Las elecciones generales de la provincia de San Juan de 1946 tuvieron lugar el 24 de febrero, con el objetivo de restaurar las instituciones constitucionales de la provincia luego de tres años de la dictadura de la Revolución del 43, y más de una década de gobiernos fraudulentos de la Década Infame. Se realizaron al mismo tiempo que las elecciones presidenciales y legislativas a nivel nacional, con el objetivo de elegir al Gobernador y Vicegobernador para el período 1946-1950, y los 30 escaños de la Legislatura Provincial.

← 1942 •  • 1950 →
Elecciones provinciales de 1946 Gobernador para el período 1946-1950 30 escaños de la Legislatura Provincial
Fecha						24 de febrero de 1946
Tipo						Gubernatorial y legislativa
Período						4 de junio de 1946 - 4 de junio de 1950
Demografía electoral
Hab. registrados						53 918
Votantes						48 271
Participación
							89.53 %
Resultados
			Juan Luis Alvarado – UCR-JR
			Junta Nacional Coordinadora Unión Cívica Radical Junta Renovadora Partido Laborista Partido Independiente
			Votos			15 912
			Diputados obtenidos						12
									32.96 %
			Elio Cantoni – UCR-B
			Votos			13 797
			Diputados obtenidos						10
									28.58 %
			Alberto Graffigna – PDN
			Votos			10 206
			Diputados obtenidos						5
									21.14 %
			Florencio Basáñez Zavalla – UCR
			Votos			7294
			Diputados obtenidos						3
									15.11 %
			Indalecio Carmona Ríos – PS
			Votos			1062
			Diputados obtenidos						0
									2.20 %
Resultados por departamento
10   Alvarado    5    Cantoni						2    Graffigna    2    Zavalla
Composición de la Legislatura Provincial
12   PL   10   UCR-B						5   PDN   3   UCR
Gobernador de la provincia de San Juan
Titular Emilio Cipoletti Militar						Electo Juan Luis Alvarado PL

El líder del bloquismo, Federico Cantoni, trató de convencer al candidato presidencial Juan Domingo Perón de que el bloquismo fuese la representación del peronismo en San Juan. Si bien logró que concordaran en una cierta cantidad de puntos, a último momento Perón presentó un candidato de su propia coalición, Juan Luis Alvarado, apoyado por Ruperto Godoy como compañero de fórmula. En las elecciones, mientras en San Juan la Unión Democrática se imponía con José Tamborini como candidato presidencial, en el plano provincial la coalición peronista obtuvo una estrecha victoria, de poco más del 32 % de los votos, contra el 28,58 % del bloquismo, el 21,14 % del conservadurismo, el 15,11 % del radicalismo y el 2,20 % del socialismo.^[1]​^[2]​^[3]​

En el plano legislativo, el peronismo obtuvo mayoría simple con 12 de los 30 diputados, seguido del bloquismo con 10, conservadurismo con 5, el radicalismo con 3. Sin embargo, la UCR Bloquista se disolvió al año siguiente cuando Perón organizó la unificación del Partido Peronista (PP), dándole al PP sanjuanino una mayoría absoluta de dos tercios.