Summary
La Dihidroorotato deshidrogenasa (fumarato) (EC 1.3.98.1), es una enzima que cataliza la siguiente reacción química:
| Dihidroorotato deshidrogenasa (fumarato) | ||||
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| Estructuras disponibles | ||||
| PDB |
Estructuras enzimáticas RCSB PDB, PDBe, PDBsum
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| Identificadores | ||||
| Identificadores externos | ||||
| Número EC | 1.3.98.1 | |||
| Número CAS | 2603876 | |||
| Ortólogos | ||||
| Especies |
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| PubMed (Búsqueda) |
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| PMC (Búsqueda) |
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Por lo tanto los dos sustratos de esta enzima son (S)-dihidroorotato y fumarato; mientras que sus dos productos son orotato y succinato.
Clasificación
editarEsta enzima pertenece a la familia de las oxidorreductasas, más concretamente a aquellas oxidorreductasas que actúan sobre grupos CH-CH como dadores de electrones utilizando otros aceptores de electrones conocidos.
Nomenclatura
editarEl nombre sistemático de esta clase de enzimas es (S)-dihidroorotato:fumarato oxidorreductasa. Otros nombres por los que se la conoce son DHODasa (ambiguo), DHOD (ambiguo), DHOdeshasa (ambiguo), ácido dihidoorótico deshidrogenasa (ambiguo), dihidroorotato deshidrogenasa (ambiguo), dihidroorotato oxidasa; el gen que codifica a esta enzima se conoce con el nombre pyr4 debido a que es la cuarta enzima en la síntesis de los nucleótidos de pirimidina.
Estructura y función
editarLa dihidroorotato deshidrogenasa cataliza la oxidación del (S)-dihidroorotato a orotato, el cuarto paso (y el único redox) en la síntesis de novo de los nucleótidos de pirimidina. El sitio activo de la enzima contiene una profunda cavidad llena de moléculas de agua excavada sobre un bucle altamente conservado y muy flexible. En el complejo enzima-sustrato, el orotato desplaza a las moléculas de agua del sitio activo y se ubica sobre el anillo isoaloxasina de una flavina que actúa como cofactor.
La enzima contiene Flavin mononucleótido (FMN). La reacción ocurre en el citosol de células eucariotas.
El oxígeno molecular puede reemplazar al fumarato in vitro.
Otras clases de dihidroorotato deshidrogenasasa utilizan NAD+
(EC 1.3.1.14) o NADP+
(EC 1.3.1.15) como aceptor de electrones.
La dihidroorotato deshidrogenasa de clase 2 unida a membrana (EC 1.3.5.2) utiliza una quinona como aceptor de electrones.
Referencias
editar- Björnberg, O., Rowland, P., Larsen, S. and Jensen, K.F. (1997). «Active site of dihydroorotate dehydrogenase A from Lactococcus lactis investigated by chemical modification and mutagenesis». Biochemistry 36 (51): 16197-16205. PMID 9405053. doi:10.1021/bi971628y.
- Rowland, P., Björnberg, O., Nielsen, F.S., Jensen, K.F. and Larsen, S. (1998). «The crystal structure of Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A complexed with the enzyme reaction product throws light on its enzymatic function». Protein Sci. 7: 1269-1279. PMC 2144028. PMID 9655329. doi:10.1002/pro.5560070601.
- Nørager, S., Arent, S., Björnberg, O., Ottosen, M., Lo Leggio, L., Jensen, K.F. and Larsen, S. (2003). «Lactococcus lactis dihydroorotate dehydrogenase A mutants reveal important facets of the enzymatic function». J. Biol. Chem. 278 (31): 28812-28822. PMID 12732650. doi:10.1074/jbc.M303767200.
- Zameitat, E., Pierik, A.J., Zocher, K. and Löffler, M. (2007). «Dihydroorotate dehydrogenase from Saccharomyces cerevisiae: spectroscopic investigations with the recombinant enzyme throw light on catalytic properties and metabolism of fumarate analogues». FEMS Yeast Res. 7 (6): 897-904. PMID 17617217. doi:10.1111/j.1567-1364.2007.00275.x.
- Inaoka, D.K., Sakamoto, K., Shimizu, H., Shiba, T., Kurisu, G., Nara, T., Aoki, T., Kita, K. and Harada, S. (2008). «Structures of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase complexed with substrates and products: atomic resolution insights into mechanisms of dihydroorotate oxidation and fumarate reduction». Biochemistry 47 (41): 10881-10891. PMID 18808149. doi:10.1021/bi800413r.
- Cheleski, J., Wiggers, H.J., Citadini, A.P., da Costa Filho, A.J., Nonato, M.C. and Montanari, C.A. (2010). «Kinetic mechanism and catalysis of Trypanosoma cruzi dihydroorotate dehydrogenase enzyme evaluated by isothermal titration calorimetry». Anal. Biochem. 399 (1): 13-22. PMID 19932077. doi:10.1016/j.ab.2009.11.018.
Enlaces externos
editar- MeSH: Dihydroorotate+dehydrogenase+(fumarate) (en inglés)
Datos: Q3195096
