Dentro de las facultades que le corresponden al gobernador, es ser el órgano ejecutivo del gobierno regional, correspondiéndole presidir el consejo regional y ejercer las funciones y atribuciones que la ley orgánica constitucional determine, en coordinación con los demás órganos y servicios públicos creados para el cumplimiento de la función administrativa. Asimismo, le corresponde la coordinación, supervigilancia o fiscalización de los servicios públicos que dependan o se relacionen con el gobierno regional, sin embargo su figura no es un representante del presidente de la República en la región, para tal representación la ley 20.990 creó el cargo de Delegado Presidencial Regional de Atacama.

Desde el 14 de julio de 2021 el gobernador regional es Miguel Vargas Correa (Ind.), luego de ser electo en las elecciones de 2021 siendo reelegido en las Elecciones regionales de 2024.

El Consejo Regional de la Región de Atacama es un órgano de carácter normativo, resolutivo y fiscalizador, dentro del ámbito propio de competencia del Gobierno Regional, encargado de hacer efectiva la participación de la ciudadanía regional y ejercer las atribuciones que la ley orgánica constitucional respectiva le encomienda.

Está integrado por 14 consejeros elegidos por sufragio universal en votación directa, en las 3 circunscripciones en que se divide la región, que duran 4 años en sus cargos y pueden ser reelegidos hasta por dos periodos.

El consejo regional está compuesto, para el periodo 2025-2029, por:

• Gobiernos Regionales de Chile

• Gobierno Regional de Atacama