La clásica camiseta del club mistiano consta de los colores rojo y negro, de ahí viene su denominación Los Rojinegros. La cual al paso de los años tuvo ciertas modificaciones pero los colores no fueron variados. Al igual que al primer equipo, actualmente la peruana Walon Sport es la marca proveedora que viste al club desde el año 2016.^[2]​

El día 19 de diciembre de 2024, mediante sus redes sociales, el club presentó la camiseta titular para la temporada 2025. "Gloria, un legado de campeones" es el nombre que recibe esta camiseta, la cual rinde un homenaje por los diez años de la obtención del campeonato nacional de 2015. Esta camiseta es una fusión de las dos camisetas usadas en las finales de aquel año: la roja y negra tradicional usada en el partido de vuelta, y la camiseta a cuadros usada en el partido de ida. El rojo y negro tradicional en ambos lados de la camiseta es el diseño principal, mientras que el detalle de la camiseta a cuadros está presente en la parte baja de las mangas y en los costados de la camiseta, además de los costados del short y en la parte alta de las medias. El color dorado está presente como detalle alrededor del escudo, en el cuello, en el color de los patrocinadores y en los distintas frases de homenaje. Dichas frases son las siguientes: en la parte trasera del cuello está escrita el año "2015" (siendo el número "1" reemplazado por el trofeo logrado ese año) y en su debajo la fecha "16 diciembre", fecha en la cual fue obtenido aquel campeonato, acompañada a sus lados de dos estrellas; en la parte baja trasera está escrita la frase "dos colores, un aMor para toda la vida" (siendo la letra "M" escrita en mayúscula) e igualmente acompañada a los lados de dos estrellas; mientras que dentro de la camiseta se rinde homenaje a la Virgen de Chapi con la frase "Mamita de Chapi, a ti nos encomendamos".^[3]​

• Uniforme titular 2025: camiseta roja y negra tradicional, short negro y medias negras.
• Uniforme visitante 2025: camiseta amarilla con acabados rojo y negro, short blanco y medias blancas.

• Fecha de última actualización: 16 de junio de 2025
• Durante los partidos de Liga 3, en campo deben actuar como mínimo 4 jugadores nacionales de Categoría 2005 o menores, mientras que máximo 5 jugadores pueden ser de Categoría 2000 o mayores.
• Los jugadores marcados en negrita pertenecen al primer equipo, sin embargo también han sido inscritos para jugar partidos con el segundo equipo.
• En la columna 'Internacional', los jugadores marcados en negrita fueron seleccionados en la última convocatoria o microciclo de la selección en su respectiva categoría. Los jugadores no marcados en negrita, han sido seleccionados o preseleccionados alguna vez, mostrándose entre paréntesis el año de su última convocatoria.
• Los equipos de la Liga 3, según las bases del torneo, están limitados a tener un máximo de dos jugadores extranjeros de Categoría 2002 o menores, pudiendo jugar ambos en simultáneo.
  • Bernardo Cuesta posee la doble nacionalidad   argentina y   peruana.
  • Ryu Yabiku es nacido en   Japón, aunque actúa bajo nacionalidad   peruana.

• Actualizado al 8 de junio de 2025.
• Nota: Algunos jugadores han pasado por diversas categorías de su selección nacional, sin embargo en el cuadro se considera la convocatoria a la categoría más alta.

• Foot Ball Club Melgar
• Foot Ball Club Melgar (femenino)
• La Noche Rojinegra