El equipo proviene de un proyecto generado en el año 2018, cuando el mundialmente conocido futbolista Luis Suárez anunció la creación en su país del Deportivo LS, equipo deportivo de su propiedad, el cual albergó desde sus inicios varias disciplinas deportivas pero principalmente fútbol.

El Deportivo LS inició sus actividades con equipos juveniles, y con el tiempo se fueron incorporando los equipos de mayores: incursionando primero en la Liga Universitaria en 2023. Ese mismo año lograron el ascenso desde la Divisional G a la F,^[5]​ y en 2024 obtuvieron su primer título al campeonar en la Divisional "F" y ascender a la "E".^[6]​ También en ese año 2023 el DLS se incorporó a la Asociación Uruguaya de Fútbol, primeramente a través de un equipo juvenil de fútbol femenino.^[7]​ Actualmente el Deportivo LS sigue en actividad en esas competiciones.^[8]​

En el año 2025, se anunció la creación del Deportivo LSM, a partir de la incorporación de Lionel Messi al proyecto.^[9]​ El equipo fue confirmado como uno de los participantes para la temporada 2025 de la Divisional D de la Asociación Uruguaya de Fútbol, generando una gran expectativa a nivel mundial. En poco tiempo, las redes del novel equipo sumaron grandes cantidades de seguidores, convirtiéndolo en pocos días en el tercer equipo uruguayo con mas seguidores en redes sociales, solamente detrás de los dos históricos equipos grandes: Nacional y Peñarol.^[10]​ Esta expectativa a generado que ha pesar de ser un equipo recién creado, y que inicia su competición en la última categoría, los partidos del Deportivo LSM se transmiten a nivel nacional a través de AUF TV, y a nivel internacional a través de NSN, propiedad de Andrés Iniesta.^[11]​

El debut oficial del equipo fue el sábado 30 de agosto de 2025, con victoria 2-0 sobre Academia FC en el Parque Palermo. Los goles fueron convertidos por Martín Parodi (histórico primer gol oficial del equipo) y Rodrigo Pastorini.^[12]​ Posteriormente, en la segunda fecha y con Luis Suárez en las gradas presenciando el encuentro, cayeron 3-0 ante Rincón FC.^[13]​

La Ciudad Deportiva Luis Suárez cuenta con un estadio de fútbol con capacidad para 1400 espectadores, y uno de fútbol 7 (destinado al público infantil) con una capacidad estimada de 620 personas. También tiene una cancha de césped sintético para fútbol 7 y hockey, dos con césped natural para fútbol 11 y una de pasto natural de fútbol 7. El sitio también cuenta con gimnasio, barbacoa y estacionamiento.^[14]​ Fue inaugurada el 27 de marzo de 2023.^[15]​

• No posee títulos.

La rivalidad de este club se da con el equipo de la misma ciudad, Estudiantes del Plata, en el llamado Clásico de la costa. Se originó por una invitación de ese club hacia el Deportivo LSM para ser su clásico rival en su cuenta de Instagram. El 13 de agosto de 2025 se enfrentaron por primera vez y ganó Deportivo LSM por un marcador de 4-0, con goles de Enrique Etcheverry (x1), Martín Parodi (x2), y Agustín Santurio (x1).