En los cuartos de final de la Liga Europa de la UEFA 2024-25 participaron los ocho equipos vencedores de la fase anterior. Se distribuyeron en cuatro parejas. Cada pareja se enfrentó en partidos de ida y vuelta de 90 minutos cada uno. En estos encuentros no se aplico la regla del gol visitante. En caso de que no hubiese ganador en el tiempo regular, se disputó una prórroga de dos tiempos de 15 minutos y, de persistir el empate, se procedió a la tanda de penaltis para decidir al ganador.

El sorteo para definir los emparejamientos se celebró el 21 de febrero de 2025 a las 13:00 horas (UTC+1) en Nyon (Suiza) junto al sorteo de los octavos de final.^[1]​