Fue hijo de Guevara di Guevara, señor de Savignano, Greci y Orsara; y de Delfina di Loffredo.^[2]​ Por parte de su padre, descendía de una familia noble española asentada en el reino de Nápoles y por parte de su madre a una familia noble oriunda de Nápoles.^[3]​

Tras la muerte de su padre el 21 de octubre de 1550, su madre ejerció de tutora de Giovanni. Su madre compraría para Giovanni en 1563 el feudo de Bovino en la provincia de Capitanata para su hijo Giovanni por 38.000 ducados.

Contrajo matrimonio con Isabella Fragipani della Tolfa, miembro de una importante familia de la nobleza romana. Isabella era hija de Giovanni Frangipane della Tolfa, conde de Serino y su esposa, Francesca Carafa, de ilustre familia napolitana.

El matrimonio tendría distintos hijos:

• Beatrice, casada con Tommaso III Filomarino, principe della Roca.

• Innico, que le sucedería como duque de Bovino y gran senescal del reino de Nápoles. Contrajo dos matrimonios, con descendencia y después entró en la Compañía de Jesús.
• Antonio^[4]​
• Francesco^[4]​

En 1575 Felipe II de España, como rey de Nápoles, elevaría a Giovanni al título de duque de Bovino.

Murió el 10 de enero de 1582 siendo sucedido por su hijo varón primogénito, Innico.

1. ↑ «Famiglia Guevara». Nobili Napoletani. Consultado el 23 de agosto de 2025. 
2. ↑ La nobiltà del Regno delle Due Sicilie per Erasmo Ricca: 1.4 (en italiano) 4. A. De Pascale. 1869. pp. 419-420. Consultado el 23 de agosto de 2025. 
3. ↑ «Famiglia Loffredo». Nobili Napolitani. Consultado el 23 de agosto de 2025. 
4. ↑ ^{a b} «I Guevara di Malta». Nobili Napoletani. Consultado el 23 de agosto de 2025.