Orden: Gymnophiona. Familia: Dermophiidae

• Dermophis mexicanus (Duméril y Bibron, 1841)
• Gymnopis multiplicata Peters, 1874
• Gymnopis syntrema (Cope, 1866)

Orden: Caudata. Familia: Plethodontidae

• Bolitoglossa carri McCranie y Wilson, 1993
• Bolitoglossa cataguana Townsend, Butler, Wilson, y Austin, 2009
• Bolitoglossa celaque McCranie y Wilson, 1993
• Bolitoglossa conanti McCranie y Wilson, 1993
• Bolitoglossa decora McCranie y Wilson, 1997
• Bolitoglossa diaphora McCranie y Wilson, 1995
• Bolitoglossa dofleini (Werner, 1903)
• Bolitoglossa dunni (Schmidt, 1933)
• Bolitoglossa heiroreias Greenbaum, 2004
• Bolitoglossa longissima McCranie y Cruz-Díaz, 1996
• Bolitoglossa mexicana Duméril, Bibron, y Duméril, 1854
• Bolitoglossa nympha Campbell, Smith, Streicher, Acevedo, y Brodie, 2010
• Bolitoglossa occidentalis Taylor, 1941
• Bolitoglossa odonnelli (Stuart, 1943)
• Bolitoglossa oresbia McCranie, Espinal, y Wilson, 2005
• Bolitoglossa porrasorum McCranie y Wilson, 1995
• Bolitoglossa rufescens (Cope, 1869)
• Bolitoglossa striatula (Noble, 1918)
• Bolitoglossa synoria McCranie y Köhler, 1999
• Cryptotriton nasalis (Dunn, 1924)
• Dendrotriton sanctibarbarus (McCranie y Wilson, 1997)
• Nototriton barbouri (Schmidt, 1936)
• Nototriton brodiei Campbell y Smith, 1998
• Nototriton lignicola McCranie y Wilson, 1997
• Nototriton limnospectator McCranie, Wilson, y Polisar, 1998
• Nototriton mime Townsend, Medina-Flores, Reyes-Calderón, y Austin, 2013
• Nototriton picucha Townsend, Medina-Flores, Murillo, y Austin, 2011
• Nototriton tomamorum Townsend, Butler, Wilson, y Austin, 2010
• Oedipina chortiorum Brodie, Acevedo, y Campbell, 2012
• Oedipina cyclocauda Taylor, 1952
• Oedipina elongata (Schmidt, 1936)
• Oedipina gephyra McCranie, Wilson, y Williams, 1993
• Oedipina ignea Stuart, 1952
• Oedipina kasios McCranie, Vieites, y Wake, 2008
• Oedipina leptopoda McCranie, Vieites, y Wake, 2008
• Oedipina petiola McCranie y Townsend, 2011
• Oedipina quadra McCranie, Vieites, y Wake, 2008
• Oedipina stenopodia Brodie y Campbell, 1993
• Oedipina stuarti Brame, 1968
• Oedipina taylori Stuart, 1952
• Oedipina tomasi McCranie, 2006

Orden: Anura. Familia: Rhinophrynidae

• Rhinophrynus dorsalis Duméril y Bibron, 1841

Orden: Anura. Familia: Craugastoridae

• Pristimantis cerasinus (Cope, 1875)
• Pristimantis ridens (Cope, 1866)
• Craugastor anciano (Savage, McCranie, y Wilson, 1988)
• Craugastor aurilegulus (Savage, McCranie, y Wilson, 1988)
• Craugastor bransfordii (Cope, 1886)
• Craugastor chac (Savage, 1987)
• Craugastor charadra (Campbell y Savage, 2000)
• Craugastor chrysozetetes (McCranie, Savage, y Wilson, 1989)
• Craugastor coffeus (McCranie y Köhler, 1999)
• Craugastor cruzi (McCranie, Savage, y Wilson, 1989)
• Craugastor cyanochthebius McCranie y Smith, 2006
• Craugastor emleni (Dunn y Emlen, 1932)
• Craugastor epochthidius (McCranie y Wilson, 1997)
• Craugastor fecundus (McCranie y Wilson, 1997)
• Craugastor fitzingeri (Schmidt, 1857)
• Craugastor laevissimus (Werner, 1896)
• Craugastor laticeps (Duméril, 1853)
• Craugastor lauraster (Savage, McCranie, y Espinal, 1996)
• Craugastor loki (Shannon y Werler, 1955)
• Craugastor megacephalus (Cope, 1875)
• Craugastor merendonensis (Schmidt, 1933)
• Craugastor milesi (Schmidt, 1933)
• Craugastor mimus (Taylor, 1955)
• Craugastor nefrens (Smith, 2005)
• Craugastor noblei (Barbour y Dunn, 1921)
• Craugastor olanchano (McCranie y Wilson, 1999)
• Craugastor omoaensis (McCranie y Wilson, 1997)
• Craugastor pechorum (McCranie y Wilson, 1999)
• Craugastor psephosypharus (Campbell, Savage, y Meyer, 1994)
• Craugastor rostralis (Werner, 1896)
• Craugastor rupinius (Campbell y Savage, 2000)
• Craugastor saltuarius (McCranie y Wilson, 1997)
• Craugastor stadelmani (Schmidt, 1936)

Orden: Anura. Familia: Leptodactylidae

• Engystomops pustulosus (Cope, 1864)
• Leptodactylus fragilis (Brocchi, 1877)
• Leptodactylus melanonotus (Hallowell, 1861)
• Leptodactylus savagei Heyer, 2005
• Leptodactylus silvanimbus McCranie, Wilson, y Porras, 1980

Orden: Anura. Familia: Eleutherodactylidae

• Diasporus diastema (Cope, 1875)
• Eleutherodactylus planirostris (Cope, 1862)

Orden: Anura. Familia: Bufonidae

• Incilius campbelli (Mendelson, 1994)
• Incilius coccifer (Cope, 1866)
• Incilius ibarrai (Stuart, 1954)
• Incilius leucomyos (McCranie y Wilson, 2000)
• Incilius luetkenii (Boulenger, 1891)
• Incilius porteri (Mendelson, Williams, Sheil, y Mulcahy, 2005)
• Incilius valliceps (Wiegmann, 1833)
• Rhaebo haematiticus Cope, 1862
• Rhinella chrysophora (McCranie, Wilson, y Williams, 1989)
• Rhinella marina (Linnaeus, 1758)

Orden: Anura. Familia: Hylidae

• Agalychnis callidryas (Cope, 1862)
• Agalychnis moreletii (Duméril, 1853)
• Agalychnis saltator Taylor, 1955
• Cruziohyla calcarifer (Boulenger, 1902)
• Anotheca spinosa (Steindachner, 1864)
• Bromeliohyla bromeliacia (Schmidt, 1933)
• Dendropsophus ebraccatus (Cope, 1874)
• Dendropsophus microcephalus (Cope, 1886)
• Duellmanohyla salvavida (McCranie y Wilson, 1986)
• Duellmanohyla soralia (Wilson y McCranie, 1985)
• Ecnomiohyla miliaria (Cope, 1886)
• Ecnomiohyla salvaje (Wilson, McCranie, y Williams, 1985)
• Exerodonta catracha (Porras y Wilson, 1987)
• Isthmohyla insolita (McCranie, Wilson, y Williams, 1993)
• Isthmohyla melacaena (McCranie y Castañeda, 2006)
• Plectrohyla chrysopleura Wilson, McCranie, y Cruz-Díaz, 1994
• Plectrohyla dasypus McCranie y Wilson, 1981
• Plectrohyla exquisita McCranie y Wilson, 1998
• Plectrohyla guatemalensis Brocchi, 1877
• Plectrohyla hartwegi Duellman, 1968
• Plectrohyla matudai Hartweg, 1941
• Plectrohyla psiloderma McCranie y Wilson, 1999
• Ptychohyla euthysanota (Kellogg, 1928)
• Ptychohyla hypomykter McCranie y Wilson, 1993
• Ptychohyla salvadorensis (Mertens, 1952)
• Ptychohyla spinipollex (Schmidt, 1936)
• Scinax staufferi (Cope, 1865)
• Smilisca baudinii (Duméril y Bibron, 1841)
• Smilisca phaeota (Cope, 1862)
• Smilisca sordida (Peters, 1863)
• Tlalocohyla loquax (Gaige y Stuart, 1934)
• Tlalocohyla picta (Günther, 1901)
• Trachycephalus typhonius (Linnaeus, 1758)
• Triprion petasatus (Cope, 1865)

Orden: Anura. Familia: Centrolenidae

• Cochranella granulosa (Taylor, 1949)
• Espadarana prosoblepon (Boettger, 1892)
• Sachatamia albomaculata (Taylor, 1949)
• Teratohyla pulverata (Peters, 1873)
• Teratohyla spinosa (Taylor, 1949)
• Hyalinobatrachium chirripoi (Taylor, 1958)
• Hyalinobatrachium fleischmanni (Boettger, 1893)

Orden: Anura. Familia: Microhylidae

• Gastrophryne elegans (Boulenger, 1882)
• Hypopachus barberi Schmidt, 1939
• Hypopachus variolosus (Cope, 1866)

Orden: Anura. Familia: Ranidae

• Lithobates brownorum (Sanders, 1973)
• Lithobates forreri (Boulenger, 1883)
• Lithobates maculatus (Brocchi, 1877)
• Lithobates vaillanti (Brocchi, 1877)
• Lithobates warszewitschii (Schmidt, 1857)

• Anexo:Aves de Honduras
• Anexo:Reptiles de Honduras

• Frost, D.R (2014). «Honduras». Amphibian Species of the World: an Online Reference. Version 6.0. American Museum of Natural History. Nueva York, EEUU (en inglés). Consultado el 27 de marzo de 2015.