El juego comienza cuando Bugs Bunny se dirige a Pismo Beach, pero al tomar el camino incorrecto llega a parar a un granero, donde encuentra una gran máquina, a la que Bugs confunde con una gigantesca máquina de jugo de zanahoria, Bugs la acciona accidentalmente y es llevado a Ninguna Parte, hogar del hechicero llamado Merlín (a quien Bugs apoda "Mer"). Merlín le explica a Bugs que él está perdido en el tiempo y que deberá ir a distintas épocas y coleccionar símbolos como despertadores y zanahorias doradas para retornar al presente. Los jugadores deberán ayudar a Bugs a través de 5 diferentes eras en el tiempo para regresar al presente, esas eras son:

• Ningún Sitio.

Es el lugar de comienzo del juego donde Mer enseña a Bugs los primeros controles y le permite conseguir un reloj mediante diversas pruebas para que pueda entrar en el primer nivel de La Edad de Piedra.

• La Edad de Piedra.

El personaje de esta era es Elmer Gruñón.

• El Siglo de los Piratas.

El personaje de esta era es Sam Bigotes.

• Los años 1930.

Los personajes de esta era son Rocky y Mugsy.

• La Edad Media.

El personaje de esta era es la Bruja Hazel. Es la única era en la que Bugs puede adquirir habilidades mágicas. Estas habilidades mágicas ayudan al jugador en diversos obstáculos en algunos niveles.

• El Futuro.

El personaje de esta era es Marvin el marciano.

• Bugs Bunny - Es el personaje principal del juego. Es un conejo que trata de volver al presente.
• Merlín Munroe - Es un mago que ayuda a Bugs a volver al presente. Su nombre es un juego de palabras entre el Mago Merlín y Marilyn Monroe.
• Elmer Gruñón - Un cavernícola que caza conejos. Él es el líder de la Edad de Piedra.
• Pato Lucas - El rival de Bugs, es cazado por Elmer Gruñón en el nivel "¿Temporada del Conejo o del Pato?" en la Edad de Piedra y aparece con su disfraz de Robin Hood en la Edad Media.
• Bruja Hazel - Una bruja que quiere a Bugs para cocinar conejo estofado. Vive en los Bosques Olvidados y aparece en la Edad Media.
• Sam Bigotes - Aparece como el capitán de un barco pirata, en el cual lucha contra Bugs en la Isla del Tesoro en el Siglo de los Piratas.
• Rocky - Ladrón que roba bancos en los Años '30.
• Mugsy - Súbdito torpe de Rocky.
• Toro - Un toro español que es vencido por Bugs en los Años '30.
• Marvin el Marciano - Un marciano que prueba su última arma contra Bugs. Aparece en el Futuro.
• Marcianos Instantáneos - Marcianos que nacen como píldoras y se transforman en marcianos cuando se les agrega agua. Aparecen como obstáculos en el Futuro.
• Blacque Jacque Shellacque - Aparece como un enemigo común, en el Siglo de los Piratas es un esbirro de Sam y en los Años '30 es un personal de mantenimiento que tira llaves inglesas.

• Voces en inglés:
  • Billy West - Bugs Bunny y Elmer Gruñón
  • Jess Harnel - Merlín Munroe
  • June Foray - Bruja Hazel
  • Mel Blanc - Sam Bigotes
  • Joe Alaskey - Rocky, Mugsy, Marvin el Marciano, Pato Lucas

Su modalidad de juego es simple, al empezar el juego debes pasar por la zona de entrenamiento la cual te indica que botones presionar en cada precisión de nivel.

En cada parte de las épocas tendrás que recolectar habilidades como supersalto, musicalidad, u oraciones mágicas con lo cual podrás abrir puertas secretas o dar saltos a zonas inalcanzables.

Knight-Mare Hare

• El argumento principal del juego y en particular el personaje de Merlín Munroe.
• La imagen que aparece cuando está cargando Ningún Sitio.
• La habitación de Merlín en los niveles "¿Qué estás cocinando, viejo?" y "El misterio de los menhires de zanahorias".

Knighty Knight Bugs

• La imagen que aparece cuando está cargando La Edad Media.
• Los dragones verdes que se encuentran en los niveles de La Edad Media.

A Witch's Tangled Hare

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "¿Por dónde se va a Albuquerque?".
• El título del nivel "¿Qué estás cocinando, viejo?" y la escena inicial.
• Las escobas voladoras andantes que se encuentran en los niveles de La Edad Media.

Captain Hareblower

• Las imágenes que aparecen cuando está cargando El Siglo de los Piratas y el nivel "Eh... ¿qué hay de nuevo viejo?".
• El nivel "Eh... ¿qué hay de nuevo viejo?"
• Los "barriles-veleros" que Sam le envía a Bugs con TNT en los niveles "Eh... ¿qué hay de nuevo viejo?" y "Cuando Yosemite Sam encontró a Bugs Bunny".

Catty Cornered

• La imagen que aparece cuando está cargando Los años 1930.

Bugs and Thugs

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "Los fondos del banco".

Bugsy and Mugsy

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "La gran escapada" y la estética y elementos del mismo.

Assault and peppered

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "Cuando Yosemite Sam encontró a Bugs Bunny".

Broom-Stick Bunny

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "¿Qué estás cocinando, viejo?".

Rabbitson Crusoe

• La imagen que aparece cuando está cargando el nivel "Sigue el camino rojo de los piratas" y los tiburones de "Eh...¿qué hay de nuevo viejo?".

Bully for Bugs

• El nivel "La corrida de toros" y la imagen que aparece cuando está cargando.

Robin Hood Daffy

• El Pato Lucas en su versión de Robin Hood en los diferentes niveles de La Edad Media.

Rabbit Seasoning

• El nivel "¿Temporada del conejo o del pato?" y la imagen que aparece cuando está cargando.

Hare-Way to the Stars

• Las imágenes que aparecen cuando está cargando El Futuro y los niveles "¡El expediente del planeta X!", "La sala del tiempo" y "Rómpete el coco".
• Las patinetas amarillas con propulsión que utilizan Bugs y el marciano instantáneo en "Rómpete el coco".

Duck Dodgers in the 24½ century

• El nivel "La conquista del planeta X" y la imagen que aparece cuando está cargando.
• Los evaporadores que aparecen en El Futuro y el cerebro ACME que aparece en el nivel "Rómpete el coco".
• Los rayos que bloquean el paso a ciertos lugares en "¡El expediente del planeta X!".

• Bug Bunny: Lost in Time en IGN