El origen de Electra de Viesgo se encuentra en la Sociedad General de Centrales Eléctricas, que a principios del siglo XX era la encargada del suministro de energía en Santander. Esta compañía fue adquirida en 1905 por Calixto Fernández García, quien junto con Fernando Villaamil Iglesias y Luis Castillo Gogorza, fundó el 13 de julio de 1906 en Bilbao la Sociedad Anónima “Electra de Viesgo”, con un capital de 1.000.000 de pesetas.^[2]​

Su primera adquisición fue, en 1910, el salto de Bárcena, sobre el río Besaya, que era propiedad de Electra de Besaya, para la producción hidroeléctrica.^[3]​

A partir de 1910, la empresa se afianza con la compra de varias instalaciones hidroeléctricas en Cantabria, como los saltos de Urdón y de Torina. También adquiere la central térmica de Astillero, su primera gran central.^[2]​

En los años 1920 se produce su entrada en Asturias, con la adquisición de la sociedad Energía Eléctrica de Asturias, pasando a tener el dominio también del mercado asturiano.^[4]​ Allí explota los saltos hidráulicos de Camarmeña, sobre el Cares, Doiras en Boal, San Isidro en Felechosa y La Paraya sobre el río Aller.

La guerra civil española supuso un importante golpe económico para la empresa, pues varias de sus presas fueron dinamitadas durante el conflicto.^[2]​ En los años 1950 prosigue su periplo de obras hidráulicas, con los saltos de Arenas de Cabrales y Silvón, en Asturias.

En 1945 absorbe Electra Pasiega, que poseía varios saltos de agua en los valles centrales de Cantabria.^[5]​ Ya en 1957, en consorcio con Hidroeléctrica del Cantábrico y Eléctrica de Langreo, comienza la construcción de la central térmica de Soto de Ribera, en Ribera de Arriba, que es conectada a la red en 1962.^[6]​ La experiencia resulta positiva y en 1958 constituye con Iberduero la sociedad Terminor S. A. para la construcción y explotación conjunta de la central térmica de Velilla, en Velilla del Río Carrión, finalizada en 1964.^[6]​

Su incursión en la energía nuclear se produjo en 1957, mediante la fundación -también con Iberduero- de Nuclenor, para la explotación conjunta de la central nuclear de Garoña, que comienza su actividad en 1971. Su campo de acción abarcaba ya las comunidades de Cantabria, Asturias, Galicia y Castilla y León.^[7]​ Para 1975, su producción de energía es ya de 3.996 GWh.^[2]​

En abril de 1973 se anunció que Electra de Viesgo iba a construir la central nuclear de Santillán, de cuatro unidades y una potencia de cuatro millones de kilovatios, cuyo coste inicial se calculó en 80.000 millones de pesetas.^[8]​ La empresa adquirió 71,6 hectáreas de terreno, en una franja costera que abarca superficie de los municipios de San Vicente de la Barquera y Val de San Vicente, junto a la ensenada de la playa de La Fuente; sobre los acantilados de Santillán-Boria se construyó una zanja para realizar los sondeos previos para la construcción de la central nuclear en este terreno.^[9]​ Se programó que comenzara a exportar energía en 1982, con una potencia de 970 megavatios.^[10]​ Finalmente, debido a la oposición política y social, tanto de cántabros como de asturianos, la empresa eléctrica abandonó el proyecto de forma provisional.^[11]​

En 1983, se produce la entrada en servicio del salto de Aguayo, y ese mismo año, el Banco de Santander entra en el negocio de las energías y adquiere Electra de Viesgo, que en 1991 pasa a formar parte de Endesa, quien a su vez la vende, en 2002, a la italiana Enel, pasando a denominarse desde el 8 de enero Enel-Viesgo, que supera los 600.000 contratos de suministro. En 2006, la empresa celebra su centenario.

El 26 de junio de 2008, E.ON adquirió la compañía Enel-Viesgo, y las centrales térmicas de Los Barrios y Tarragona, creando E.ON España como unidad de mercado e incrementando su presencia en el mercado español, en el que cuenta con 650.000 clientes.^[12]​

En 2015 E.ON España fue adquirida por los fondos Macquarie European Infrastructure Fund y Wren House Infrastructure, y volvió a recuperar la denominación de Viesgo.^[13]​ En junio, Viesgo compró a Gas Natural Fenosa su 45% de la distribuidora Begasa por 97,2 millones.^[14]​

En 2017 se publicó un estudio donde se indicaba que Viesgo era, junto a las principales empresas energéticas, cementeras y siderúrgicas de España, la octava empresa que emitía más toneladas de CO2 equivalente en el país.^[15]​

El 27 de junio de 2018 Repsol anunció la compra por 750 millones de euros de parte de los activos de Viesgo que incluían el área de comercialización, las centrales de ciclo combinado y la división de energía hidráulica. Quedaron excluidas de la operación las centrales de carbón.^[16]​

En 2020, Macquaire se convirtió en el único accionista de Viesgo tras comprar el 40% de la compañía a su socio kuwaití Wren House Infraestructures.

En julio de 2020, se anunció que el grupo energético portugués EDP compraba a Macquaire el 75,1% de los activos de Viesgo por 2.700 millones de euros. Esta operación duplicaba el tamaño de EDP en España.^[17]​ Con este cambio accionarial Macquarie mantenía un 24,9% de la sociedad.

Viesgo dispone de 2 centrales hidráulicas y 24 parques eólicos en la península ibérica, de los cuales 20 están en España y 4 en Portugal. Todos ellos cuentan con la norma internacional ISO 14001 de Gestión Medioambiental. Tras recuperar su denominación original, y el anuncio de cierre de las centrales térmicas de carbón en España, los activos controlados por la empresa son:

Parques eólicos (España)

• PE Ascoy (Murcia, España)
• PE Bodenaya (Asturias, España)
• PE Boquerón (Zaragoza, España)
• PE Borja I (Zaragoza, España)
• PE Borja II (Zaragoza, España)
• PE Carcelén (Albacete, España)
• PE Hiperión II (Soria, España)
• PE La Victoria (Cádiz, España)
• PE Mallén (Zaragoza, España)
• PE Matabuey (Salamanca, España)
• PE Mingorrubio (Albacete, España)
• PE Páramo de Poza (Burgos, España)
• PE Paxareiras (La Coruña, España)
• PE Pico Gallo (Asturias, España)
• PE Planas de Pola (Zaragoza, España)
• PE Remolinos (Zaragoza, España)
• PE San Juan de Bargas (Zaragoza, España)
• PE Santo Cristo de Magallón (Zaragoza, España)
• PE Sierra de Tineo (Asturias, España)

Parques Eólicos (Portugal)

• PE Alto Folgorosa (Lisboa)
• PE Barão de São João (Algarve)
• PE Espinhaço de Cão (Algarve)
• PE Joguinho (Lisboa)

Centrales hidráulicas

• Central Minihidráulica de Crisa.
• Central hidráulica de Guadalimar.

Centrales térmicas

• Central térmica de Los Barrios (Algeciras, España).
• Central térmica Puente Nuevo (Espiel, España). Desmantelada.

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