Comenzó a estudiar Medicina en la Universidad Complutense, carrera universitaria que no concluyó. También estudió violonchelo en el Conservatorio de Madrid, viola de gamba con August Wenzinger y dirección de orquesta con Sergiu Celibidache.^[3]​

Se dedicó a la Musicoterapia y al estudio de los códices, manuscritos, miniaturas, cerámicas y esculturas antiguas y para reconstruir instrumentos musicales creó su propio taller de lutería.

Se especializó, sobre todo, en los instrumentos de cuerda, vihuela, laúd, zanfona^[4]​ y viola da gamba.^[5]​

En 1964 fundó Atrium Musicae de Madrid de la que también fue su director.^[6]​^[7]​ En esta agrupación han participado, entre otros, Eduardo Paniagua,^[8]​^[9]​ Luis Paniagua, Carlos Paniagua, Carmen Paniagua, Beatriz Amo, Cristina Úbeda, Pablo Cano, Begoña Olavide, Marcial Moreiras, Cristina García, Mariano Martín, Eugenio Urbina, Javier Coello, Máximo Pradera,^[10]​^[11]​^[12]​ Jacobo Durán-Loriga, Luis Delgado y Andreas Prittwitz.^[13]​

Ha interpretado y dirigido numerosos conciertos de música antigua.^[14]​^[15]​^[16]​

Ha grabado varios discos, tanto con la agrupación musical Atrium Musicae, en solitario^[17]​^[18]​como en colaboración de otros artistas como Lucía Bosé,^[19]​ María del Mar Bonet^[19]​^[20]​y Rita Marley.^[21]​^[22]​

Participó en la grabación de las bandas sonoras de las películas El jardín de las delicias (1970) y Carta de amor de un asesino (1973). Intervino en La leyenda del alcalde de Zalamea (en la que Antón García Abril compuso el Romance del ciego interpretado por Gregorio Paniagua). Compuso la música de las películas La cruz de Iberia (1990) y Magic Hunter (1974).

• Las Cantigas de Santa María del Rey Alfonso X El Sabio. (Capilla Musical y Escolanía de Santa Cruz del Valle de Los Caídos, Atrium Musicae, Gregorio Paniagua, Jens Uwe Eggers, Laurentino Sáenz De Buruaga, Jose Luis Ochoa De Olza).1968
• La Música en Cataluña hasta el siglo XIV. Capilla Musical y Escolanía de Santa Cruz del Valle de Los Caídos, Atrium Musicae. 1968
• Ars Nova S.XIV: Missa De Barcelona / Música Profana . Atrium Musicae. Dir. Gregorio Paniagua. 1975
• Tarentule-Tarentelle. Atrium Musicae de Madrid. Dir. Gregorio Paniagua . 1976
• Musica Iucunda. Atrium Musicae. 1976^[23]​
• Musique Arabo-Andalouse. Atrium Musicae de Madrid. Dir. Gregorio Paniagua. 1977
• Las Cantigas de Hita de Alfonso X, El Sabio. Atrium Musicae, Gregorio Paniagua. 1978
• Codex Glúteo. Atrium musicae, Gregorio Paniagua. 1978.^[24]​^[25]​
• Thibaut de Navarre. Atrium Musicae de Madrid / Gregorio Paniagua. 1979
• Musique de La Grèce Antique. Atrium Musicae de Madrid, Gregorio Paniagua. 1979
• Recercadas. Diego Ortiz - Atrium Musicae de Madrid, Gregorio Paniagua. 1979
• Batiscafo. Gregorio Paniagua. 1980^[26]​
• La Spagna XV, XVI, and XVII Centuries . Atrium Musicae de Madrid, Gregorio Paniagua. 1980
• Villancicos - Chansons Populaires Espagnoles des 15e Et 16e Siècles . Atrium Musicae de Madrid, Gregorio Paniagua. 1980
• Las Indias de España, Musica Precolombina y de Archivos del Viejo y Nuevo Mundo. Atrium Musicae de Madrid, Dir. Gregorio Paniagua. 1981
• Io Pomodoro. Lucia Bosé, Gregorio Paniagua. 1981
• La Folia. Gregorio Paniagua. 1982
• Fandango. Gregorio Paniagua. 1991
• Monodia Cortesana Medieval (S. Xll-Xlll) - Música Arabigo-Andaluza (S. Xlll) . Carmen Orihuela, María Aragón, Lola Quijano, Jens-Uwe Eggers, Atrium Musicae, Orquesta Marroquí de Tetuán, Gregorio Paniagua, Abdessadak Chkara, Jose Luis Ochoa de Olza. 1994
• Spectacles for Tribuffalos. Rita Marley, Ignacio Scola, Gregorio Paniagua. 1995
• Camino de Santiago. Escolanía y 'Schola' de la Abadía de Santa Cruz del Valle de los Caídos / Luis Lozano, Atrium Musicae / Gregorio Paniagua & Studio Der Frühen Musik / Thomas Binkley. 2007
• Ars Nova S.XIV: Missa De Barcelona / Música Profana. Atrium Musicae, Gregorio Paniagua. 2008^[27]​

1. ↑ «Gregorio Paniagua - Director ATRIUM MUSICAE - Compositor y fundador». GREGORIO PANIAGUA. Consultado el 10 de junio de 2025. 
2. ↑ Metason. «Gregorio Paniagua». ArtistInfo (en inglés). Consultado el 10 de junio de 2025. 
3. ↑ «Gregorio Paniagua on Apple Music». Apple Music - Web Player (en inglés estadounidense). Consultado el 11 de junio de 2025. 
4. ↑ «ANOTACIONES HISTÓRICAS SOBRE LA ZANFONA». Biblioteca Virtual Miguel de Cervantes. Consultado el 11 de junio de 2025. 
5. ↑ «PressReader.com - Digital Newspaper & Magazine Subscriptions». www.pressreader.com. Consultado el 10 de junio de 2025. 
6. ↑ «GREGORIO PANIAGUA • Página Principal». CANCIONEROS.COM. Consultado el 10 de junio de 2025. 
7. ↑ «Gregorio Paniagua age, hometown, biography». Last.fm (en inglés). Consultado el 11 de junio de 2025. 
8. ↑ Neira, Fernando (8 de febrero de 1999). «LAS TRES CULTURAS DE EDUARDO PANIAGUA». El País. ISSN 1134-6582. Consultado el 10 de junio de 2025. 
9. ↑ Marí, Cristina (21 de agosto de 2010). ««Me siento cercano a los trovadores»». Diario de Ibiza. Consultado el 11 de junio de 2025. 
10. ↑ Mantilla, Jesús Ruiz (3 de octubre de 2022). «Máximo Pradera: “Con el cáncer he aprendido tarde a comer, pero al menos no me he muerto”». El País. Consultado el 10 de junio de 2025. 
11. ↑ Biestro, Federico (25 de junio de 2022). «Máximo Pradera: "Si alguien dice que sólo escucha música clásica, desconfía"». www.publico.es. Consultado el 11 de junio de 2025. 
12. ↑ Ramírez, Ana (5 de mayo de 2022). «Máximo Pradera: "Es increíble, pero a Sinatra 'Strangers in the night' le parecía infumable"». elconfidencial.com. Consultado el 11 de junio de 2025. 
13. ↑ Franco, Enrique (19 de junio de 1982). «Música y humor en la nueva faceta de Atrium Musicae». El País. ISSN 1134-6582. Consultado el 10 de junio de 2025. 
14. ↑ «Canciones de lujuria medieval». Atlántica XXII. 31 de diciembre de 2018. Consultado el 10 de junio de 2025. 
15. ↑ «Caliope Paniagua: «Almodóvar nos hizo un encargo para ‘Dolor y gloria' y para otros proyectos»». Ultima Hora. 9 de agosto de 2020. Consultado el 9 de junio de 2025. 
16. ↑ Manrique, Diego A. (30 de abril de 2024). «Los años imperiales de Hispavox». El País. Consultado el 10 de junio de 2025. 
17. ↑ «Batiscafo, by Gregorio Paniagua». Munster Records. Consultado el 11 de junio de 2025. 
18. ↑ Marcapasos, Discos, PANIAGUA, GREGORIO - Batiscafo, consultado el 11 de junio de 2025 .
19. ↑ ^{a b} G, Ricardo Jonás (30 de mayo de 2025). «Le Parolier: «Dansa de la primavera», de Maria del Mar Bonet y Gregorio Paniagua - Jot Down Cultural Magazine». Consultado el 10 de junio de 2025. 
20. ↑ https://mariadelmarbonet.com/wp-content/uploads/2016/10/85-Premsa-Anells-2_low.pdf
21. ↑ Tecglen, Eduardo Haro (28 de junio de 1995). «Ignacio Scola y Gregorio Paniagua sacan a Rita Marley del 'reggae'». El País. ISSN 1134-6582. Consultado el 10 de junio de 2025. 
22. ↑ Galindo, Bruno (5 de agosto de 1996). «Rita Marley brilla en el Festival Sonidos del Mundo». El País. ISSN 1134-6582. Consultado el 10 de junio de 2025. 
23. ↑ País, El (26 de diciembre de 1976). «DISCOS / NOVEDADES». El País. ISSN 1134-6582. Consultado el 10 de junio de 2025. 
24. ↑ Cuevas, Diego (28 de octubre de 2017). «Descubrir más - Jot Down Cultural Magazine». Consultado el 10 de junio de 2025. 
25. ↑ «El infierno del Bosco huele a pedo». El Español. 7 de junio de 2016. Consultado el 10 de junio de 2025. 
26. ↑ «Discópolis 11.141 - Gregorio Paniagua, Atrium Musicae - 19/11/20». RTVE.es. Consultado el 10 de junio de 2025. 
27. ↑ «Gregorio Paniagua». Discogs. Consultado el 10 de junio de 2025. 

• Pagina web
• Canal de Youtube.com
• Gregorio Paniagua en AllMusic
• Gregorio Paniagua en Discogs
• Gregorio Paniagua - Batiscafo (1980)