Eduardo Rapoport estudió la licenciatura en biología en la Universidad Nacional de La Plata (concluyendo en 1953) y obtuvo allí su título doctoral en 1956.^[1]​^[6]​ Posteriormente trabajó en la Universidad Nacional del Sur (1956–1966).

En 1965 coordinó el Primer Coloquio Latinoamericano de Biología del Suelo, con apoyo de UNESCO.^[7]​^[8]​

En el contexto vivido en Argentina en 1966, con el golpe de Estado y el suceso conocido como La Noche de los Bastones Largos, decidió viajar a Venezuela, donde trabajó en el Instituto de Zoología Tropical de la Universidad Central de Venezuela (1967–1971).

Por una invitación, regresó a Argentina, en 1971, y se instaló en Bariloche para trabajar en la Fundación Bariloche (1971–1978).^[8]​ Luego, exiliado en México, se desempeñó en el Instituto Politécnico Nacional (1978–1983).

En 1984, nuevamente regresado a Argentina, fue designado profesor para la Universidad Nacional del Comahue en Bariloche.^[8]​

En 1989 fundó el Laboratorio Ecotono en la Universidad Nacional del Comahue.^[9]​ Este laboratorio fue distinguido, en 1999, con el Premio Fundación Bunge y Born en Ciencias Ambientales, recibiendo medallas de oro, diplomas de honor y 100.000 pesos.^[10]​

A lo largo de su vida fue director de tesis en varias universidades, publicó libros y ofreció charlas de divulgación y conferencias en diversos contextos.^[3]​^[11]​ Fue contratado como experto por la UNESCO en 1974.^[8]​

Como escultor, ha realizado muestras de sus obras en Caracas, Bariloche, México D.F. y Buenos Aires.

Falleció el 15 de mayo de 2017 en San Carlos de Bariloche.^[12]​

• 1986 Miembro honorario de la Sociedad Ecológica de América.
• 1990 Ganador del premio TWAS (la Academia Mundial de Ciencias), en la categoría de biología.^[13]​
• 1991 Declarado ciudadano ilustre por el Consejo Municipal de Bariloche.^[1]​
• 1991 Premio al mérito por el Consejo Municipal de Bariloche.^[1]​
• 2001 Medalla al mérito académico, por parte de la Universidad Nacional de Luján, "Por sus antecedentes académicos y científicos y como prueba de reconocimiento por su visita a la Universidad Nacional de Luján".^[14]​
• 2004 Socio honorario, Sociedad Argentina de Botánica.
• 2009 En su homenaje se bautizó un espacio verde de Bariloche: "Jardín de nativas Eddy Rapoport". Fue un proyecto llevado a cabo por la Intendencia del Parque Nahuel Huapí.^[15]​^[16]​
• 2017 Mención de Honor del Senado de la Nación Argentina "Domingo Faustino Sarmiento".^[17]​^[18]​
• Tres géneros y doce especies de animales invertebrados (Himenópteros, Paurópodos, Colémbolos, Crustáceos Copépodos, Ácaros, Coleópteros y Proturos) han sido nombrados rapoporti en su honor.^[19]​

• Rapoport, E. H., Ladio, A. H., & Sanz, E. H. (2001). Plantas nativas comestibles de la Patagonia Andina argentino-chilena. Bariloche
• Rapoport, E. H., & Ladio, A. H. (1999). Los bosques andino-patagónicos como fuentes de alimento. Bosque, 20(2), 55-64.
• Rapoport, E. H., Marzocca, A., & Drausal, B. S. (2009). Malezas comestibles del cono Sur. Y otras partes del planeta. INTA.^[20]​
• Rapoport, E. H. (1968). Algunos problemas biogeográficos del Nuevo Mundo con especial referencia a la región Neotropical.
• Rapoport, E. (1975). Areografía: estrategias geográficas de las especies. Obras de Ciencia y Tecnología.
• Rapoport, E. H. (1983). Aspectos de la ecología urbana en la Ciudad de México: Flora de las calles y baldíos (No. 04; QH541. 5. C6, R3.).
• Rapoport, E. H., Ladio, A., Raffaele, E., Ghermandi, L., & Sanz, E. H. (1998). Malezas comestibles. Ciencia Hoy, 9(49), 30-43.
• Rapoport, Eduardo H., and Barbara S. Drausal. "Edible plants." (2013): 127-132.