En Pasto existen 75 colegios según registro en el Instituto Colombiano para el Fomento de la Educación Superior (ICFES), 23 de los cuales fueron calificados por este organismo en el 2010 en las categorías superior o muy superior, de acuerdo con puntajes en la pruebas de conocimientos a los alumnos, y son los siguientes (por orden alfabético):^[1]​

1. Colegio Campestre los Libertadores- Superior
2. Colegio Comfamiliar de Nariño siglo XXI- Superior
3. Colegio San Francisco Javier (Pasto)- Muy Superior
4. Colegio del Sagrado Corazón de Jesús- Muy Superior
5. Colegio Filipense Nuestra Señora de la Esperanza- Muy Superior
6. Colegio Insuca- Superior
7. Colegio la Inmaculada- Superior
8. Institución Educativa Municipal María Goretti- Superior
9. Colegio Municipal Chambú- Superior
10. Colegio Musical Británico- Superior
11. Colegio San Felipe Neri- Superior
12. Gimnasio Los Andes- Superior
13. Institución Educativa Municipal Ciudad de Pasto- Muy Superior
14. Institución Educativa Municipal Antonio Nariño- Superior
15. Institución Educativa Municipal La Rosa- Superior
16. Institución Educativa Municipal Libertad- Superior
17. Institución Educativa Municipal Mariano Ospina Rodríguez- Superior
18. Institución Educativa Municipal Técnico Industrial- Superior
19. Instituto Champagnat- Muy Superior
20. Instituto San Francisco de Asís- Superior
21. Liceo de la Merced Maridíaz- Superior
22. Liceo de la Universidad de Nariño- Muy Superior