Las causas de disgeusia son variadas. Frecuentemente se asocian con otros trastornos neurológicos. Las mismas se dividen básicamente en neurológicas centrales o periféricas, y en temporales o definitivas.

Agrupándolas se pueden dividir (lista incompleta) en:

• Infecciosas (faringitis, adenitis salivar, sinusitis, pólipos nasales, COVID-19, etc.)
• Tumorales (sistema nervioso central)
• Tóxicas (efectos secundarios de los medicamentos como medicamentos antitiroideos, captopril, griseofulvina, litio, penicilamina, propafenona, procarbazina, rifampicina, vinblastina o vincristina, metformina) u otro tipo de sustancias: tabaco, alcohol
• Postraumáticas (piercing lingual, accidentes)
• Por agentes físicos (quemaduras por alimentos, radiación ionizante)
• Alimentarias (deficiencia de vitamina B₁₂ o zinc)
• Degenerativas (senilidad, demencias)
• Síndrome de Sjögren
• Psiquiátricas (psicosis)
• Endocrinas
• Congénitas (raras)
• Síndrome de boca ardiente
• Compromiso articular temporomandibular

• Agnosia, deficiencia en la alteración de la percepción.
• Ageusia, pérdida del sentido del gusto.