En negritas finales ganadas.

• La final se define por diferencia de goles en partidos de ida y vuelta. El equipo con más goles es campeón.
• Si hay empate en diferencia de goles tras los 180 minutos, la final se define por tiros penales.

Barcelona de Guayaquil^[4]​ logró su clasificación a la Copa por 13.ª vez tras coronarse en el Campeonato Ecuatoriano de 1989. En la fase de grupos, compartió zona con Emelec, The Strongest y Oriente Petrolero. A pesar de una campaña algo equilibrada, con dos victorias, dos empates y dos derrotas, como todos los equipos finalizaron en 6 puntos, Barcelona se enfrentó a Oriente Petrolero en un desempate para avanzar a octavos de final, en dicha serie el conjunto ecuatoriano resultó ganador tras una serie de penales luego de un empate en puntos.

En octavos de final, Barcelona se enfrentó a Progreso; en la ida, logró una victoria cómoda por 2-0 en casa, y aunque empató 2-2 en la vuelta, el global de 4-2 le permitió avanzar a la siguiente fase. En cuartos de final, el rival fue Emelec, en un clásico ecuatoriano; en la ida, empataron 0-0, pero en la vuelta, Barcelona consiguió una ajustada victoria por 1-0.

En semifinales, Barcelona enfrentó a River Plate. En el primer partido, cayó 1-0 en Buenos Aires, y en la vuelta en Guayaquil su triunfo por el mismo resultado llevó la serie a los penales en los que Barcelona se impuso 4-3, avanzando a la gran final por primera vez.

Olimpia^[5]​, por su parte, también clasificó a la Copa Libertadores como el campeón de su país en 1989, esta fue su 32.ª coronación de la Primera División de Paraguay. En la Primera Fase compartió la zona con Cerro Porteño, Grêmio y Vasco da Gama.

En esta fase, el equipo paraguayo mostró una sólida actuación con tres victorias, un empate y dos derrotas, acumulando 7 puntos y avanzando como líder del grupo. Sus victorias clave fueron ante Cerro Porteño (2-1), Grêmio (1-0) y Vasco da Gama (1-0), todas de local.

Al clasificar primero en el grupo, Olimpia tenía la ventaja de enfrentarse al tercer clasificado del Grupo 2, pero debido a la no participación de los clubes colombianos, el lugar de ese tercer clasificado quedó desierto, lo que permitió que Olimpia avanzara directamente a los cuartos de final. En cuartos de final, Olimpia se enfrentó a Universidad Católica. En la ida, Olimpia ganó 2-0 en casa, y aunque en la vuelta en Santiago el marcador terminó 4-4, el global de 6-4 le permitió avanzar a semifinales.

En semifinales, Olimpia jugó contra Atlético Nacional, rival al que enfrentó en la final del año anterior. Después de ganar 1-2 en la ida en Santiago de Chile y caer 2-3 en la vuelta jugando de local, el marcador global terminó 4-4, y el equipo paraguayo superó a los colombianos en una tanda de penales, ganando 2-1.

1. ↑ «Copa Libertadores 1990». www.rsssf.org. Consultado el 3 de febrero de 2025. 
2. ↑ «La Nación / Estadio de los Defensores del Chaco: La historia de un símbolo del país». cdn-www.lanacionpy.arcpublishing.com. Consultado el 16 de julio de 2025. 
3. ↑ «La historia y cámbios del Estadio Monumental Banco Pichincha». estadiohistoria.com. Consultado el 16 de julio de 2025. 
4. ↑ Sinchire, Alexis (28 de abril de 2024). «Barcelona SC 1990, un ‘equipazo’ sin corona». El Comercio. Consultado el 11 de junio de 2025. 
5. ↑ Pérez, Christian (10 de octubre de 2019). «Versus / A casi 3 décadas de la 2ª Copa Libertadores de Olimpia». Versus. Consultado el 11 de junio de 2025. 
6. ↑ Al clasificar primero en el Grupo 5, Olimpia debió haber enfrentado al tercero del Grupo 2, lugar que quedó desierto debido a la no participación de los clubes colombianos. Al no asignársele rival, el equipo paraguayo quedó libre y accedió directamente a los cuartos de final.