Breno se unió a la organización juvenil del Cruzeiro a la edad de 11 años, pero fue liberado cuatro años después. Posteriormente representó a São José-RS, Cerâmica y Joinville, este último donde finalizó su formación.^[1]​

Debutó con el primer equipo de Joinville el 6 de marzo de 2016, sustituyendo en la segunda parte a Welinton Júnior en la victoria por 2-1 del Campeonato Catarinense en casa ante el Guarani de Palhoça.^[2]​ En el mes de junio, después de jugar pocas veces, fichó cedido por Juventus de Jaraguá para disputar el Campeonato Catarinense Série B, y anotó su primer gol en su debut con el club el 24 de julio, en un empate 1-1 a domicilio contra Porto (SC).^[3]​

A su regreso en enero de 2017, comenzó a aparecer regularmente en JEC. En diciembre de 2018, después de que el club fuera relegado a la Série D, emprendió una acción legal contra el equipo por impago de salarios y posteriormente rescindió su contrato.^[4]​

El 22 de enero de 2019 fue presentado en Juventude de la Série C; Joinville también retuvo el 50% de sus derechos económicos.^[5]​ El 4 de octubre, después de ayudar al club a lograr el ascenso a la Série B fue cedido al Figueirense hasta el final de la temporada; Posteriormente, también se acordó un préstamo al Athletico Paranaense para el Campeonato Paranaense 2020.^[6]​

El 29 de abril de 2020 dejó el Furacão cuando expiraba su contrato de préstamo y regresó a la Juventude, donde impresionó durante la segunda división del año.^[7]​

El 10 de noviembre de 2020, el Juventude anunció el traspaso de Breno al Palmeiras en la máxima categoría del fútbol brasileño.^[8]​ Hizo su debut en la categoría principal cinco días después, reemplazando a Willian en un triunfo en casa por 2-0 sobre el Fluminense. El 30 de enero de 2021, anotó el gol de la victoria del Palmeiras por 1-0 sobre el Santos en la final de la Copa Libertadores de 2020 a los nueve minutos después del tiempo de descuento.^[9]​