Philip II of Spain: A Study in the Practice of Empire (Staples Press, 1951).
  • Reeditado como The Practice of Empire (Cornell University Press, 1969).
• "The Empire of Charles V in Europe", in G. R. Elton (ed.), The New Cambridge Modern History, vol. 2 (Cambridge 1958), pp. 301–33
• "Decadence or Shift? Changes in the Civilization of Italy and Europe in the Sixteenth and Seventeenth Centuries", Royal Historical Society, 5.10 (1960).
• "Western Europe and the Power of Spain", in R. B. Wernham (ed.), The New Cambridge Modern History, vol. 3 (1968), pp. 234–318
• with G. L. Mosse, Europe in the Sixteenth Century (Cornell University Press, 1968); 2nd ed. with G. L. Mosse & G.Q. Bowler (Longman, 1989), "A General History of Europe" series.
• Estates and Revolutions: Essays in Early Modern European History (Cornell University Press, 1971).
• The Habsburgs and Europe 1516-1660 (Cornell University Press, 1971).
• "The Statecraft of Philip II", European Studies Review, 1 (1971), 1–22
• "The Unity of the Church and the Reformation", Journal of Interdisciplinary History 1 (1971), 407–17 online
• Luther: A Profile (editor, 1973), "World Profiles" series.
• "Republics and Courts in Italian and European Culture in the Sixteenth and Seventeenth Centuries." Past & Present, no.83 (1979): 32-56 online.
• Politicians and Virtuosi: Essays in Early Modern History (Hambledon Press, 1986).
• A History of Europe, vol. 1: Medieval Europe 400-1500; vol. 2: Early Modern Europe 1500-1789 (Longman, 1987); vol. 3 by Asa Briggs.
• "Composite States, Representative Institutions and the American Revolution." Institute of Historical Research, 62.148 (1989): 135–153
• "Prince and States General: Charles V and the Netherlands", Royal Historical Society, 6.4 (1994).
• Monarchies, States Generals and Parliaments: The Netherlands in the 15th and 16th Centuries (Cambridge University Press, 2001).