Era de Apocalipsis fue concebido en lo que entonces era conocido como la «X-office» (en español: «oficina X»), el área editorial de Marvel Comics dedicada a los títulos relacionados con los X-Men. Bob Harras, Scott Lodbell y Fabian Nicieza fueron quienes tuvieron la idea original del arco narrativo, sobre un mundo donde Júbilo se encuentra en un mundo donde los X-Men son completamente diferentes debido a la muerte prematura de Charles Xavier.^[3]​

Finalmente, el evento desencadenante del arco narrativo fue el asesinato de Xavier antes de que formara a los X-Men, por parte de Legión, su hijo que ha viajado veinte años atrás al pasado. Esto causa una paradoja y origina una línea temporal, de la cual únicamente Bishop está consciente por ser él mismo un viajero en el tiempo.^[3]​^[4]​^[5]​ Esto fue presentado en un preludio llamado La búsqueda de Legión, publicado en X-Factor #109, Uncanny X-Men #320-321, X-Men #40-#41 y Cable #20, de diciembre de 1994 a febrero de 1995.^[5]​^[6]​

Durante cuatro meses, todos los títulos relacionados con los X-Men fueron reemplazados por otros nuevos, ambientados en la línea temporal de Era de Apocalipsis.^[3]​^[7]​ La línea argumental fue un éxito de ventas que gozó de buena aceptación por parte de los lectores, aunque en un principio algunos de ellos mostraban recelo ante la idea de que los cómics que estaban leyendo fueran reemplazados por otros nuevos, especialmente porque al momento de publicarse se entendió que era un cambio permanente.^[3]​^[8]​

Al momento de concluir Era de Apocalipsis, hubo pocas repercusiones en los cómics de Marvel debido a que la línea temporal alterna en la que ocurrió su historia fue destruida por completo y se regresó a la continuidad regular; algunos personajes creados para el arco narrativo se incorporaron a los títulos regulares de X-Men y los eventos de Era de Apocalipsis fueron referidos en el siguiente arco narrativo de los X-Men, relacionado con Onslaught.^[9]​

En 2005, para celebrar el décimo aniversario del arco narrativo, se publicó un one-shot y una serie limitada de seis números también llamada Era de Apocalipsis (en inglés: X-Men: Age of Apocalypse) en la que se establece que la línea temporal de Era de Apocalipsis continuó existiendo como parte del multiverso de Marvel, con la denominación Tierra-295.^[5]​ Tanto el one-shot y la serie limitada fue escrita por Akira Yoshida con dibujo de Chris Bachalo y Tim Townsend entintó los dos primeros números.^[10]​ Situada después de los eventos de X-Men Omega, deshizo muchos elementos de Era de Apocalipsis y presentaba una continuidad similar a la regular del Universo Marvel. La reacción crítica fue generalmente negativa.^{[cita requerida]}

La premisa de Era de Apocalipsis ha sido retomada en varias ocasiones para el título What If...?, que presenta universos alternativos del Universo Marvel.

• What if...? The Age of Xavier. En What if...? (vol. 2) #77, Legión se propone asesinar a Magneto justo cuando él escapa del campo de concentración en el que estaba recluido. A causa de la muerte de Magneto, los mutantes son aceptados por el público y los X-Men son celebridades mutantes, aunque Charles Xavier presiente que algo no está bien.
• What if...? The Age of Apocalypse Had Not Ended? Tony Stark, líder de la resistencia humana, se une a Magneto para ingeniar una vía para salvar a la Tierra de la venida de Galactus. Junto con la comunidad de guerreros humanos por la libertad están Hulk, Sue Storm y el guardaespaldas de Donald Blake, Gwen Stacy. Galactus es finalmente derrotado y destruido por los sobrevivientes de la Era de Apocalipsis.
• What if...? The Age of Apocalypse. En el 2006, Marvel publicó un one-shot What if...? que muestra que hubiera ocurrido si Charles Xavier y Magneto hubieran sido asesinados por Legión, sin que nadie formara a los X-Men. Como resultado, no apareció ningún héroe mutante y Apocalipsis conquista al mundo.

Legión, un mutante con poderes psiónicos extremadamente poderoso hijo de Charles Xavier, viaja atrás en el tiempo para asesinar a Magneto. Xavier se interpone en el intento de asesinato y muere, causando que Legión deje de existir por la «paradoja del padre». Como consecuencia de esto, se crea una nueva línea temporal, en la que Apocalipsis, un mutante inmortal quien ha estado vivo por siglos, inicia su guerra genética de «supervivencia del más fuerte» diez años antes que en la continuidad regular.

En esta línea temporal, Apocalipsis gobierna toda Norteamérica, Nueva York es renombrada como la «Isla de Apocalipsis», la estatua de la Libertad es remplazada por una gigantesca estatua de su figura y Magneto funda a los X-Men. La campaña genocida de Apocalipsis ha causado la muerte de la mayoría de los humanos y los pocos supervivientes habitan en Europa y África, defendidos por una flota de centinelas.

El disturbio de la línea temporal conduce a una onda de cristalización del cristal M’Kraan, que une a todas las realidades, dirigida hacia la Tierra.

Bishop viaja de vuelta en el tiempo para prevenir que la Era de Apocalipsis ocurra, mientras al mismo tiempo ocurre un intercambio nuclear entre el Alto Concilio Humano y Apocalipsis.

Algunos personajes que aparecieron por primera vez en Era de Apocalipsis fueron incorporados a la continuidad regular.^[9]​

• Nate Grey, una versión alternativa de Cable, hijo de Cíclope y Jean Grey,
• Holocausto, un de los jinetes de Apocalipsis,
• Bestia Oscura, la versión alternativa de Bestia, al servicio de Apocalipsis,

• Hombre de Azúcar, un mutante al servicio de Apocalipsis,
• Las versiones alternativas de Dientes de Sable y Blink.

Los títulos que conformaron Era de Apocalipsis han sido compilados en distintos trade paperbacks, así como en un ómnibus publicado en 2012.^[1]​

Debido a la gran cantidad de títulos que forman parte del arco argumental, existen múltiples órdenes recomendados para leerlo. A continuación, se presentan algunos de ellos.

• En X-Men, el episodio, «One Man's Worth» (1995) está inspirado en Era del Apocalipsis.^[13]​^[14]​

• Deadpool & Wolverine (2024) muestra a Deadpool viajando a la línea de tiempo de Era del Apocalipsis para reclutar a su versión de Wolverine, pero es brutalmente atacado por este último.

• X-Men: Reign of Apocalypse (2001) para Game Boy Advance se basa vagamente en la historia de la Era de Apocalipsis. En esta versión, los X-Men viajan accidentalmente a un universo alternativo donde Apocalipsis se ha apoderado del mundo y la mayoría de los X-Men se han convertido en sus secuaces.
• X-Men Legends II: Rise of Apocalypse (2005) está fuertemente influenciado por la historia de Era del Apocalipsis, incluyendo varios personajes y conceptos de la historia.
• Marvel: Avengers Alliance (2012) presentó una operación especial titulada Apocalipsis basada en la historia de la Era del Apocalipsis.
• Marvel Future Fight (2015) presenta un nivel basado en Era de Apocalipsis, así como trajes alternativos para Magneto, Wolverine, Apocalipsis, Bestia, Rogue y Cíclope basados en sus encarnaciones del arco argumental.
• Marvel Ultimate Alliance 3: The Black Order (2019) presenta un traje alternativo para Coloso basado en su encarnación de Era de Apocalipsis.