Nacido en San Fernando el 10 de noviembre de 1821,^[b]​ era hijo de Francisco-Antonio Marfori y Rodi^[2]​^[6]​ —un noble italiano emigrado que falleció cuando Carlos Marfori era todavía joven—^[5]​ y María-Josefa Callejas y Pavón.^[6]​ Pariente del general Narváez,^[7]​ por matrimonio con su prima María de la Concepción Fernández de Córdoba y Campos. Ya era oficial de Infantería de Marina cuando fue nombrado subteniente desde el 28 de septiembre de 1837.^[6]​

Fue alcalde y gobernador civil de Madrid en 1857,^[5]​^[8]​ diputado a Cortes por Loja y Granada en varias legislaturas entre 1857 y 1884,^[c]​ ministro de Ultramar entre junio de 1867 y junio de 1868^[2]​^[10]​^[5]​ y ministro interino de Marina,^[11]​ capitán de Infantería,^[12]​^[13]​ intendente general de la Real Casa y Patrimonio, consejero de Estado, gran cruz y collar de la Orden de Carlos III, gran cruz de la Orden de Isabel la Católica, caballero de la Orden de San Juan de Jerusalén y gentilhombre de cámara con ejercicio de Su Majestad.^[3]​^[14]​

Marfori ha sido descrito como «uno de los más cercanos consejeros de la reina Isabel».^[11]​ Algunos autores señalan que fue su amante.^[15]​^[16]​ En este sentido, Marfori fue uno de los protagonistas de Los Borbones en pelota, una serie de láminas satíricas del siglo XIX, en las que se caricaturizaba a distintos miembros de la Corte de la reina, donde Marfori aparece representado en varias ilustraciones de carácter pornográfico, junto al rey consorte Francisco de Asís, el religioso Antonio María Claret y la monja sor Patrocinio.^[16]​ Fue uno de los protagonistas de la obra dramática La Corte de Isabel de Borbón con todos sus consejeros, de Ramón de Torres y Rojas, de 1869,^[17]​^[18]​ en la etapa de Gobierno provisional del Sexenio Democrático; en ella es caracterizado como «un aprovechado».^[18]​

Tras el triunfo de la revolución del 68, marchó al exilio, del que retornaría con la Restauración.^[11]​ En 1891 fue nombrado senador vitalicio.^[11]​^[19]​ Tras su fallecimiento, a la edad de setenta años, el 2 de junio de 1892,^[19]​^[20]​ fue enterrado en la Sacramental de San Lorenzo y San José.^[21]​

• Marquesado de Loja
• Gentilhombre de Cámara con ejercicio
• Collar de la Orden de Carlos III
• Gran Cruz de la Orden de Carlos III
• Gran Cruz de la Orden de Isabel la Católica
• Caballero de la Orden de Malta
• Placa de Comendador de la Orden de Cristo

• Burdiel, Isabel, ed. (2012). Los borbones en pelota. Zaragoza: Institución Fernando el Católico. ISBN 978-84-9911-196-4. 
• Caro Cancela, Diego (2010). Diccionario biográfico de parlamentarios de Andalucía, 1810-1869 2. Sevilla: Centro de Estudios Andaluces. ISBN 9788493835477. 
• Fernández de Béthencourt, Francisco (1910). Anuario de la nobleza de España, 1909-1910. Tomo II. Madrid: Establecimiento Tipográfico de Jaime Ratés. 
• Fernández de Béthencourt, Francisco (1907). Historia genealógica y heráldica de la Monarquía española: Casa Real y Grandes de España. Tomo VII. 
• Mínguez Cornelles, Víctor Manuel (2007). «El poder y la farsa: imágenes grotescas de la realeza». Quintana: revista de estudios do Departamento de Historia da Arte (6): 39-53. ISSN 1579-7414. Archivado desde el original el 4 de marzo de 2016. Consultado el 16 de septiembre de 2014. 
• Torres y Rojas, Ramón de (1869). La corte de Isabel de Borbón con todos sus consejeros. Madrid. 
• Vilar García, María José (2012). «El primer exilio de Isabel II visto desde la prensa vasco-francesa (Pau, septiembre-noviembre 1868)». Historia contemporánea (44): 241-270. ISSN 1130-2402. 
• Vilches García, Jorge (2006). «La política en la literatura. La creación de la imagen pública de Isabel II en Galdós y Valle-Inclán». Historia contemporánea (33): 769-790. ISSN 1130-2402. Archivado desde el original el 14 de octubre de 2014. 

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