Antonio Tomba, nacido en Valdagno, región del Véneto, Italia, fue un integrante de las milicias independistas de Giuseppe Garibaldi durante la reunificación de Italia que llegó desde Génova a la Argentina, más concretamente a la ciudad de Buenos Aires, en 1875 con 26 años de edad, que terminaría pos instalarse en la provincia de Mendoza, en el antiguo departamento de Belgrano que hoy en día se corresponde con lo que es Godoy Cruz. Allí optó, luego de casarse, por la vinicultura logrando construir en 1885 su bodega, que terminaría siendo una de las más importantes del país durante finales del siglo XIX y principios del siglo XX. En 1899, mismo año de la muerte de Antonio, se funda el Club Bodega Antonio Tomba, integrado por los obreros de la bodega, que participaba en la liga comercial de Mendoza de fútbol.^{[n. 1]}​^[1]​^[2]​^[3]​

Godoy Cruz nació como institución en el año 1921. Todo comenzó cuando un grupo de amigos, reunidos en el «Bar Victoria» (ubicado enfrente de la plaza departamental en ese entonces), decidieron fundar un club, aprovechando el auge que había en la época. Fue así como nació, el 1 de junio de 1921, el Club Sportivo Godoy Cruz con la presidencia novicia de Don Romero Garay.
Los fundadores, desde un comienzo, se propusieron realizar un proyecto ambicioso que abarcara la práctica de distintas disciplinas: tales como el fútbol —deporte de enorme crecimiento en toda la región—, pesas para hacer gimnasia, ajedrez y boxeo. Justamente a partir de este último deporte —hoy en día Mendoza es una de las principales en esta materia— se inició en el club un personaje que la historia pondría en un lugar lleno de protagonismo: Feliciano Gambarte. En octubre de 1921, Gambarte se transformó en el entrenador físico de boxeo, y hoy el estadio de fútbol del club lleva su nombre muy bien puesto, ubicado en la calle Balcarce del Departamento de Godoy Cruz.

Al año siguiente, los socios y futbolistas, luego de disputar una serie de amistosos, dieron nota de que ya era hora de comenzar a profesionalizar dicho deporte; y así fue como el Club Sportivo Godoy Cruz se afilió a la «Liga Mendocina de Fútbol». Godoy Cruz fue uno de los clubes fundadores de la entidad madre del fútbol de la provincia. Comenzó la competición en la Segunda División y al año siguiente obtuvo el ascenso a Primera, lugar que en el año 2008 descendió de vuelta a segunda división, siendo que Godoy Cruz solo descendió una vez en la historia. Ya establecido como una institución, el fútbol seguía acaparando nuevos seguidores y de esta manera Godoy Cruz crecía en afición y en protagonismo en los torneos de la «Liga Mendocina». El Club Sportivo Godoy Cruz fue el primero de los clubes en salir de la provincia para disputar encuentros amistosos con rivales de provincias cercanas, en giras que devolvían resultados positivos que engrandecían a Mendoza.

A raíz de esto, la comisión directiva decidió dar un importantísimo paso: el de conseguir cancha propia. Así, la «Bodega Antonio Tomba» cedió unos terrenos que tenía destinado a establos para sus caballos y carretas, y de esta manera en el año 1923 Godoy Cruz tuvo su primera cancha oficial en el cruce de las calles Las Heras y Juan José Castelli, en el departamento local. El partido inaugural se disputó el 1 de noviembre en el marco de una fiesta inolvidable contra el Atlético Palmira, el encuentro terminó en un apasionante 4-4.

Durante el año 1930 se concretó la fusión entre el Club Sportivo Godoy Cruz y el Club de la Bodega Antonio Tomba.^[4]​ Esta alianza fue producto de la necesidad de unificar el esfuerzo de dos instituciones arraigadas en el departamento que se unieron para formar un club más poderoso y con mayor proyección: el Club Deportivo Godoy Cruz Antonio Tomba, encabezada esta primera comisión por Dardo García. En ese momento, seguramente aquellos amigos del «Bar Victoria» comenzaron a concretar el fruto de sus sueños. Producto de esta unión, el crecimiento siguió siendo incesante, a tal punto que la entidad se afilió a la Federación Mendocina de Básquet. Feliciano Gambarte llegó a la presidencia, y comenzaron los duelos barriales en los estadios de fútbol con sus vecinos de Andes Talleres Sport Club.^{[cita requerida]}

• 1921 - 1930

El 6 de noviembre de 1921 el Club Sportivo Godoy Cruz jugó su primer partido, en forma amistosa, cuando enfrentó y venció por 1-0 al Club Correos y Telégrafos —entidad desaparecida—. El encuentro tuvo lugar en el estadio que tenía el club, en lo que hoy es la Plazoleta Barraquero. La formación que presentó en la ocasión fue: José Araya; Edgardo Bustamante y Atalivar Tomba; Francisco Márquez, Juan Antonio Paredes y Ramiro Mercado; José Alberto González, Marcos Orquera, Andrés Campoy, Feliciano Gambarte y Adolfo Barnabó. Como suplentes estaban: Sergio Rubén Ramírez, Nicolás Comizzo y Franco Pérez.
El día 17 de diciembre de 1922 el Sportivo Godoy Cruz logró el campeonato del primer «Torneo de la División Intermedia» organizado por la recientemente creada «Liga Mendocina de Fútbol», torneo al cual se había inscripto para competir por el ascenso a la Categoría Superior. Con este Título logró su primer y único ascenso a la «Primera División A de la Liga», cuyo primer Campeonato también había sido jugado en ese año al darse por iniciadas las actividades competitivas de la Entidad Madre. Ese día Godoy Cruz venció al Club Paso de los Andes de Rodeo de la Cruz por 2-0 en el estadio que este último tenía en la localidad homónima. El Plantel Campeón estaba formado por: Eduardo Castellani, José Tomba y Antonio Bianchi, Severo Artal, Norberto Vargas y Alberto Mansilla, Carlos Pappa, Adolfo Bernabó, Mario Sosa, José Reynoso y Luis Tinelli. Desde entones, y hasta la fecha, Godoy Cruz ha participado en forma ininterrumpida en todos los torneos de primera división de la liga organizados por la Liga Mendocina de Fútbol. Además, la Institución tiene el orgullo y el honor de ser el único club del fútbol mendocino que nunca ha descendido a la segunda división.

El día 24 de mayo de 1926 el plantel de Godoy Cruz concretó su primera gira al interior de la Provincia. Ese día se presentó en la Ciudad de San Rafael para enfrentar a un combinado de la «Liga Sanrafaelina de Fútbol». Los dirigentes, el Sr. Fernando Della Motta (Vice–Presidente) y Cicerón Escalante (Pro–Secretario), presidieron la delegación del Club. El Plantel Superior de la Institución formó con: Sigilfredo Castellani; Pablo Belelli, Pedro De La Rosa; Norberto Vargas, Roberto Belelli, Francisco Salinas; Juan Carlos Agüero, Amadeo Sosa, Emilio Furlano, Roberto De La Rosa y Alejandro Vila, este cotejo fue un motivo por la que el Señor Gobernador de la Provincia de Mendoza, Don Alejandro Orfila, donara 11 medallas de oro y un trofeo para el equipo que resultara vencedor, que en ese caso fue para Godoy Cruz, que derrotó al combinado sureño por 3-1. Dirigió ese partido el reconocido y recordado árbitro de la Liga Mendocina de Fútbol el Sr. Donato Conte.

El día 22 de mayo de 1927 Godoy Cruz concretó su primera gira interprovincial al presentarse, en la Ciudad Capital de la vecina Provincia de San Juan, ante su similar del Sp. Desamparados. La delegación fue presidida por el Protesorero Sr. Fernando Della Motta acompañado por el Intendente del Club Sr. Luis M. Tinelli y el vocal Sr. Rafael Martín. El primer equipo de la Institución estuvo integrado por: Juan José Suárez, Pedro De la Rosa, Pablo Belelli, Juan Persky, Norberto Vargas, Federico Artal, Roberto García, Francisco Salinas, Carlos Fossati, Alejandro Vila, Ramiro De la Rosa. Fueron suplentes: José Velatta, Luis Funes, Jacinto Peralta y Carlos Pozzoli. El masajista de la delegación fue el Sr. Luis Truviani y como réferi asistió el Sr. Félix Romano. El encuentro terminó a favor del equipo dueño de casa que derrotó a Godoy Cruz por 3-1.

• 1931 - 1940

En 1932, Godoy Cruz realiza su primera venta al fútbol porteño, transfiriendo a José “Tabaquillo“ García a Chacarita Juniors, de donde luego pasaría a jugar en River Plate para jugar junto a Bernabé Ferreyra. Con el paso de los años, a su regreso al Club, integraría el equipo bodeguero que obtendría en 1944 el primer título de la «Liga Mendocina» y, luego de su retiro de la práctica activa del fútbol, sería el entrenador del conjunto que sería campeón de la Liga local del año 1947.

El día 23 de abril de 1933 el Godoy Cruz Antonio Tomba se presentó, en su Estadio de Castelli y Las Heras, contra el Club Atlético Pacífico —hoy Club Atlético Argentino—. El triunfo fue del "Tomba" por 3-2; luego de producir una muy buena demostración de juego asociado. De esta manera se mantenía invicto en las tres primeras fechas de la temporada y puntero junto a Gimnasia y Esgrima. Más allá del triunfo este encuentro marcó un hito importante en la historia de la Institución puesto que ese día se completó un poderoso equipo de jugadores que daría grandes satisfacciones a la afición bodeguera durante esa temporada. En ese encuentro debutó el paraguayo Constantino Urbieta Sosa, figura internacional y exquisito jugador de medio campo. Junto a Sosa fueron incorporados Ordez, Largo y Ruffo. Durante este año este conjunto demostraría, en cada una de sus presentaciones, las características típicas que habrían de tener por siempre los planteles de la Institución: «amor propio, garra y entrega». Durante esta temporada El Expreso produjo espectáculos extraordinarios al revertir, en muchas oportunidades durante el segundo tiempo, tanteadores que le eran adversos. El periodismo especializado destacó y admiró estas cualidades. El «Diario Los Andes» no dejaba de destacar a los jugadores de la cantera, publicando notas de varios de ellos. De entre esas notas se destacó una referida a Roberto Quiroga; quien a los 16 años ya era una gran promesa de la cantera del club y que luego sería una realidad al integrar el primer equipo bodeguero que fue campeón de la Liga. El «Diario La Palabra» —vespertino desaparecido— lo llama “El Tanque Bodeguero”. Su colega La Libertad —también desaparecido y decano mendocino del deporte escrito— no ahorraba elogios para con el Primer Equipo y lo denominaba “El Expreso Departamental”. Ese año nació la marca registrada del Club: «El Expreso», apelativo que nunca más sería dejado de usar para referirse, con admiración y cariño, a las escuadras "bodegueras".^{[n. 2]}​

• 1941 - 1950

El día domingo 8 de octubre de 1944 es proclamado, por primera vez en su historia, campeón de la Liga Mendocina. Ese día enfrentó, en condición de local y como campeón, al Club Nacional Vélez Sarsfield Pacífico —hoy Club Atlético Argentino—; con quien empató en un tanto con gol "bodeguero" de Domingo Godoy.^[5]​ El «Diario Los Andes» publicó: «Por primera vez conquista el título un club que estimula al Fútboler Nativo».^[6]​

El día 19 de septiembre de 1947 Godoy Cruz Antonio Tomba se proclama por segunda vez en su historia como campeón de la Liga provincial. Ese día empata sin goles con el Club Murialdo en un encuentro arbitrado por el Sr. Mario Comellas.^{[n. 3]}​^[7]​

• 1951 - 1960

El día 10 de diciembre de 1950 Godoy Cruz se coronó, por tercera vez en su historia, campeón de la «LMF». Ese día le ganó a Gimnasia y Esgrima la serie de tres partidos definitorios de desempate cuando se jugó el tercer y último encuentro, en el estadio de Andes Talleres, con un tanteador de 4-2 favorable al "Tomba". El jugador Antonio Casale resultó ser goleador del equipo con 8 tantos. El primer encuentro se jugó el día 22 de octubre en el Estadio Bautista Gargantini de Independiente Rivadavia y resultó favorable al Lobo del Parque por 2-1, con gol bodeguero de Lucio Amaya. El segundo encuentro se disputó el día 29 de octubre en el Estadio Ingelmo Nicolás Blázquez de Andes Talleres y ganó el "Tomba" por 3-2 con 2 goles de Casale y 1 de Godoy.^[8]​

En 1950, un combinado de la Liga Mendocina logra ganar la «Copa Doctor Carlos Ibarguren», —denominado también en ese año como «Copa Libertador General San Martín», en honor a los 100 años de la muerte del Padre de la Patria—, Godoy Cruz contribuyó con Domingo Godoy, Luis Amaya, Orlando Cipolla, Jesús Elzo y Gregorio Garín. La Selección Mendocina, derrota a Racing Club por 3-2, en el estadio de Gimnasia y Esgrima de Mendoza, en ese día el Negro Godoy, marcó 2 goles para el combinado mendocino. Ese Título coronó una época brillante del fútbol local y superó a otras grandes participaciones que tuvo en certámenes similares.^[9]​

El día 28 de octubre de 1951 el "Tomba" se consagra por cuarta vez en su historia campeón de la «Liga Mendocina», al ganar la serie de dos partidos finales que debió disputar con Gimnasia y Esgrima, casualmente cómo la edición pasada. Ese año hubo que recurrir a esta serie de encuentros puesto que al finalizar la fase regular ambos clubes quedaron empatados en el primer puesto con 27 puntos cada uno. Ese día se jugó el último partido, en el Estadio Bautista Gargantini de Independiente Rivadavia, ante una multitud que establece un gran récord de recaudación para la época. El tanteador terminó favorable a Godoy Cruz por 3-0. El árbitro del encuentro fue el Sr. Harry Dyckes y los goles "bodegueros" fueron marcados en 2 oportunidades por Bartolucci y el restante por Carvajal. El primer encuentro había sido jugado el 14 de octubre, en el estadio Ing. Mauricio Serra de Atlético Argentino, con el arbitraje del Sr. Quintín Buenadisgo.^[10]​

El día 14 de noviembre de 1954 Godoy Cruz logró, por quinta vez en su historia, el título provincial. Ese día venció a Deportivo Guaymallén por 6-2, con el arbitraje de Pascual Lazo. Con esta nueva conquista el "Bodeguero" comienza a cerrar una página de oro de la historia institucional del club y de la misma LMF. A estos se le sumaría su segundo subcampeonato en 1955. Este evento resultó notable y fue destacado por los medios especializados de la época, porque Godoy Cruz contaba con una gran legión de entusiastas simpatizantes que permanentemente establecía récords de recaudación y concurrencia, el "Expreso" se había consolidado definitivamente con uno de los grandes Clubes de la región cuyana.^[11]​

• 1960 - 1990

El miércoles 6 de noviembre de 1968, después de 14 años de espera, el "Tomba" obtiene por sexta vez en su historia el campeonato provincial. Ese día le gana a Andes Talleres por 1-0, el gol del triunfo lo marcó Osvaldo Camargo, quien resultó ser goleador del equipo con 21 tantos. El árbitro fue Pablo Pascual Pérez y los jueces de línea Ricardo González y Carlos Rozaz Navarro.^{[n. 4]}​^[12]​

En 1988 Godoy Cruz se enfrentó a River Plate en un amistoso en el Malvinas Argentinas, con la presencia de 30.000 espectadores, el encuentro favoreció al "Millonario" por 2-1.

El día 17 de noviembre de 1989 Godoy Cruz se consagró, por séptima vez en su historia, campeón de la Liga provincial. Hubieron de pasar 21 años sin poder obtener el máximo trofeo local desde aquel último que había logrado en 1968.El tiempo reglamentario terminó igualado 1-1, con tanto "tombino" de Cristian Vargas. Para definir el nuevo campeón debió recurrirse a una serie de 5 penales. El arquero de Godoy Cruz Sandro de Lucca se convirtió en el gran protagonista de la noche al contener dos tiros penales, lo que le permitió al "Tomba" desnivelar el marcador y obtener el título en juego. Esa temporada el jugador "tombino" Cristian Vargas fue goleador del «Torneo General» con 12 tantos.^[13]​

El día domingo 28 de octubre de 1990 por octava vez en su historia, Godoy Cruz se consagra campeón de la «Liga Mendocina». Ese día vence, con el arbitraje de Justo Villalba, a Huracán Las Heras por 1-0 en el partido final disputado en el Estadio Malvinas Argentinas. Con este título también adquiere el derecho a participar en el «Torneo Regional 1990/91» organizado por la AFA. En ese encuentro final se produjo un histórico récord de recaudación para un partido organizado por la «Liga Mendocina de Fútbol», ascendiendo la taquilla a $267.795.000 australes, y habiéndose cubierto el 75% de la capacidad del Estadio Malvinas Argentinas hecho que confirmó el gran arraigo popular de ambas Instituciones El gol del triunfo fue marcado por Alejandro Abaurre, a los 46' del PT.^{[n. 5]}​^[14]​

• Copa de la República 1944: El día 29 de octubre de 1944 Godoy Cruz debutó en la «Copa de la República 1944», también denominado Copa General Pedro Pablo Ramírez, siendo el único representante mendocino y el segundo en disputar un torneo de AFA —después del Club Nacional Pacífico, que participó de la edición anterior del torneo—, al enfrentar al Club Graffigna de San Juan por la primera ronda del ‹Grupo B›, el conjunto "tombino" ganó el cotejo en San Juan por 1-0 pasando automáticamente a la segunda ronda el cual tenía que enfrentar a Sporting Club Victoria de San Luis en el que Godoy Cruz derrotó a su rival por 5-2 en la provincia "Puntana" pasando a la tercera y última ronda del grupo para pelear un puesto a los cuartos de final del certamen. En Mendoza se enfrentó a Talleres; el resultado fue a favor del "Albiazul" que derrotó al "Bodeguero" por 3-2 quedando así eliminado del campeonato.El plantel "tombino" fue el mismo que meses atrás obtuvo su primer título local en la historia, compuesto por Pestana y Marchessini al arco, Dionisio Ovando y Raúl Frigolé en la defensa, Lucio Izpura, Enrique Guisado y José García y en la delantera Juan Boquete, Roberto Quiroga, Luis Amaya, Domingo Godoy y José Luis Luján, alternaban el equipo Sixto Amezqueta, Roberto Zambrano y Antonio Villalba, lo dirigía técnicamente Secundino Arrieta.^[15]​

• Copa Competencia 1952: Por coronarse campeón de la edición del año anterior de la «Liga Mendocina», clasifica a la «Copa Competencia». Godoy Cruz queda eliminado ante Ferro Carril Oeste por 4-3, partido que se disputó en el Estadio Bautista Gargantini. Este partido correspondió a la ‹Fase preliminar›.^[16]​

• Copa Argentina 1969: Godoy Cruz se enfrentó con Chacarita Jrs. de Buenos Aires para disputar con el equipo porteño el primer partido de la primera rueda de la edición 1969 de la «Copa Argentina» de la AFA y además inaugurar la primera etapa de la moderna iluminación de su estadio. En esta Copa, el Expreso representaba a la «Liga Mendocina de Fútbol» en su condición de campeón de la «LMF» de 1968 y Chacarita Juniors a la AFA, en un sistema muy particular de eliminación a dos encuentros entre equipos provincianos y afistas. Ese día Godoy Cruz fue derrotado sin atenuantes, luego de ir ganando por un tanto, por un marcador de 3-1 a favor del "Funebrero". El partido fue dirigido por el árbitro Roberto Pablo Cruces, con la asistencia en las líneas de Derval Parentti y Jorge Galve. El gol bodeguero fue anotado por Jorge Núñez a los 13´del 1.er tiempo. Con este resultado Godoy Cruz sería eliminado de la competición al perder el partido de vuelta por un tanteador de 3-2, en el encuentro que jugaría en el Estadio del Club el día 9 de febrero de ese año. Fue notable que la eliminación estuviera a manos de la base del gran equipo "funebrero" que sería campeón del «Metropolitano 1969».^{[n. 6]}​^[17]​

• Copa Argentina 2011/12: Por la «Copa Argentina» Godoy Cruz se enfrentó ante Sportivo Italiano en San Juan por los treintaidosavos de final, quedando eliminado por penales tras el empate 2-2 en el partido.^[18]​

• Copa Argentina 2012/13: Godoy Cruz debuta por los ‹veinticuatroavos de final› ante Chacarita Juniors, el encuentro terminó 0-0 por lo que el partido se definía por penales, donde terminó 7-6 a favor del Bodeguero gracias a la atajada del arquero Torrico en el último tiro.^[19]​ Por los ‹dieciseisavos de final› jugó el cortejo ante Huracán de Parque Patricios, que terminó 0-0, como ocurrió en el encuentro anterior, disputando el tiro de los 12 pasos, que fue favorable una vez más a Godoy Cruz ganando 5-3.^[20]​ Después por los ‹octavos de final› jugaba ante Olimpo de Bahía Blanca, el partido terminó 3-2 a favor de Godoy Cruz, los 3 tantos del Tomba fueron convertidos por Rodrigo Salinas.^[21]​ Más tarde por los ‹cuartos de final›, se enfrenta a Arsenal de Sarandí, encuentro que termina favorable al "Viaducto", que terminó ganando 1-0, así Godoy Cruz queda eliminado del certamen.^[22]​

• Copa Argentina 2013/14: Por los ‹dieciseisavos de final›, Godoy Cruz empató 3-3 con Defensa y Justicia, partido que el Tomba perdía 3-0, y con un triplete de Facundo Castillón, logró empatar el partido; sin embargo, Godoy Cruz cae con el Halcón por penales.

• Copa Argentina 2014/15: Por los ‹treintaidosavos de final›, cae 1-0 contra el Deportivo Español, partido que se disputó en Córdoba^[23]​.

• Copa Argentina 2015/16: Godoy Cruz debuta en la temporada de la Copa por los ‹treintaidosavos de final›, venciendo 2-0 a Estudiantes de Caseros; en la siguiente ronda, derrotó a Banfield por 1-0; y finalmente pierde por ‹octavos de final› ante San Lorenzo por 3-1.

• Copa Argentina 2016/17: Por ‹treintaidosavos de final›, Godoy Cruz debuta con un triunfo ante Ramón Santamarina por 3-0; en la siguiente ronda, enfrenta a Newell's Old Boys, derrotando sobre el final a la lepra rosarina por 2-1; para ‹octavos de final›, vuelve a enfrentarse, como en el campeonato anterior a Banfield, fue otra victoria del Tomba ante el Taladro, en Alta Córdoba; finalmente en la siguiente ronda, Godoy Cruz fue derrotado 3-2 ante Rosario Central, partido que el Tomba ganaba 2-0 y el Canalla lo dio vuelta en el segundo tiempo.

• 1974: el "Tomba" disputó el viejo «Torneo Nacional». El día 26 de mayo de 1974, Godoy Cruz se consagró ganador de la ‹primera rueda› de la «Liga Mendocina de Fútbol» de ese año. El paso por el «Torneo Nacional» no fue bueno para Godoy Cruz, el "Tomba" debuta el 21 de julio de ese año, visitando a Atl. San Martín, cayendo ante el "Chacarero" por 3-2 en un encuentro entretenido. Godoy Cruz, quien integraba la ‹Zona C›, del campeonato, disputando 18 encuentros, finaliza último, tras ganar 3 encuentros, sufrir 13 derrotas y empatar en 2 ocasiones, marcando 15 goles y recibir 35. El plantel de Godoy Cruz integraba a Héctor Osvaldo Pedone —quién fue capitán del equipo—, Germán Hermeneter Pereyra, Norberto Hermes Yácomo, José Antonio Calderón, Guillermo Alfredo Berríos, Carlos Hugo Gelly, Héctor Alfredo Suárez, Oscar Humberto Paiva, Jorge Raymundo Pereyra, Alberto Francklin Ibarra, José Luis Miranda, Miguel Ángel Pasqualetto, Osvaldo José Barrera, Juan Domingo Giménez, Ciro Magallanes, Jorge Osvaldo Pereyra, Miguel Ángel Albarracin, Oscar Enrique Haak, Mario Salvador Rodríguez, Luis Rodolfo Presti, Jorge Néstor Vallejo, Hipólito Raúl Martin, Roberto Isidoro Medina, Nicasio Loyola, Gregorio Horacio Albarracin, Mario Adolfo Cornejo.^[24]​^[25]​

Recién en la década del '80 y '90, el club pudo desplegar su fútbol a nivel nacional y comenzó a hacer historia en el deporte local. Luego transitar largos y difíciles caminos, después de ganar los torneos locales de 1989 y 1990, el equipo tomo protagonismo en los torneos, logrando el objetivo de ascender a segunda división.

• Torneo Regional 1977: Godoy Cruz fue eliminado en ‹primera fase› ante Huracán de San Rafael, quién le ganó en los dos encuentros de ida y vuelta.
• Torneo Regional 1986: después de 9 años, Godoy Cruz vuelve a disputar los torneos regionales, en este caso, fue para un ascenso al «Nacional B», en la Zona mendocina, en la cual participaron 12 equipos, el Tomba terminó en la última posición.
• Torneo del Interior 1989/90: termina 3.º en el ‹Grupo A› de la Región Cuyo, eliminado por un solo punto de la competición.
• Torneo del Interior 1990/91: gana el ‹Grupo B› de la Región Cuyo y pasa al «Cuadrangular cuyano» junto con San Martín (SJ), Gimnasia y Esgrima (Mza.) y Colegiales de San Luis, donde queda eliminado.

• Torneo del Interior 1993/94: Godoy Cruz disputó la penúltima edición del «Torneo del Interior» —actualmente «Federal A»— de la temporada 1993/94. Así fue que ganando distintas etapas y atravesando todo el país en estadios inhóspitas, debutó en la ‹segunda fase de grupos› con otros 5 equipos —San Martín de San Juan, General Paz Juniors, Villa Cubas, Racing de La Rioja y Sportivo Fernández—, Godoy Cruz termina en la 2.º posición con 13 puntos, producto de 5 victorias, 3 empates y 2 derrotas con 16 goles a su favor y 8 en contra, y definitivamente logrando pasar a la siguiente estancia disputando otra ‹fase de grupos›; esta vez compitiendo con 3 rivales de la región cuyana de los cuales se enfrentó con 2 de sus clásicos —San Martín (SJ) e Independiente Rivadavia— su otro rival en el grupo fue Atlético Trinidad (SJ), el "Tomba" pasa de ronda junto al "Verdinegro" sumando 8 puntos; Godoy Cruz llegó a la ronda final jugando con Cipolletti de Río Negro y Deportivo Patagones de la ciudad homónima. Adjudicándose dicho ‹triangular›, el Expreso ganó la posibilidad de jugar la ‹final› del torneo con Guaraní Antonio Franco. Fueron dos partidos inolvidables: Godoy Cruz ganó en Mendoza 1-0 y logró soportar en Misiones el empate, el Bodeguero dirigido por Alberto Isaías Garro y conformado por una inolvidable camada de prestigiosos jugadores de la cantera, se ganó el ascenso al «Nacional B». Fue el único mendocino en levantar dicho trofeo, al cual lo disputaban 132 equipos de todo el país.^[26]​

Además de los jugadores nombrados anteriormente, fueron parte de ese plantel Claudio Alejandro Bengolea, Gustavo Lillo, Diego Astudillo, Marcelo Daniel Suárez, Gustavo Daine, Martín Puppato, Sergio Rodríguez, Gustavo Cando, Alejandro Cubertino, Enrique Dierna, Carlos Riquelme y Pablo Hloska.

Godoy Cruz se mantuvo en ese torneo por 12 largos años. Los primeros años fueron muy positivos, logrando la clasificación al «Torneo Reducido» en tres oportunidades consecutivas; pero también estuvo cerca de descender, aunque ese riesgo no pasó a mayores.

• Nacional B 1994/95: en el debutó con un triunfo sobre Atlético Tucumán, 1-0 en Mendoza y con un estadio colmado, obtuvo una grata sorpresa, terminaba esta primera incursión consolidado como uno de los mejores equipos de la categoría. Al momento de terminar el Campeonato se habían jugado 42 fechas de las cuales el Tomba termina 4º con 50 unidades, así llegaba a jugar un «Torneo Reducido» para pelear con otros 7 equipos el segundo puesto en «Primera División» —el primero lo ocupó Estudiantes (LP), por ser el campeón—, en el que pierde en ‹semifinales› frente a Colón (SF). había ganado en 20 encuentros, empatado en 10 de ellos y perdido en 12 oportunidades. Convirtió 68 goles, recibió 49 y el goleador del equipo y de la temporada, con 29 tantos, fue el jugador "bodeguero" Juan Alejandro Abaurre. Con esta campaña acumuló 50 puntos en su haber, obtuvo el tercer mejor promedio para el descenso. Así llegó a jugar su primer Torneo Reducido, enfrentando a Quilmes en ‹cuartos de final›, empatando en ambos encuentros de ida y vuelta el Tomba pasó a ‹semifinales› por el gol obtenido fuera de casa. En ‹semi› enfrenta a Colón de Santa Fe, con el que empata en Mendoza 0-0 y termina cayendo en Santa Fe por 5-0.

• 1995/96 en la temporada «1995/96», por el «Torneo Apertura 1995», termina 6º con 34 unidades. Debuta de local el 13 de agosto ante San Martín de San Juan, el clásico terminó 1-1, su primera derrota fue de visitante ante Huracán de Corrientes, y cae después ante Instituto de Córdoba en condición de local, gana por primera vez al derrotar en Pergamino a Douglas Haig, su primera victoria en Mendoza fue ante Chacarita ganándole 2-0, la mejor goleada obtenida por el Tomba fue cuando aplastó 5-1 al Deportivo Morón una de sus peores derrotas en el torneo, fue cuando enfrentó a Nueva Chicago cayendo 4-0 Por el «Torneo Clausura» termina 7º con 32 unidades. el goleador del equipo tombino en el campeonato fue Darío Ojeda con 12 goles ubicándose en la 2º posición en la tabla goleadora, superado por Klimowicz de Instituto con un gol más que este último. Con el puntaje obtenido en ambos torneos de la temporada, le alcanzó para disputar el «Torneo Reducido» en que pierde en ‹cuartos› con Unión de Santa Fe —club que obtuvo el segundo ascenso a Primera—.

• 1996/97: siendo un formato diferente a otras temporadas, Godoy Cruz finalizó 1º en el ‹Grupo B› del Interior con 28 puntos, así llegando a jugar la ‹Zona Campeonato› en el que finaliza 3º con 48 unidades, a 4 puntos del campeón Argentinos Jrs., de este modo el "Tomba" debía jugar el «Torneo Reducido» por tercera vez consecutiva para obtener el segundo ascenso, perdiendo en ‹cuartos de final› frente a Sp. Italiano.

El 9 de agosto de 1996, Godoy Cruz Antonio Tomba concretó una fusión con Academia Chacras de Coria Fútbol —quien disputaba el torneo «Argentino B» en ese momento—, para disputar el Nacional B, llevaba el nombre de «Atlético Mendoza» o también nombrado como «Godoy Cruz-Chacras». La razón de esta unión de ambos clubes fue por una idea del presidente tombino Julio Vega, que por los problemas financieros del club, inició los contactos con Eduardo Bauzá —hijo del reconocido político mendocino—, presidente de Chacras de Coria, para una unión. Finalmente quedó concretada la fusión entre Godoy Cruz y Chacras, que participaba en el Argentino B como «Atlético Mendoza». Este proyecto nació de las conversaciones mantenidas por Independiente Rivadavia y Godoy Cruz Antonio Tomba, que intentaban una alianza económica que con el correr del tiempo se fue disminuyendo por distintos motivos, uno de ellos fue por el rechazo de ambas aficiones. La alianza duró una temporada —1996/97—, el director técnico del equipo fue Humberto Grondona (h).

• 1997/98: en la ‹Zona del Interior› termina 9º con 42 unidades, llegando a jugar la ‹Zona Permanencia› del Interior para no perder la categoría, finaliza 5º con 14 unidades, quedó a un solo punto del descenso.

• 1998/99: en la ‹Zona del Interior› termina 14º con 30 unidades, volviendo a quedar a una unidad del descenso, pero clasificando al «Torneo Reducido» en donde quedó eliminado por penales ante Cipolletti en ‹Primera Ronda›.

• 1999/00: en la ‹Zona del Interior› termina 7º con 43 unidades.

• 2000/01: en la ‹Zona del Interior› terminó 9º con 44 unidades.

• 2001/02: el torneo se dividió en dos torneos, como en la temporada «1995/96» en el «Apertura» termina 23.º con 21 unidades; y por el «Clausura» en el ‹Grupo C› finalizó puntero con 26 unidades. Godoy Cruz salvó su permanencia en la B, después de las malas campañas en temporadas anteriores. El 9 de abril de 2002 Godoy Cruz juega el clásico ante Independiente Rivadavia, partido que la Lepra tenía la necesidad de ganar al "Tomba" para zafar del descenso a la tercera división del fútbol argentino. Godoy Cruz ganó el clásico por 1-0 con gol de Abaurre, con este resultado, el Expreso condena a los Azules a jugar al «Argentino A» de la posterior temporada. Este partido es recordado por los simpatizantes bodegueros hasta ahora por lo que se influyó ser ‘protagonista’ del descenso de unos de sus rivales.^[27]​. Finalizando la temporada, Godoy Cruzjuega por quinta vez el «Torneo Reducido», cayendo ante Arsenal de Sarandí en ‹Octavos›.

• 2002/03: por el «Torneo Apertura», termina 10º con 26 unidades; y por el «Clausura», termina 4º con 32 unidades.

• 2003/04: por el «Torneo Apertura», termina 11º con 25 unidades; y por el «Clausura», termina 4º con 33 unidades.

• 2004/05: por el «Torneo Apertura», termina 14º con 22 unidades; y por el «Clausura», termina 12º con 25 unidades.

• 2005/06: luego de varios años de espera, lucha y esfuerzo, durante el año 2005 logró el campeonato «Apertura» del «Torneo de Primera B Nacional»,^[28]​ al haber obtenido 40 puntos, producto de 12 victorias, 4 empates y 3 derrotas con 29 goles a su favor y 14 en contra, su debut fue el 6 de agosto cuando derrota a Belgrano 1-0 en el Malvinas Argentinas con gol de Gonzalo Prósperi, su primera derrota de las 3 que sufrió en el campeonato fue ante su rival cuyano, San Manrtín (SJ), perdiendo de local 2-0, fue la única caída en Mendoza, las otras 2 derrotas fueron ante la Comisión de Actividades Infantiles en Comodoro Rivadavia por 2-1, y ante Almagro por 2-0, con quien peleaba el título con el "Expreso" hasta la última fecha, el 3 de diciembre de 2005, como se nombraba anteriormente, Godoy Cruz se consagró campeón al derrotar a Ben Hur 1-0, con gol de Mauro Poy, cuando quedaba 5 minutos para terminar el partido, con un hombre menos, en el equipo, Godoy Cruz tuvo a 3 goleadores con 5 tantos —Giménez, Torresi y Poy—,^[29]​ así le dio derecho a disputar dos finales contra Nueva Chicago —el campeón del «Clausura»—. El 16 de mayo de 2006, se disputó la primera final en Mataderos, con 7.000 hinchas "tombinos" apoyando al equipo, el encuentro terminó 1-1,^[30]​ Godoy Cruz se puso en ventaja gracias al gol de Mariano Torresi, después el empate del local lo convirtió Federico Higuaín. El 20 de mayo de 2006 el club logra ascender por primera vez en su historia a «Primera División» en el Malvinas ante 40.000 personas alrededor del partido, al haber ganado a Chicago 3-1, con 2 goles de Daniel Tanque Giménez y uno de Diego Villar para el "Bodeguero", y Cesar Carranza para el "Torito de Mataderos"; así Godoy Cruz gana en el resultado global 4-2.^[31]​^[32]​^[33]​

Además de los jugadores nombrados anteriormente, también fueron parte de ese ascenso Cristian Aracena, Benjamín Carabajal, Pablo Paez, Enzo Cappa, Javier Castro, Alejandro Abaurre, Julio Mugnaini, David Fernández, Cristian Ruiz, y Lucas Javier Martínez.

• 2007/08: lejos de caerse, como muchos otros equipos que comenzaban una caída libre tras su experiencia en primera, Godoy Cruz mantuvo la expectativa de que se podía lograr nuevamente el ascenso, y así, con el "Checho" Batista primero y Daniel Oldrá después, volvió a ascender tras un año en la «B Nacional». La llegada a primera se produjo de manera directa, venciendo a San Martín de Tucumán quedando en segundo lugar justamente ante el Santo^[34]​^[35]​, no llegando a ser campeón por un punto, aunque con el mérito de regresar a primera. De ahí en, Godoy Cruz no volvió a jugar la segunda división hasta el día de hoy.

Después de la disolución de los antiguos «Campeonatos Nacionales», Godoy Cruz se convierte en el primer club de la región cuyana y el único mendocino en alcanzar el ascenso a primera; además de ser el equipo cuyano que más temporadas jugó en primera división.

• 2006/07: la estadía en primera no fue nada fácil para el conjunto tombino. La primera parte del torneo arrojó un total de 17 puntos, los cuales serían demasiado bajos para lograr pensar en mantener la categoría, sin embargo en ese «Apertura 2006» el conjunto bodeguero obtuvo un triunfo resonante en la provincia, venciendo nada más y nada menos que al Independiente por primera vez en su historia.^[36]​ Por el «Torneo Clausura» obteniendo 25 puntos, el resultado fue bueno, y logró generar una confianza luego del agónico triunfo de visitante frente a River Plate.^[37]​ Sin embargo al "Tomba" no le alcanzó para salvarse de la promoción en él tenía la obligación de disputar para permanecer en Primera.^[38]​ Godoy Cruz tuvo que disputar la promoción para mantener la categoría frente a Huracán en que pierde ambos encuentros —0-2 en Parque Patricios y 2-3 en Mendoza— y el día 24 de junio de 2007 desciende de categoría, volviendo a jugar en la «B Nacional».^[39]​

• 2008/09: Por el«Apertura 2008» el club logra el 12º lugar en la tabla de posiciones, lo cual ponía en riesgo al equipo pensando en la tabla de promedios. Su técnico, Daniel Oldrá, decide dar un paso al costado para seguir con su gran trabajo en las divisiones inferiores del club. De esta manera asume Diego Cocca como director técnico,^[40]​ comenzando su labor en el «Clausura 2009». Los resultados mejoraron debido al buen juego que proponía el equipo; de esta manera alcanza el 9° puesto y logra salvarse del descenso directo y de la promoción tras un gran triunfo en Mendoza contra River Plate, después del triunfo el Tomba aseguró su permanencia en primera.

• 2009/10: para la temporada siguiente en la «Torneo Apertura 2009», no logró perdurar más de un torneo dado que no hubo una buena convivencia entre el plantel, cuerpo técnico, directivos y aficionados. Por estas razones, durante la disputa del torneo, acontece el despido de Diego Cocca luego de un comienzo con apenas una victoria en 12 encuentros.^[41]​ El 3 de noviembre de 2009, luego de un breve interinato de Daniel Oldrá, se designa a Enzo Trossero como sucesor de Diego Cocca.^[42]​ Tras las malas actuaciones del equipo bajo su mando y ya consumado el «Apertura 2009» la Comisión Directiva del club decide despedir a Enzo Trossero.^[43]​ Debido a los numerosos conflictos que sufrió el equipo durante ese semestre, logró alcanzar nada más que 16 puntos, lo cual ponía en riesgo la permanencia en primera nuevamente. Ya con más tiempo para decidir y a pocos días del inicio de la pretemporada de verano, es contratado Omar Asad como nuevo director técnico.^[44]​ En el «Torneo Clausura 2010» el club hizo una excelente campaña futbolística,^[45]​ pues no sólo escapó al descenso directo y a la promoción, sino que también terminó en tercer puesto y cosechó 37 puntos —que lo posicionan como el club indirectamente afiliado a la AFA con más puntos en un torneo corto—.^[46]​

• 2010/11: para el «Clausura 2010», Godoy Cruz vuelve a tener una gran campaña, logrando el 5°. De esta manera, bajo la dirección técnica de Omar Asad, Godoy Cruz clasifica a la «Copa Libertadores», por primera vez en su historia. Es el quinto equipo del interior en clasificar a este torneo,^[47]​ el segundo indirectamente afiliado a la AFA —luego de que Talleres de Córdoba disputará la edición del «2002»—, y el primer equipo mendocino en lograrlo.^[48]​ Con la excelente conducción de Jorge da Silva, se repite el 3° lugar alcanzado en el «Clausura 2011», torneo en el cual, el Tomba fue muy perjudicado en partidos contra Olimpo y Banfield, que lo alejaron de pelear hasta el último tramo del torneo, de todas maneras, Godoy Cruz logró la histórica clasificación a la «Copa Sudamericana» al ganarle a Racing Club en Avellaneda, jugando por primera vez el segundo certamen más importante del continente.^[49]​^[50]​

• 2011/12: Después de las grandes campañas que realizó el Tomba anteriormente, no ha En la última fecha del «Apertura 2011» contra Atlético Rafaela ganaría 2-0, resultado que lo llevaría a la «Copa Libertadores 2012», donde escribiría una nueva página de gloria para Godoy Cruz.^[51]​ En el verano del 2012, con la nueva dirección de Nery Pumpido^[52]​ se proclama campeón de verano por el «Torneo YPF de verano» — o «Copa Ciudad de Mendoza»—. Godoy Cruz hizo una mala temporada, de 38 puntos, Nery Pumpido renunció a su cargo pocas fechas antes del final del campeonato, debido a la mala campaña.^[53]​ Eso hizo que Omar Asad volviera a dirigir a un Godoy Cruz obligado a hacer una buena campaña en la temporada siguiente, para no complicarse con los promedios.^[54]​

• 2012/13: Godoy Cruz tuvo un arranque positivo; sin embargo, ha vuelto a tener malos resultados, por lo que Asad decidió renunciar como entrenador, tras 7 partidos sin victorias dirigiendo al Tomba. En la ‹fecha 18› del «Torneo Inicial 2012», asumiría como técnico Martín Palermo.^[55]​^[56]​ El "Titán" debutó cómo DT del Tomba ante Quilmes en el Estadio Malvinas en el que encuentro terminó empatado en cero.^[57]​ Por el Torneo Final, el Expreso debutó contra All Boys llevándose 1 punto de Floresta al empatar 1-1.^[58]​ La primera victoria, del "Titán" dirigiendo al Expreso fue una fecha después de enfrentar al Albo, venciendo a Unión de Santa Fe por 2-1.^[59]​ Bajo la conducción de Palermo, el equipo logró por primera vez desde que está en Primera División, ganar tres partidos de visitante en forma consecutiva al derrotar a Atlético de Rafaela,^[60]​ Independiente^[61]​ y San Martín (SJ)^[62]​ respectivamente. El equipo "tombino" cerraría un «Torneo Final» más que aceptable, con 29 puntos y en el sexto lugar, una de las mejoras campañas de Godoy Cruz en «Primera División». A pesar de haber hecho una buena campaña, el Tomba estaba obligado a conseguir una buena cantidad de puntos en la «Temporada 2013/14» para permanecer en la categoría.

• 2013/14:Por el «Torneo Inicial 2013», Godoy Cruz debuta con una victoria ante Argentinos Jrs. por 3-1^[63]​ una victoria que necesitaba para permanecer en Primera A ya que inició la temporada en zona de descenso, en la 11° fecha el "Tomba" logra cortar una mala racha de no triunfar de visitante, ya que ganó el cotejo a Lanús por 1-0,^[64]​ su último encuentro ganado de visitante fue en el clásico ante San Martín (SJ) en el torneo anterior a este. Después de sufrir tres derrotas al hilo en las últimas tres fechas del campeonato Martín Palermo deja la conducción del Tomba ya que su contrato vencía a fin de año, y el presidente "tombino" José Mansur se niega a renovarle,^[65]​ el último partido de Palermo como DT del "Tomba" fue de visitante en el cual cae ante Racing Club,^[66]​ después del partido Palermo dijo en los medios: «Estoy más que agradecido a Godoy Cruz»^[67]​ por lo que el "Titán" tuvo su primera experiencia como director técnico en Godoy Cruz; Palermo hizo una muy buena campaña con Godoy Cruz, siendo una de las mejores de las últimas dos temporadas, ya que logró en 2013 un total de 53 unidades, con 13 victorias, 14 empates y 11 derrotas con 40 goles a favor y 33 en contra.
  Godoy Cruz finaliza el 2013 en zona de descenso a pesar de la buena campaña, necesitando como mínimo una cantidad de 25 puntos en el «Torneo Final 2014» para permanecer en la categoría. El reemplazante de Palermo en Godoy Cruz para el torneo entrante sería Jorge Almirón, quien venía de dirigir en el fútbol mexicano.^[68]​ En el comienzo del Torneo Final 2014, un torneo decisivo para Godoy Cruz en la permanencia en Primera División, pierde ante Argentinos Juniors, un rival directo que compitía lo mismo que el "Tomba",,^[69]​ pero en la fecha posterior recibe a Quilmes en Mendoza, ganándole a este 2-0, siendo la primera victoria de Almirón dirigiendo al equipo,^[70]​ 5 días después del último encuentro disputado, visita a River Plate, en el Estadio Monumental, fue victoria del "Bodeguero" por 2-1,^[71]​ este sería la cuarta victoria del "Expreso", en condición de visitante ante el "Millonario", días después, recibe a Rosario Central, en día de lluvia en lo que sería triunfo por goleada de Godoy Cruz 3-0 con un hat-trick de Castellani^[72]​ llegando al tercer trunfo al hilo para el "Tomba". Al terminar la temporada, el Tomba se salva del descenso, en la última fecha del certamen derrotando a Racing por 2-1, logrando una brillante campaña,^[73]​ llegando a ser cuarto detrás del campeón River Plate, e igualando, con 32 puntos, a Boca Juniors (2°) y Estudiantes de La Plata (3°), pero con peor diferencia de gol, además de clasificar a la «Copa Sudamericana 2014».

• Transición 2014: Tras la renuncia de Almirón como DT de Godoy Cruz en plena pretemporada, a causa del "desmantelamiento" del plantel y la poca llegada de refuerzos.^[74]​ Su sucesor es Carlos Alberto Mayor, quien ha tenido malos resultados en el equipo, que lo llevó a presentar su renuncia tiempo después; Daniel Oldrá lo sucederá en lo último del tramo del «Torneo de Transición 2014», que lo llevó a conseguir buenos resultados, obteniendo 2 victorias de visitante, dos derrotas y un empate, dos de los partidos más destacados que le tocó dirigir fue contra Atlético de Rafaela —en su debut—, venciendo a la "Crema" de visitante por 4-3.,^[75]​ y en el otro, contra Vélez Sarsfield, con goleada de Godoy Cruz por 4-1, en el Estadio José Amalfitani,^[76]​ este sería la primera victoria del "Tomba", visitando al "Fortín". Al finalizar el 2014, Oldrá es contratado para dirigir al equipo en la temporada 2015.^[77]​

• 2015: Después de los resultados positivos del equipo, Oldrá seguiría como entrenador para dirigir al equipo en el campeonato anual. Sin embargo no le fue bien, y el 8 de junio, Daniel Oldrá, presentó su renuncia como director técnico del Tomba, cerrando su segunda gestión como entrenador profesional del equipo, en el torneo de «Primera División de 30 equipos», su último encuentro fue ante Arsenal de Sarandí, dejando un saldo de 17 puntos, producto de 4 victorias, 5 empates y 6 derrotas, en su gestión durante el campeonato.^[78]​ A su lugar, lo remplaza Gabriel Heinze, que viene de debutar como entrenador en Godoy Cruz, el 15 de junio. En su debut como entrenador del "Tomba", logra una victoria de local ante Crucero del Norte, venciéndolo por 3-0.^[79]​ El paso de Heinze no fue de lo más exitoso, solo logró 2 victorias —una en su debut y otra en el Clásico de Cuyo, a San Martín (SJ), al que le rompió un invicto de 15 meses como local—, 2 empates y 6 derrotas, obteniendo una efectividad del 27%.

• Transición 2016: El reemplazo de Oldrá, para el «Torneo de Transición 2016» fue Sebastián Méndez. En el inicio de la temporada 2016, Godoy Cruz realizó un gran primer semestre aprovechando un torneo corto que se jugó por 2 zonas de 15 equipos cada uno. El "Expreso" comenzó la temporada en la ‹Zona 1› perdiendo ante Rosario Central en Arroyito 1-0, igual fue de menor a mayor y llegó a la fecha final con claras chances de ganar su grupo y medirse con Lanús —ganador de la ‹Zona 2›— para definir el campeón. En la última jornada el "Tomba" perdió 2-0 con San Martín de San Juan y gracias al empate de San Lorenzo ante Banfield fue el "Ciclón" el que disputó el partido definitorio con el "Granate". Godoy Cruz jugó por el tercer lugar en Córdoba ante Estudiantes y fue derrotando, cerrando el torneo en un muy buen cuarto puesto lo que le dio la chance de jugar en 2017 su tercer «Copa Libertadores».

• 2016/17: el comienzo de temporada para el equipo no fue buena, Méndez deja se ser el técnico del equipo a y su sucesor para dirigir al Tomba en la segunda mitad del torneo, es Lucas Bernardi, que tuvo una muy buena campaña con Godoy Cruz.

• 2017/18: El campeonato pasa a llamarse «Superliga Argentina», y en esta temporada la disputaron 28 equipos. Tras la salida de Lucas Bernardi de la dirección técnica, asume el uruguayo Mauricio Larriera, quién dirigió al equipo solo en la primera mitad del campeonato^[80]​. El equipo de Larriera ganó todos sus partidos de local mientras dirigió a Godoy Cruz, sin embargo, de manera visitante logró solo una victoria y muchas derrotas; Larriera presentó su renuncia a fin de año, después de que el equipo no ha logrado tener rendimiento de juego^[81]​. Días después asume Diego Dabove para ser el entrenador de Godoy Cruz en la segunda parte del torneo, venía de dirigir a la reserva del club^[82]​; el equipo dirigido por Dabove logró una identidad de juego, de los 16 partidos jugados en el semestre, ganó 12, empató 3 y perdió solo uno, en medio de esta campaña, Godoy Cruz logró un récord de 6 victorias consecutivas. El equipo tombino fue posicionado como uno de los mejores equipos con mejor rendimiento del mundo, obteniendo el 81,25% de efectividad^[83]​. Gracias a esta campaña, Godoy Cruz se aseguró por cuarta vez la clasificación a la «Copa Conmebol Libertadores 2019»^[84]​. El 13 de mayo de 2018, Godoy Cruz consiguió el primer subcampeonato de la historia, obteniendo 56 puntos en la temporada, a 2 puntos de Boca Juniors^[85]​^[86]​. La campaña de Godoy Cruz en la «Superliga» fue la mejor de su historia y una de las mejores que ha hecho un equipo del Interior en «Primera División».

También formaron parte del plantel, los porteros Roberto Ramírez, Ramiro Martínez y Juan Cruz Bolado; los defensores Leonel Galeano, Brian Alférez, Sebastián Olivares, Facundo Cobos y Cristian Báez; los mediocampistas Walter Serrano, Valentín Burgoa, Luciano Pizarro, Fabián Henriquez, Diego Riolfo, Felipe Rodríguez, Juan Andrada, Leandro Lencinas y Agustín Manzur; y los delanteros Victorio Ramis, Tomás Badaloni, Lucas Agüero y Ezequiel Bullaude.

Godoy Cruz es el vigésimo tercer equipo argentino y quinto club del interior en disputar torneos internacionales, su primera participación fue en la «Copa Libertadores 2011». El Tomba es el club inderectamente afiliado que más veces disputó torneos continentales, con cinco participaciones —3 «Copas Libertadores» y 2 «Copas Sudamericana»—.

• Copa Libertadores 2011

En el debut de la «Copa Libertadores 2011», por el <Grupo 8>, el "Tomba" derrota a LDU Quito por 2-1,^[87]​^[88]​ en el segundo partido cae de local frente a Peñarol por 3-1,^[89]​ en el tercer partido vuelve a la victoria frente a Independiente en Avellaneda (Buenos Aires) ganándole por 3-1,^[90]​ después vuelve a enfrentar al Rojo en condición de local y el partido termina 1-1,^[91]​ en el quinto partido el "Expreso" viaja a Uruguay para enfrentar a Peñarol, el partido terminó 2-1 a favor de los Carboneros^[92]​ y en la última fecha viaja a Ecuador para enfrentar a LDU Quito, el partido no favoreció al "Bodeguero" ya que perdió 2-0 con el conjunto ecuatoriano.^[93]​ Y así con el "Polilla" Jorge Da Silva en la conducción, se ha realizó una muy digna «Copa Libertadores 2011», no pasando de fase por solo dos puntos.

• Copa Libertadores 2012

En el debut de la «Copa Libertadores 2012», otra vez por el <Grupo 8> derrotó por 1-0 a Peñarol,^[94]​ después pierde por goleada frente a Universidad de Chile en el país "trasandino"^[95]​ y empató por 4 a 4^[96]​ y 2 a 2^[97]​ con Atlético Nacional en la fase de grupos. Godoy Cruz quedó eliminado de la «Copa Libertadores 2012» tras ser derrotado 1-0 con el Universidad de Chile^[98]​ un partido antes del final de la fase de grupos.

• Conmebol Libertadores 2017

Luego de 5 años, Godoy Cruz vuelve a disputar el certamen continental más importante de América. Compartiendo grupo esta vez con Atlético Mineiro de Brasil, Libertad de Paraguay y Sport Boys Warnes de Bolivia. En la primera jornada de la edición 2017, por el ‹Grupo 6›, el Tomba empata 1-1 con el conjunto brasileño, en el encuentro disputado en el Malvinas Argentinas.^[99]​ Luego, da una buena presentación en Asunción, ganándole a Libertad por 2-1, a lo que sigue la victoria como local ante los bolivianos, por 2-0.^[100]​ En los encuentros de vuelta, vence por un marcador de 3-1 en su visita a Santa Cruz de la Sierra, empata en Mendoza 1-1 con el combinado paraguayo, clasificando así por primera vez a ‹octavos de final› una fecha antes,^[101]​ y finalmente cae goleado por 4-1 en Belo Horizonte, terminando así como segundo del grupo. Ya en ‹Octavos de final› el rival que recibió en el sorteo fue Grêmio. En el partido de ida disputado en Mendoza cae 1-0 y en la vuelta, en Porto Alegre, vuelve a caer, esta vez 2-1, cerrando una histórica campaña en el torneo internacional.

• Copa Sudamericana 2011

En la «Copa Sudamericana 2011» en el partido de ida frente a Lanús, empata 2-2.^[102]​ En la vuelta empata nuevamente, pero esta vez por 0-0^[103]​ y de esta manera pasa a los octavos de final. En los octavos le toca con Universitario de Deportes, donde en la ida empata, en Mendoza 1-1,^[104]​ en la vuelta en Perú 1-1 otra vez, lo que los llevaría a los penales, donde el "Expreso" perdería con la "Crema" por 3-2.^[105]​

• Copa Sudamericana 2014

Después de dos años, Godoy Cruz disputa por segunda vez la «Copa Sudamericana», esta vez la del 2014, es su cuarta participación a nivel internacional. Si bien, el "Tomba" no pudo llegar a otra distancia del certamen más que la ‹segunda fase›, enfrentando a River Plate; el "Expreso", cayó en los dos encuentros, de ida y de vuelta, quedando eliminado de la competencia.

• Primer amistoso

El día 26 de marzo de 1933 Godoy Cruz enfrentó al Santiago Badminton Football Club de Santiago de Chile; que había sido invitado por el Club bodeguero en su condición de Campeón invicto de la «Primera División de Chile» en 1932. El encuentro tuvo lugar, ante una gran multitud de aficionados, en la cancha que la Institución tenía en Calles Castelli y Las Heras del Departamento de Godoy Cruz. El encuentro fue dirigido por el recordado árbitro mendocino Aldo Conte. En la ocasión el "Tomba" formó con: Basilici, González, Telli, Tejada, Suárez, Fernández Vega, Iluminatti, Abraham, Gil, García (reemplazado por Ordez) y Quinteros. El tanteador resultó favorable a los "trasandinos", con un marcador final de 3-2, dentro de un partido sumamente parejo en el que los bodegueros lograron igualarlo en dos ocasiones y luego de haber sido dominadores absolutos del segundo tiempo. Los tantos bodegueros fueron marcados en ambas ocasiones por Gil, el primero de tiro libre penal a los 24´ del primer tiempo y el segundo a los 30´del segundo tiempo. Esta presentación fue premonitoria para el futuro del "Bodeguero", puesto que durante el Campeonato de la Liga Mendocina de Fútbol 1933 cumpliría una de sus mejores temporadas, desde su creación. La delegación del Club chileno, había arribado el día 17 de marzo y estaba compuesta por dirigentes y los jugadores Cabrera, Núñez, Donoso, Destefani, Sánchez, Palma, Torres, Núñez, Arancibia, Becerra y Luco.

• Godoy Cruz vs. Santos (BRA)

Godoy Cruz se engrandecía cada vez más como institución, el constante trabajo en divisiones inferiores lo llevó a ser hoy en día el líder en esa materia. Por esos años se produjeron dos acontecimientos muy importantes en la historia del fútbol mendocino: la visita del Santos de Pelé al Feliciano Gambarte el 1 de marzo de 1964, en la cual el equipo brasileño derrotó al equipo tombino por 3-2. Los goles fueron marcados por Toninho a los 29´ del PT y los restantes en el ST por Hardaan Curi a los 4´, Peixinho a los 14´, Marchiori de penal a los 24´ y Peixinho a los 44´. Godoy Cruz formó con: Juan Filizzola, Atilio Marchiori, Hugo Sitta, Juan Carlos Díaz, Tito Torres, Jorge Entrerríos, Patricio Jofré, José María Feijoo, Víctor Legrotaglie, Lisboa (Hardaan Curi), Osvaldo Aliendro y Juan Fernández (Roberto Reggio). Los suplentes fueron: Pieruz, Cortez y Santilli y el Director Técnico fue: Luis Alonso Pérez. Santos formó con: Gilmar, Ismael, Geraldinho, Mengalvio (Lima), Haroldo, Joel, Peixinho, Rossi, Toninho (Aldir), Pelé y Pepe (Dorval). Los suplentes fueron: Laercio, Juan Carlos, Dalmo y Zito y el Director Técnico fue: Vianna Da Silva.^[106]​

• Universidad de Chile vs. Godoy Cruz

Por los muy buenos desempeños que tuvo durante su gira a Chile en los partidos amistosos, Godoy Cruz fue invitado a prolongar su estadía para enfrentar a la Universidad de Chile, encuentro que ganó el "Tomba" 3-0 al conjunto "Azul".

• Godoy Cruz vs. Selección Argentina

El otro cotejo fue la visita de la Selección Argentina de Fútbol en la Bodega el 28 de febrero de 1970, imponiéndose por un ajustado 3-2 el equipo tombino. Aunque la selección no jugó con todos sus titulares, ese triunfó no quitó méritos en los jugadores. Los tantos bodegueros fueron anotados por Gómez a los 7´, Garro a los 30´ y Castro a los 35´. Godoy Cruz formó con: Héctor Pedone, Juan Carlos Pereyra, Óscar Trentino, Luis Solé, Alberto Castro, Miguel Albarracín, Alcides José Schanz (Jorge Santilli), Hugo Manuel León, Orlando Garro, Óscar Gómez (refuerzo Juan de Dios González) y Mario Puppatto (refuerzo Carlos Lumbía) y el Director Técnico fue Orlando Cippolla. Argentina formó con: Mario Agustín Cejas (Miguel Santoro), Óscar Malbernat, Roberto Perfumo, Roberto Rogel, Rubén Díaz, José Omar Pastoriza, Miguel Brindisi, Pedro González (Luis Giribert), Rodolfo Fischer, Carlos Veglio (Daniel Onega) y Óscar Más. Era Director Técnico Osvaldo Zubeldía.^[107]​

• Selección de Chile vs. Godoy Cruz

El 15 de Márzo de 1970 "El Expreso" fue de gira a Chile para enfrentarse ante la Selección chilena por el torneo amistoso «Cuadrangular Internacional de Temuco», el "Tomba" terminó derrotando a la "Roja" por 4-3, los goles "bodegueros" fueron anotados por Camargo a los 15´, Gómez a los 25´, Orlando Vicente Garro en dos ocasiones (a los 54´ y a los 87´), los goles de la Selección Trasandina fueron convertidos en dos ocasiones y de penal por Castro, a los 27´ y a los 91´ y el restante fue convertido por Messen. De este modo el "Tomba" de quedó con el Cuadrangular. Godoy Cruz formó con: Héctor Pedone, Juan Carlos Pereyra, Óscar Trentino, Luis Solé, Alberto Castro, Miguel Albarracín, Alcides José Schanz (Jorge Santilli), Hugo Manuel León, Orlando Garro, Óscar Gómez (refuerzo Juan de Dios González) y Mario Puppatto (refuerzo Carlos Lumbía) y el Director Técnico fue Orlando Cippolla. Chile formó con: Adolfo Nef, Caupolicán Peña, Leonel Herrera Rojas (Elías Figueroa), Rafael González Córdova, Roberto Hodge, Alfonso Lara, Guillermo Páez, Eduardo Cortázar, Leonardo Véliz (Sergio Messen), Osvaldo Castro y Carlos Caszely. Era Director Técnico Francisco Hormazábal.^[108]​

• Godoy Cruz vs. Selección de Polonia

En 1977, Godoy Cruz se enfrentó en un amistoso ante la Selección de Polonia, ocurrió cuando la selección europea fue de gira a Argentina hasta llegar a Mendoza para disputar un amistoso frente al Bodeguero, el partido finalizó 1-1.

• Godoy Cruz vs. Sevilla (ESP)

El 25 de mayo de 1990 el Sevilla de España fue de gira a Argentina, inclusive a Mendoza para enfrentarse en un amistoso frente a Godoy Cruz, en el Feliciano Gambarte, en ese encuentro jugaba el Norberto "Beto" Alonso para "El Expreso". El partido terminó 2-0 a favor de Sevilla.^[109]​

• Godoy Cruz vs. Nacional (URU)

Llegado el año 2007, Godoy Cruz disputó un partido amistoso en verano en el Malvinas Argentinas ante Nacional de Montevideo, aplastando a la entidad uruguaya por 5-0, los tantos fueron convertidos por Martín Arzuaga, Gustavo Pinto, Salomón, Poy y Torresi.^[110]​

• Otros amistosos
  • Godoy Cruz 2-1 Everton de Viña del Mar (CHI) - 1954.
  • Deportes Concepción (CHI) 0-2 Godoy Cruz - 15 de febrero de 1969.
  • Santiago Wanderers (CHI) 0-1 Godoy Cruz - 18 de febrero de 1969.
  • Godoy Cruz 3-0 Guaraní (BRA) - 1971.
  • Unión Española (CHI) 2-2 Godoy Cruz - 1976.