El torneo se jugó en dos etapas, una Etapa Clasificatoria y una Etapa Eliminatoria, para la Primera Fase se dividió a los 129 equipos participantes en ocho regiones determinadas geográficamente: región norte (para equipos de Jujuy, Salta y Tucumán), región litoral norte (Corrientes, Chaco, Misiones y Formosa), región litoral sur (Santa Fe y Entre Ríos), región centro (Catamarca, La Rioja, Santiago del Estero y Córdoba), región cuyo (San Juan, Mendoza y San Luis), región pampeana norte (Buenos Aires este y norte), región pampeana sur (La Pampa y Buenos Aires sur y centro) y región sur (Neuquén, Río Negro, Chubut, Santa Cruz y Tierra del Fuego). A su vez, cada región fue subdividida en dos zonas con el mismo criterio, determinando así un total de 5 de 7 clubes, 6 de 8, 3 de 9 y 2 de 10. Los integrantes de cada zona se enfrentaron entre sí a dos rondas por el sistema de todos contra todos. Los dos primeros de cada una clasificaron a la Segunda fase, determinando 32 clasificados que también garantizaron un cupo en la Copa Argentina 2017-18, mientras que el último de cada zona descendió al Federal C.^[1]​

Ya en la Etapa Eliminatoria, Los clasificados disputaron la Segunda Fase a eliminación directa, a ida y vuelta, dentro de cada región, de la siguiente manera: 1.º Zona 1 vs. 2.º Zona 2 y 2.º Zona 1 vs. 1.º Zona 2, definiendo ambos punteros como locales. Los dos ganadores de cada cruce se enfrentaron entre sí en la Tercera Fase, definiendo de local quien obtuvo mayor puntaje en la Primera fase dentro de su zona, para determinar un finalista por región. Todos los ganadores se enfrentaron en la Cuarta Fase, o finales interregionales, con los cruces organizados geográficamente y con el mismo formato. Los cuatro vencedores obtuvieron el ascenso al Torneo Federal A 2017-18.^[2]​

Esta es la 7.ª participación del club en la cuarta categoría.