Tras licenciarse en Derecho en la Universidad Complutense de Madrid, ingresó en la carrera diplomática (1994).^[2]​

Comenzó su carrera diplomática como Jefe del Servicio de Asuntos Políticos, del Gabinete Técnico del Subsecretario del Ministerio de Asuntos Exteriores, Unión Europea y Cooperación (1994) y Encargado de los Asuntos de Cooperación (1998). Posteriormente fue: Jefe adjunto de Protocolo de la Casa de Su Majestad el Rey (1998-2001); Subdirector General Adjunto de Asuntos Generales de la Unión Europea (2008); Vocal Asesor en el Gabinete de la Ministra de Fomento (2008-2009); Director de Tribuna Americana de la Casa de América (2009-2011); Subdirector General de Política Exterior y de Seguridad Común (2016 -2020).^[3]​

Prosiguió su carrera diplomática, destinado en las embajadas de España en Haití (1995-1998), R.P. China (2001-2005); Colombia (Cónsul General, 2005-2008); y en la Representación Permanente de España ante la Unión Europea (2011-2016).^[4]​

Fue Embajador de España en El Salvador.^[5]​^[6]​

El diplomático Carlos de la Morena ha recibido las siguientes distinciones:^[7]​

• Caballero de la Orden del Mérito Civil (24-6-1998)
• Cruz de la Real y Distinguida Orden de Carlos III (22-06-2002)
• Comendador de la Orden del Mérito Civil (6-12-2007)
• Caballero de primera clase de la Orden de la Rosa Blanca de Finlandia
• Oficial de la Orden de la Corona (Bélgica)
• Cruz de Oficial de la Orden del Infante Don Enrique, de la República Portuguesa
• Comendador de la Orden de San Carlos (Colombia).