La identificación de genes en cada uno de los cromosomas es obtenida por medio de diferentes métodos, lo que da lugar a pequeñas variaciones en el número de genes estimados en cada cromosoma, según el método utilizado. Se estima que el cromosoma 15 contiene una cantidad estimada de entre 700 y 900 genes. Algunos de estos genes son:

• CEMIP: (proteína inductora de migración celular), KIAA1199 o HYBID. Brazo corto p25
• FAH: fumarilacetoacetato hidrolasa (fumarilacetoacetasa).
• FBN1: fibrilina 1 (síndrome de Marfan).
• HEXA: hexosaminidasa A (polipéptido alfa).
• IVD: isovaleril-Coenzima A deshidrogenasa.

• MCPH4: microcefalia
• NKCC2: Cotransportador Na-K-2Cl del riñón.
• OCA2
• RAD51: RAD51 homólogo (RecA homólogo, E. coli) (S. cerevisiae).
• STRC: estereocilina
• UBE3A: ubiquitín-proteíin-ligasa E3A (proteína virus del papiloma humano E6- asociada, síndrome de Angelman).

• BCL2L10: Apoptosis. Esta proteína puede considerarse tanto pro-apoptótica como anti-apoptótica. En resumen (15q21.2)
• EYCL3 Color de ojos 3, marrón - localización: 15q11-q15 (nota: el color de los ojos es un carácter genético poligénico).^[5]​
• FBN1 : Fibrilina-1 (15q21.1)

• NEDD4: Proteína NEDD4 ubiquitina-ligasa E3. En resumen 15q21.23 Start 55,826,92

• Smad3: Vía de señalización del TGF-beta; localización: 15q22.33

• LRRK1: serina/treonina- proteína quinasa 1 rica en leucina. Brazo largo 15q26.3
• PML: proteína de leucemia promielocítica.
• SLC24A5

Los genes regulados por la impronta suelen estar agrupados. Posee una Región de Control de la Impronta (IC) en 10q11-q13 que se encuentra metilada, presenta una estructura diferente a la del ADN y una diferente expresión génica.

Los siguientes trastornos están relacionados con cambios en el número o la estructura del cromosoma 15:

• Síndrome de Angelman. (Pérdida del locus materno. UBE3A).
• Síndrome de Prader-Willi. (Pérdida del locus paterno. SNRPN, NDN, MAGEL2, snRNA cluster).
• 15 isodicéntrico.
• Síndrome de Aagenaes.

Los siguientes trastornos están relacionados con genes localizados en el cromosoma 15:

• Síndrome de Bloom.
• Cáncer de mama.
• Acidemia isovalérica.
• Síndrome de Ehlers-Danlos y síndrome de hiperlaxitud articular.
• Síndrome de Marfan.
• Sordera no sindrómica.
• Enfermedad de Tay-Sachs.
• Tirosinemia.
• Carcinoma de NUT.

• El brazo largo (15q) desempeña una función fundamental en el desarrollo del diafragma.

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• Enfermedades debidas a mutaciones en el cromosoma 15