En los Cuartos de final de la Copa Colombia 2014, participaron ocho equipos que avanzaron de los emparejamientos en la fase anterior. Estos fueron distribuidos en cuatro parejas de acuerdo con unos emparejamientos establecidos de manera anticipada mediante el reglamento. Cada pareja se enfrentó en partidos de ida y vuelta de 90 minutos cada uno. En estos encuentros no rigió la regla del gol de visitante. En caso de que no hubiese habido ganador en el período regular, se hubiese realizado tiros desde el punto penal.

Junior de Barranquilla	Valledupar F. C.
7	4
Clasificado

1 de octubre de 2014, 15:00	Valledupar F. C.	2:3 (0:3)	Junior	Estadio Armando Maestre, Valledupar
	Santos  52'  65' (pen.)	Reporte	Mena  21'  35' Barrera  26'	Árbitro: Oscar Gómez

8 de octubre de 2014, 18:30	Junior	4:2 (2:2)	Valledupar F. C.	Estadio Metropolitano, Barranquilla
	Jiménez  3' (aut.) Aguirre  46'  75'  89'	Reporte	Bolaños  25' Santos  44' (pen.)	Árbitro: Weimar Hernández

Santa Fe	Deportes Quindío
4	2
Clasificado

2 de octubre de 2014, 19:30	Deportes Quindío	0:2 (0:1)	Santa Fe	Estadio Centenario, Armenia
		Reporte	Mosquera  18' Morelo  74'	Árbitro: Leevan Suárez

8 de octubre de 2014, 19:45	Santa Fe	2:2 (2:1)	Deportes Quindío	Estadio El Campín, Bogotá
	Arias  14' Rangel  40'	Reporte	Galeano  24' Viveros  92'	Árbitro: Fernando Camargo

Deportes Tolima	Atlético Nacional
4	2
Clasificado

2 de octubre de 2014, 19:45	Atlético Nacional	2:2 (1:0)	Deportes Tolima	Estadio Atanasio Girardot, Medellín
	Cárdenas  26' Páez  76'	Reporte	Quiñones  50' Acuña  55'	Árbitro: Ervin Otero

8 de octubre de 2014, 19:45	Deportes Tolima	2:0 (1:0)	Atlético Nacional	Estadio Manuel Murillo Toro, Ibagué
	Bonilla  39' (pen.) Ibargüen  78'	Reporte		Árbitro: Carlos Anaya

Once Caldas	Patriotas
3	6
	Clasificado

1 de octubre de 2014, 19:00	Patriotas	2:2 (1:1)	Once Caldas	Estadio La Independencia, Tunja
	Lazaga  17'  60'	Reporte	Palomeque  6' (pen.) Subero  58' (a.g.)	Árbitro: Luis Fernando Trujillo

8 de octubre de 2014, 19:00	Once Caldas	1:4 (1:2)	Patriotas	Estadio Palogrande, Manizales
	Bonjour  31'	Reporte	Rentería  33' Subero  44'  60' Martínez  88' (pen.)	Árbitro: Carlos Betancourt