El Departamento de Cochabamba fue fundado en base a la intendencia de Cochabamba por Decreto Supremo del 23 de enero de 1826.^[1]​

Entre 1826 y 2010 el departamento estaba gobernado por la Prefectura de Cochabamba, dependiente del Poder Ejecutivo nacional y que estaba al mando de un Prefecto y Comandante General designado por el Presidente. Desde 2010 y a partir de la Constitución Política del Estado de 2009, el departamento esta gobernado por el Gobierno Autónomo Departamental como componente del Órgano Ejecutivo departamental, el cual tiene como Máxima Autoridad Ejecutiva a un Gobernador electo cada 5 años en Elecciones Subnacionales.

La Ley del Régimen Electoral vigente (Ley N° 026 del 30 de junio de 2010) define segunda vuelta electoral para candidatos que superen a su adversario más cercano con el 10% o más pero no lleguen al 40% más, o que si superen el 40% pero no a su oponente con el 10% o más.^[2]​

A continuación, la lista de los prefectos y gobernadores del Departamento.

• 1785-1809 - Francisco de Biedma
• 1809-1810 - José González de Amada
• 1810-1811 - Francisco del Rivero
• 1811 - Antonio Allende
• 1811-1812 - Joaquín Mariano Antezana
• 1812-1813 - Gerónimo Marrón de Lombera
• 1813 - Miguel José de Cabrera
• 1813 - Juan Antonio Álvarez de Arenales
• 1813-1814 - Martín de Jáuregui
• 1814-1815 - Antonio de Goyburo
• 1815-1816 - Juan Antonio Álvarez de Arenales
• 1816-1817 Tribunal Militar o de Purificación
• 1817-1823 José de Mendizábal e Ymas
• 1823-1824 - José Miguel de Velasco
• 1824-1825 - Martín Ruiz de Somocurcio
• 1825 Pedro Antonio de Assúa
• 1825 - Mariano Guzmán

• 1825 - Gral. Don Joseph Maria Plaza
• 1827 - Francisco López de Quiroga
• 1827 - Dr. Don Miguel del Prado
• 1828 - Dr. Juan Crisóstomo Unzueta
• 1828 - Crnl. Agustín Geraldino
• 1829 - Miguel de Soria y Galvarro
• 1830 - Miguel María Aguirre.
• 1830 - Don. Antonio Escudero
• 1832 - Don Anselmo Rivas

• 1832 - Crnl. José Manuel de Castillo
• 1832-1833 - Miguel María Aguirre
• 1832 - Don Ancelmo Rivas

• 1832 - Pedro José de Zambrana
• 1832 - Don José Manuel de Castillo
• 1833 - Dr. Don Manuel de La Vía
• 1833 - Dr. Miguel María de Aguirre
• 1834 - Dr. Don Manuel de La Vía
• 1835 - Don Manuel Sánchez de Velasco
• 1836 - Don Juan Guzmán

• 1837 - Don Diego de la Riva
• 1838 - Don Joaquín Lemoine

• 1839 - Toribio Cano

• 1840 - Don José Bentura Antezana
• 1841 - Justo Gandarillas

• 1842 - Don Domingo Flor

• 1842 - Don Rafael de la Borda
• 1842 - José Fernández de Córdova
• 1843 - José María Silva

• 1843 - Don José María Calvimontes
• 1843 - Crnl. Don Cleto Marcelino Galdo
• 1843 - Manuel Ylario Yrigoyen
• 1844 - José María Silva

• 1845 - Rafael de la Borda

• 1845 - Crnl. José de Ugarte
• 1846 - Don Pedro Roberto Chirbeches
• 1846 - Manuel García Meza

• 1846 - Don José de Ugarte

• 1847 - Don Manuel García Meza
• 1847 - Crnl. León Galindo

• 1847 - Don José de Ugarte

• 1847 - José Manuel Cosio

• 1848 - Don Juan Manuel Antezana
• 1848 - Don Pedro Achabal

• 1848 - Cleto Marcelino Galdo
• 1848 - Juan Zilbeti

• 1848 - Don Mario Oroso

• 1848 - José Pedro Zambrana de Viedma
• 1848 - Crnl. Gonzalo Lanza

• 1848 - Dr. Mariano Domingo de Paz Soldán
• 1848 - Crnl. Manuel Sainz de Antezana
• 1848 - Don José de Ugarte

• 1849 - Don Francisco de Paula Belzu
• 1849 - José María Clavijo

• 1849 - Juan José Clavijo

• 1849 - Crnl. Pedro Álvarez Condarco
• 1849 - Crnl. José Fernando Antezana
• 1850 - Don José María Clavijo
• 1850 - Crnl. Agustín Geraldino
• 1850 - Crnl. Pedro Álvarez Condarco
• 1850 - Juan Crisóstomo Unzueta
• 1850 - Joaquín Balderrama

• 1851 - Isidoro Valencia

• 1851 - Juan Crisóstomo Unzueta

• 1851 - Don Narciso Yrigoyen

• 1852 - Crnl. Gonzalo Lanza

• 1852 - Romualdo Villamil

• 1853 - Mariano Donato Muñoz
• 1854 - Atanasio Hernández

• 1855 - Carlos Zacarías
• 1985 a 1989 Cnl. Germán Lema Araoz, quien fue también Presidente del primer gobierno departamental de Cochabamba.

1993 a 1995 Cnl. Germán Lema Araoz.

• 2006-2008 - Manfred Armando Antonio Reyes Villa Bacigalupi
• 2008 - Rafael Puente Calvo
• 2008-2010 - Jorge Ledezma Cornejo

• Departamento de Cochabamba
• Gobernadores del Beni
• Gobernadores de Chuquisaca
• Gobernadores de La Paz
• Gobernadores de Oruro
• Gobernadores de Pando
• Gobernadores de Potosí
• Gobernadores de Santa Cruz
• Gobernadores de Tarija

1. ↑ «DECRETO SUPREMO del 23 de Enero de 1826 – 1 » Derechoteca.com». www.derechoteca.com. Consultado el 1 de abril de 2021. 
2. ↑ «Ley N° 026». Cámara de Diputados. 23 de agosto de 2017. Consultado el 1 de abril de 2021.